-
Single-nucleus RNA Sequencing
Ang advance sa single cell capturing at individual library construction technique na pinagsama sa high-throughput sequencing ay nagbibigay-daan sa pag-aaral ng gene expression sa cell-by-cell na batayan.Nagbibigay-daan ito ng mas malalim at kumpletong pagsusuri ng system sa mga kumplikadong populasyon ng cell, kung saan higit nitong iniiwasan ang pag-mask ng kanilang heterogeneity sa pamamagitan ng pagkuha ng average ng lahat ng mga cell.
Gayunpaman, ang ilang mga cell ay hindi angkop na gawin sa single-cell suspension, kaya iba pang mga sample na paraan ng paghahanda - ang nucleus extraction mula sa mga tissue ay kailangan, iyon ay, ang nucleus ay direktang kinuha mula sa mga tissue o cell at inihanda sa single-nucleus suspension para sa single- pagkakasunud-sunod ng cell.
Nagbibigay ang BMK ng 10× Genomics ChromiumTM based na single-cell RNA sequencing service.Ang serbisyong ito ay malawakang ginagamit sa mga pag-aaral sa mga pag-aaral na may kaugnayan sa sakit, tulad ng immune cell differentiation, tumor heterogeneity, tissue development, atbp.
Spatial transcriptome chip: 10× Genomics
Platform: Plataporma ng Illumina NovaSeq
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Ang spatial transcriptomics ay nangunguna sa makabagong siyentipiko, na nagbibigay ng kapangyarihan sa mga mananaliksik na suriin ang masalimuot na mga pattern ng pagpapahayag ng gene sa loob ng mga tisyu habang pinapanatili ang kanilang spatial na konteksto.Sa gitna ng iba't ibang platform, binuo ng BMKGene ang BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, na ipinagmamalaki ang isangpinahusay na resolutionng 5µM, na umaabot sa subcellular range, at nagpapaganamga setting ng multi-level na resolution.Ang S1000 chip, na nagtatampok ng humigit-kumulang 2 milyong mga spot, ay gumagamit ng mga microwell na pinahiran ng mga kuwintas na puno ng mga spatially barcoded capture probe.Ang isang library ng cDNA, na pinayaman ng mga spatial na barcode, ay inihanda mula sa S1000 chip at pagkatapos ay pinagsunod-sunod sa platform ng Illumina NovaSeq.Tinitiyak ng kumbinasyon ng mga spatially barcoded sample at UMI ang katumpakan at pagiging tiyak ng data na nabuo.Ang natatanging katangian ng BMKManu S1000 chip ay nakasalalay sa versatility nito, na nag-aalok ng mga multi-level na setting ng resolution na maaaring maayos na ibagay sa iba't ibang mga tissue at antas ng detalye.Ang kakayahang umangkop na ito ay nagpoposisyon sa chip bilang isang natatanging pagpipilian para sa magkakaibang pag-aaral ng spatial transcriptomics, na tinitiyak ang tumpak na spatial clustering na may kaunting ingay.
Gamit ang BMKManu S1000 chip at iba pang mga spatial transcriptomics na teknolohiya, ang mga mananaliksik ay makakakuha ng mas mahusay na pag-unawa sa spatial na organisasyon ng mga cell at sa mga kumplikadong molekular na pakikipag-ugnayan na nagaganap sa loob ng mga tisyu, na nagbibigay ng napakahalagang mga insight sa mga mekanismong pinagbabatayan ng mga biological na proseso sa isang malawak na hanay ng mga larangan, kabilang ang oncology, neuroscience, developmental biology, immunology at botanical studies.
Platform: BMKManu S1000 chip at Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Ang spatial transcriptomics ay isang makabagong teknolohiya na nagbibigay-daan sa mga mananaliksik na magsiyasat ng mga pattern ng pagpapahayag ng gene sa loob ng mga tisyu habang pinapanatili ang kanilang spatial na konteksto.Ang isang malakas na platform sa domain na ito ay ang 10x Genomics Visium kasama ng pagkakasunud-sunod ng Illumina.Ang prinsipyo ng 10X Visium ay nakasalalay sa isang espesyal na chip na may itinalagang lugar ng pagkuha kung saan inilalagay ang mga seksyon ng tissue.Ang lugar ng pagkuha na ito ay naglalaman ng mga barcoded spot, bawat isa ay tumutugma sa isang natatanging spatial na lokasyon sa loob ng tissue.Ang mga nakuhang molekula ng RNA mula sa tissue ay nilalagyan ng mga natatanging molecular identifier (UMIs) sa panahon ng reverse transcription process.Ang mga barcoded spot at UMI na ito ay nagbibigay-daan sa tumpak na spatial mapping at quantification ng gene expression sa isang solong-cell na resolution.Tinitiyak ng kumbinasyon ng mga spatially barcoded sample at UMI ang katumpakan at pagiging tiyak ng data na nabuo.Sa pamamagitan ng paggamit ng teknolohiyang ito ng Spatial Transcriptomics, ang mga mananaliksik ay makakakuha ng mas malalim na pag-unawa sa spatial na organisasyon ng mga cell at ang mga kumplikadong molekular na interaksyon na nagaganap sa loob ng mga tisyu, na nag-aalok ng napakahalagang mga insight sa mga mekanismong pinagbabatayan ng mga biological na proseso sa maraming larangan, kabilang ang oncology, neuroscience, developmental biology, immunology , at botanikal na pag-aaral.
Platform: 10X Genomics Visium at Illumina NovaSeq
