-
BSA
Binubuo ang Bulked Segregant Analysis na platform ng isang hakbang na karaniwang pagsusuri at advanced na pagsusuri na may naka-customize na setting ng parameter.Ang BSA ay isang pamamaraan na ginagamit upang mabilis na matukoy ang phenotype na nauugnay na mga genetic marker.Ang pangunahing daloy ng trabaho ng BSA ay naglalaman ng: 1. pagpili ng dalawang grupo ng mga indibidwal na may lubhang magkasalungat na mga phenotype;2. pagsasama-sama ng DNA, RNA o SLAF-seq(Binuo ng Biomarker) ng lahat ng indibidwal upang bumuo ng dalawang bulk ng DNA;3. pagtukoy ng pagkakaiba-iba ng pagkakasunud-sunod laban sa sangguniang genome o sa pagitan, 4. paghula sa mga rehiyong nauugnay sa kandidato sa pamamagitan ng ED at SNP-index algorithm;5. Functional analysis at enrichment sa mga gene sa mga kandidatong rehiyon, atbp. Available din ang mas advanced na pagmimina sa data kabilang ang genetic marker screening at primer na disenyo.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Ang platform ng Amplicon (16S/18S/ITS) ay binuo na may mga taon ng karanasan sa pagtatasa ng proyekto ng microbial diversity, na naglalaman ng standardized basic analysis at personalized analysis: sinasaklaw ng basic analysis ang mainstream analysis content ng kasalukuyang microbial research, ang analysis content ay mayaman at komprehensibo, at ang mga resulta ng pagsusuri ay ipinakita sa anyo ng mga ulat ng proyekto;Ang nilalaman ng personalized na pagsusuri ay magkakaiba.Maaaring pumili ng mga sample at ang mga parameter ay maaaring itakda nang may kakayahang umangkop ayon sa pangunahing ulat ng pagsusuri at layunin ng pananaliksik, upang mapagtanto ang mga personalized na pangangailangan.Windows operating system, simple at mabilis.
-
Evolutionary Genetics
Ang evolutionary genetics ay isang naka-pack na serbisyo sa pagkakasunud-sunod na idinisenyo para sa pagbibigay ng komprehensibong interpretasyon sa ebolusyonaryong impormasyon ng mga ibinigay na materyales batay sa genetic variation, kabilang ang mga SNP, InDels, SV at CNV.Nagbibigay ito ng lahat ng pangunahing pagsusuri na kinakailangan para sa paglalarawan ng mga pagbabago sa ebolusyon at mga genetic na katangian ng mga populasyon, tulad ng istraktura ng populasyon, pagkakaiba-iba ng genetic, mga relasyon sa phylogeny, atbp. Naglalaman din ito ng mga pag-aaral sa daloy ng gene, na nagbibigay ng kapangyarihan sa pagtatantya ng epektibong laki ng populasyon, oras ng pagkakaiba-iba.
-
Comparative Genomics
Ang paghahambing na genomics ay literal na nangangahulugang paghahambing ng kumpletong pagkakasunud-sunod ng genome at istruktura ng iba't ibang species.Ang disiplina na ito ay naglalayong ipakita ang ebolusyon ng mga species, pag-andar ng gene, mekanismo ng regulasyon ng gene sa antas ng genome sa pamamagitan ng pagtukoy sa mga istruktura ng pagkakasunud-sunod at mga elemento na nag-iingat o nag-iba sa iba't ibang species.Kasama sa karaniwang pag-aaral ng comparative genomics ang mga pagsusuri sa gene family, evolutionary development, whole genome duplication, selective pressure, atbp.
-
Evolutionary Genetics
Ang platform ng populasyon at evolutionary genetic analysis ay itinatag batay sa napakalaking karanasan na naipon sa loob ng BMK R&D team sa loob ng maraming taon.Ito ay isang user friendly na tool lalo na para sa mga mananaliksik na hindi majoring sa bioinformatics.Ang platform na ito ay nagbibigay-daan sa basic na evolutionary genetics related basic analysis kabilang ang phylogenetic tree construction, linkage disequilibrium analysis, genetic diversity assessment, selective sweep analysis, kinship analysis, PCA, population structure analysis, atbp.
-
Hi-C based na Genome Assembly
Ang Hi-C ay isang paraan na idinisenyo upang makuha ang configuration ng chromosome sa pamamagitan ng pagsasama-sama ng probing proximity-based na mga interaksyon at high-throughput sequencing.Ang intensity ng mga pakikipag-ugnayan na ito ay pinaniniwalaan na negatibong nauugnay sa pisikal na distansya sa mga chromosome.Samakatuwid, maaaring gabayan ng data ng Hi-C ang clustering, pag-order at pag-orient ng mga pinagsama-samang pagkakasunud-sunod sa isang draft na genome at pag-angkla sa mga iyon sa isang tiyak na bilang ng mga chromosome.Ang teknolohiyang ito ay nagbibigay ng kapangyarihan sa isang chromosome-level genome assembly nang walang genetic map na nakabatay sa populasyon.Ang bawat solong genome ay nangangailangan ng Hi-C.
Platform：Illumina NovaSeq Platform / DNBSEQ
-
Plant/Animal De Novo Genome Sequencing
De NovoAng sequencing ay tumutukoy sa pagbuo ng buong genome ng isang species gamit ang mga teknolohiya ng sequencing, hal. PacBio, Nanopore, NGS, atbp., nang walang reference na genome.Ang kapansin-pansing pagpapabuti sa haba ng pagbasa ng mga teknolohiya sa pagkakasunud-sunod ng ikatlong henerasyon ay nagdulot ng mga bagong pagkakataon sa pag-assemble ng mga kumplikadong genome, tulad ng mga may mataas na heterozygosity, mataas na ratio ng mga paulit-ulit na rehiyon, polyploid, atbp. Sa haba ng pagbasa sa antas ng sampu-sampung kilobases, ang mga sequencing read na ito ay nagbibigay-daan sa paglutas ng mga paulit-ulit na elemento, mga rehiyon na may abnormal na mga nilalaman ng GC at iba pang lubos na kumplikadong mga rehiyon.
Platform： PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/Platform ng Illumina NovaSeq
-
Human Whole Exome Sequencing
Ang buong exome sequencing (WES) ay itinuturing na isang cost-effective na diskarte sa pagkakasunud-sunod para sa pagtukoy ng mga mutasyon na nagdudulot ng sakit.Bagama't ang mga exon ay kumukuha lamang ng humigit-kumulang 1.7% ng buong genome, direktang kinakatawan nito ang profile ng kabuuang mga function ng protina.Sa genome ng tao, naiulat na higit sa 85% ng mga mutasyon na nauugnay sa sakit ay nangyayari sa rehiyon ng coding ng protina.
Nag-aalok ang BMKGENE ng komprehensibo at nababaluktot na mga serbisyo ng buong exome sequencing ng tao na may iba't ibang mga diskarte sa pagkuha ng exon na magagamit upang matugunan ang iba't ibang layunin sa pananaliksik.
Platform: Plataporma ng Illumina NovaSeq
-
Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
Ang high-throughput genotyping, lalo na sa malakihang populasyon, ay isang pangunahing hakbang sa genetic association studies, na nagbibigay ng genetic na batayan para sa functional gene discovery, evolutionary analysis, atbp. Sa halip na malalim na buong genome re-sequencing, binawasan ang representasyon ng genome sequencing (RRGS ) ay ipinakilala upang mabawasan ang gastos sa pagkakasunud-sunod sa bawat sample, habang pinapanatili ang makatwirang kahusayan sa pagtuklas ng genetic marker.Ito ay karaniwang nakakamit sa pamamagitan ng pag-extract ng fragment ng paghihigpit sa loob ng ibinigay na hanay ng laki, na pinangalanang reduced representation library (RRL).Ang specific-locus amplified fragment sequencing (SLAF-Seq) ay isang self-developed na diskarte para sa SNP genotyping na mayroon o walang reference na genome.
Platform: Plataporma ng Illumina NovaSeq -
Illumina at BGI
Ang teknolohiya ng pagkakasunud-sunod ng Illumina, batay sa Sequencing by Synthesis (SBS), ay isang globally embraced NGS innovation, na responsable para sa pagbuo ng higit sa 90% ng data ng sequencing ng mundo.Ang prinsipyo ng SBS ay nagsasangkot ng imaging fluorescently na may label na reversible terminator habang ang bawat dNTP ay idinagdag, at pagkatapos ay pinuputol upang payagan ang pagsasama ng susunod na base.Sa lahat ng apat na reversible terminator-bound dNTPs na naroroon sa bawat sequencing cycle, pinapaliit ng natural na kompetisyon ang bias sa pagsasama.Sinusuportahan ng maraming nalalamang teknolohiyang ito ang parehong single-read at paired-end na mga aklatan, na tumutugon sa isang hanay ng mga genomic na aplikasyon.Ang mataas na throughput na mga kakayahan at katumpakan ng pagkakasunud-sunod ng Illumina ay ipinoposisyon ito bilang isang pundasyon sa pananaliksik ng genomics, na nagbibigay-kapangyarihan sa mga siyentipiko na lutasin ang mga salimuot ng mga genome na may walang kaparis na detalye at kahusayan.
Ang DNBSEQ, na binuo ng BGI, ay isa pang makabagong teknolohiya ng NGS na nakapagpababa pa sa mga gastos sa sequencing at nagpapataas ng throughput.Ang paghahanda ng mga library ng DNBSEQ ay nagsasangkot ng fragmentation ng DNA, paghahanda ng ssDNA at rolling circle amplification upang makuha ang DNA nanoballs (DNB).Ang mga ito ay ikinarga sa isang solidong ibabaw at kasunod na pinagsunod-sunod ng combinatorial Probe-Anchor Synthesis (cPAS).
Ang aming pre-made library sequencing service ay nagpapadali sa mga customer sa paghahanda ng kanilang sequencing na mga library mula sa magkakaibang pinagmulan (mRNA, buong genome, amplicon, bukod sa iba pa).Kasunod nito, ang mga aklatang ito ay maaaring ipadala sa aming mga sequencing center para sa kontrol ng kalidad at pagkakasunud-sunod sa mga platform ng Illumina o BGI.
