-
PacBio-Full-length 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing
Ang platform ng Amplicon (16S/18S/ITS) ay binuo na may mga taon ng karanasan sa pagtatasa ng proyekto ng microbial diversity, na naglalaman ng standardized basic analysis at personalized analysis: sinasaklaw ng basic analysis ang mainstream analysis content ng kasalukuyang microbial research, ang analysis content ay mayaman at komprehensibo, at ang mga resulta ng pagsusuri ay ipinakita sa anyo ng mga ulat ng proyekto;Ang nilalaman ng personalized na pagsusuri ay magkakaiba.Maaaring pumili ng mga sample at ang mga parameter ay maaaring itakda nang may kakayahang umangkop ayon sa pangunahing ulat ng pagsusuri at layunin ng pananaliksik, upang mapagtanto ang mga personalized na pangangailangan.Windows operating system, simple at mabilis.
-
PacBio-Full-length Transcriptome (Non-Reference)
Ang pagkuha ng Pacific Biosciences (PacBio) Isoform sequencing data bilang input, nagagawa ng App na ito na tukuyin ang mga full-length na transcript sequence (nang walang assembly).Sa pamamagitan ng pagmamapa ng mga full-length na sequence laban sa reference na genome, ang mga transcript ay maaaring i-optimize ng mga kilalang gene, transcript, coding region, atbp. Sa kasong ito, mas tumpak na pagkakakilanlan ng mga istruktura ng mRNA, tulad ng alternatibong splicing, atbp, ay maaaring makamit.Ang pinagsamang pagsusuri sa NGS transcriptome sequencing data ay nagbibigay-daan sa mas komprehensibong annotation at mas tumpak na quantification sa expression sa transcript level, na higit na nakikinabang sa downstream differential expression at functional analysis.
-
Mga Toolkit
Ang BMKCloud ay isang nangungunang bioinformatic platform na nagbibigay ng one-stop na solusyon para sa mga genomic program, na malawak na pinagkakatiwalaan ng mga mananaliksik sa iba't ibang arena kabilang ang medikal, agrikultura, kapaligiran, atbp. Ang BMKCloud ay nakatuon na magbigay ng pinagsama-samang, maaasahan at mahusay na mga serbisyo kabilang ang mga bioinformatic analysis platform at tool , computing resources, pampublikong database, bioinformtic online na kurso, atbp. Ang BMKCloud ay may iba't ibang madalas na ginagamit na bioinformatic na tool na kinabibilangan ng gene annotation, evolutionary genetic tool, ncRNA, kontrol sa kalidad ng data, assembly, alignment, data extraction, mutations, statistics, figure generator, sequence pagsusuri, atbp.
-
maliit na RNA
Ang mga maliliit na RNA ay uri ng maikling non-coding na RNA na may average na haba na 18-30 nt, kabilang ang miRNA, siRNA at piRNA.Ang mga maliliit na RNA na ito ay malawakang naiulat na kasangkot sa iba't ibang biological na proseso tulad ng pagkasira ng mRNA, pagsugpo sa pagsasalin, pagbuo ng heterochromatin, atbp. Ang pagsusuri sa pagkakasunud-sunod ng SmallRNA ay malawakang inilapat sa mga pag-aaral sa pag-unlad ng hayop/halaman, sakit, virus, atbp. Maliit na RNA Ang sequencing analysis platform ay binubuo ng standard analysis at advanced data mining.Sa batayan ng data ng RNA-seq, maaaring makamit ng karaniwang pagsusuri ang pagkilala at hula ng miRNA, hula ng target na gene ng miRNA, anotasyon at pagsusuri sa expression.Ang advanced na pagsusuri ay nagbibigay-daan sa pasadyang paghahanap at pagkuha ng miRNA, pagbuo ng Venn diagram, miRNA at pagbuo ng target na gene network.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Ang NGS-WGS ay isang buong genome re-sequencing analysis platform, na binuo batay sa mayamang karanasan sa Biomarker Technologies.Ang madaling gamitin na platform na ito ay nagbibigay-daan sa mabilis na pagsusumite ng pinagsama-samang daloy ng trabaho sa pagsusuri sa pamamagitan lamang ng pagtatakda ng ilang pangunahing parameter, na akma para sa data ng pagkakasunud-sunod ng DNA na nabuo mula sa parehong platform ng Illumina at platform ng pagkakasunud-sunod ng BGI.Ang platform na ito ay naka-deploy sa mataas na pagganap ng computing server, na nagbibigay kapangyarihan sa mataas na mahusay na pagsusuri ng data sa napakalimitadong oras.Available ang personalized na data mining batay sa karaniwang pagsusuri, kabilang ang mutated gene query, PCR primer design, atbp.
-
mRNA(Sanggunian)
Ang Transcriptome ay ang link sa pagitan ng genomic genetic information at ang proteome ng biological function.Ang regulasyon sa antas ng transkripsyon ay ang pinakamahalaga at pinakamalawak na pinag-aralan na mode ng regulasyon ng mga organismo.Maaaring i-sequence ng transcriptome sequencing ang transcriptome sa anumang punto ng oras o sa ilalim ng anumang kundisyon, na may tumpak na resolusyon sa isang solong nucleotide. Maaari nitong dynamic na sumasalamin sa antas ng transkripsyon ng gene, sabay na tukuyin at binibilang ang mga bihirang at normal na transcript, at ibigay ang istrukturang impormasyon ng sample ng mga tiyak na transcript.
Sa kasalukuyan, malawakang ginagamit ang teknolohiya ng transcriptome sequencing sa agronomy, gamot at iba pang larangan ng pananaliksik, kabilang ang regulasyon sa pagpapaunlad ng hayop at halaman, adaptasyon sa kapaligiran, pakikipag-ugnayan sa immune, lokalisasyon ng gene, ebolusyon ng genetic ng species at pagtuklas ng tumor at genetic na sakit.
-
Metagenomics (NGS)
Ang platform ng pagsusuri na ito ay idinisenyo para sa pagtatasa ng data ng metagenomic ng shotgun batay sa mga taon ng karanasan.Binubuo ito ng pinagsama-samang daloy ng trabaho na naglalaman ng iba't ibang karaniwang kinakailangang pagsusuri ng metagenomics kabilang ang pagpoproseso ng data, pag-aaral sa antas ng species, pag-aaral sa antas ng function ng gene, pag-binning ng metagenome, atbp. Bilang karagdagan, available ang mga customized na tool sa pagmimina ng data sa karaniwang daloy ng trabaho sa pagsusuri, kabilang ang query ng gene at species , setting ng parameter, personalized na pagbuo ng figure, atbp.
-
LncRNA
Ang mga long non-coding RNAs (lncRNA) ay isang uri ng mga transcript na may haba na mas mahaba sa 200 nt, na hindi nakakapag-code ng mga protina.Ang naipon na ebidensya ay nagmumungkahi na ang karamihan sa mga lncRNA ay malamang na gumana.Ang mga high-throughput na teknolohiya sa pagkakasunud-sunod at mga tool sa pagsusuri ng bioinformatic ay nagbibigay ng kapangyarihan sa amin na ipakita ang mga pagkakasunud-sunod ng lncRNA at impormasyon sa pagpoposisyon nang mas mahusay at humantong sa amin na tumuklas ng mga lncRNA na may mahalagang mga function ng regulasyon.Ipinagmamalaki ng BMKCloud na ibigay sa aming mga customer ang lncRNA sequencing analysis platform upang makamit ang mabilis, maaasahan at flexible na pagsusuri sa lncRNA.
-
GWAS
Ang Genome-wide association study (GWAS) ay naglalayong tukuyin ang mga genetic variant (genotype) na nauugnay sa mga partikular na katangian (phenotype).Iniimbestigahan ng mga pag-aaral ng GWA ang mga genetic marker na tumatawid sa buong genome ng malaking bilang ng mga indibidwal at hinuhulaan ang mga asosasyon ng genotype-phenotype sa pamamagitan ng istatistikal na pagsusuri sa antas ng populasyon.Maaaring matuklasan ng whole-genome resequencing ang lahat ng genetic variant.Kasabay ng phenotypic data, maaaring iproseso ang GWAS para matukoy ang mga SNP na nauugnay sa phenotype, QTL at mga gen ng kandidato, na malakas na nagsu-back up ng modernong pag-aanak ng hayop/halaman.Ang SLAF ay isang self-developed na pinasimple na diskarte sa pagkakasunud-sunod ng genome, na nakatuklas ng mga genome-wide distributed marker, SNP.Ang mga SNP na ito, bilang mga molecular genetic marker, ay maaaring iproseso para sa pag-aaral ng asosasyon na may mga naka-target na katangian.Ito ay isang cost-effective na diskarte sa pagtukoy ng mga kumplikadong katangian na nauugnay sa mga pagkakaiba-iba ng genetic.
-
Nanopore Full-length transcriptomics
Ang mga kumplikado at variable na alternatibong isoform sa mga organismo ay mahalagang mga mekanismo ng genetic para sa pag-regulate ng pagpapahayag ng gene at pagkakaiba-iba ng protina.Ang tumpak na pagkakakilanlan ng mga istruktura ng transcript ay ang batayan para sa malalim na pag-aaral ng mga pattern ng regulasyon ng expression ng gene.Ang platform ng pagkakasunud-sunod ng Nanopore ay matagumpay na nagdala ng transcriptomic na pag-aaral sa antas ng isoform.Ang platform ng pagsusuri na ito ay idinisenyo upang pag-aralan ang data ng RNA-Seq na nabuo sa Nanopore platform sa base ng reference genome, na nakakamit ng mga qualitative at quantitative na pagsusuri sa parehong antas ng gene at antas ng mga transcript.
-
circ-RNA
Ang Circular RNA(circRNA) ay isang uri ng non-coding RNA, na kamakailang natagpuang gumaganap ng mahalagang papel sa mga regulatory network na kasangkot sa pagbuo, environmental resistance, atbp. Naiiba sa mga linear na molekula ng RNA, hal mRNA, lncRNA, 3′ at 5′ Ang mga dulo ng circRNA ay pinagsama-sama upang bumuo ng isang pabilog na istraktura, na nagliligtas sa kanila mula sa pagtunaw ng exonuclease at mas matatag kaysa sa karamihan ng linear RNA.Ang CircRNA ay natagpuan na may magkakaibang mga pag-andar sa pag-regulate ng expression ng gene.Maaaring gumanap ang CircRNA bilang ceRNA, na nagbubuklod sa miRNA nang mapagkumpitensya, na kilala bilang miRNA sponge.Ang platform ng pagsusuri sa pagkakasunud-sunod ng CircRNA ay nagbibigay ng kapangyarihan sa istraktura at pagsusuri ng expression ng circRNA, paghuhula ng target at pinagsamang pagsusuri sa iba pang mga uri ng mga molekula ng RNA
-
BSA
Binubuo ang Bulked Segregant Analysis na platform ng isang hakbang na karaniwang pagsusuri at advanced na pagsusuri na may naka-customize na setting ng parameter.Ang BSA ay isang pamamaraan na ginagamit upang mabilis na matukoy ang phenotype na nauugnay na mga genetic marker.Ang pangunahing daloy ng trabaho ng BSA ay naglalaman ng: 1. pagpili ng dalawang grupo ng mga indibidwal na may lubhang magkasalungat na mga phenotype;2. pagsasama-sama ng DNA, RNA o SLAF-seq(Binuo ng Biomarker) ng lahat ng indibidwal upang bumuo ng dalawang bulk ng DNA;3. pagtukoy ng pagkakaiba-iba ng pagkakasunud-sunod laban sa sangguniang genome o sa pagitan, 4. paghula sa mga rehiyong nauugnay sa kandidato sa pamamagitan ng ED at SNP-index algorithm;5. Functional analysis at enrichment sa mga gene sa mga kandidatong rehiyon, atbp. Available din ang mas advanced na pagmimina sa data kabilang ang genetic marker screening at primer na disenyo.
