Platform: NovaSeq platform, PE150
Uri ng library: 200-400bp insert bisulfite treated DNA library
Diskarte sa sequencing: Paired-End 150 bp
Magrekomenda ng output ng data: 10 Gb raw data/sample
Dami ng DNA: ≥ 2ug
Konsentrasyon ng DNA: ≥ 20ng/μl.
Purity: OD260/280 = 1.8 hanggang 2.0 nang walang degradation o RNA contamination
a.Reference genome alignment statistics
Mga istatistika ng pagbabasa ng pagmamapa
Statistics ng sequencing depth at coverage ng C site
Anaipon na saklaw
Dkahusayan ng pagtunaw ng bawat sample
b.Pagtuklas ng site ng methylation
Listahan ng mga antas ng methylation sa C site
BS conversion
Pamamahagi ng antas ng methylation
c.Mapa ng methylation
Gelementong enome
d.Paghahambing ng mga antas ng methylation sa pagitan ng mga sample
Pairwise Correlation ng CG methylation
d.Differentially methylation analysis
Smga istatistika ng DMR