Mga highlight
Sa dalawang oras na webinar na ito, malaking karangalan na mag-imbita ng anim na eksperto sa crop genomics arena.Ang aming mga tagapagsalita ay magbibigay ng malalim na interpretasyon sa dalawang Rye genomic na pag-aaral, na kamakailan lamang na-publish noongGenetika ng Kalikasan:
1. Ang Chromosome-scale genome assembly ay nagbibigay ng mga insight sa rye biology, evolution, at agronomic potential
2. Ang mataas na kalidad na genome assembly ay nagha-highlight ng rye genomic na katangian at agronomically important genes
Gayundin, natutuwa kaming magkaroon ng Senior R&D Scientist ng Biomarker Technologies upang ibahagi ang kanyang karanasan sa de novo genome assembly.
Agenda
09:00am CET
Maligayang Pagbati
Zheng Hong-kun
Founder at CEO Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
Presidente, School of Advanced Agricultural Sciences Peking University
09:15am
Pagpapahusay ng rye, triticale at wheat improvement sa pamamagitan ng paggamit ng mataas na kalidad na reference genome sequence
Sa webinar na ito, binigyan kami ni Prof. Wang ng pangkalahatang mga update sa kasalukuyang katayuan ng triticeae genomic research at ipinakita ang tagumpay at break-through ng dalawang natitirang gawain sa Rye genome studies, na kamakailan lang ay nai-publish sa Nature Genetics at ipinakilala ang buong pananaliksik mga pangkat na namumuno at nag-aambag sa mga gawain.
09:25am
Cereal genomics @ IPK Gatersleben
Ang mga cereal grasses ng Triticeae tribe ay naging pangunahing pinagmumulan ng pagkain sa mapagtimpi na mga rehiyon, na matagal nang itinuturing na hotspot sa pagpapabuti ng pananim at pag-aanak.Sa lahat ng cultivated species, ang tribong ito ay sikat sa kanilang sobrang kumplikadong genomic features kabilang ang malalaking sukat ng genome, mataas na nilalaman ng TE, polyploidy, atbp. Sa session na ito, binigyan kami ni Prof. Nils Stein ng pangkalahatang pagpapakilala sa IPK Gatersleben at kasalukuyang status ng cereal genomic research@IPK Gatersleben.
09:35am
Ang Chromosome-scale genome assembly ay nagbibigay ng mga insight sa rye biology, evolution, at agronomic potential
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plan Research(IPK)Ang Rye (Secale cereale L.) ay isang natatanging pananim na cereal na nababanat sa klima, malawakang ginagamit upang makagawa ng pinahusay na mga uri ng trigo sa pamamagitan ng introgressive hybridization, at nagtataglay ng buong repertoire ng mga gene na kinakailangan upang paganahin ang hybrid breeding.Ang Rye ay allogamous at kamakailan lamang na domesticated, na nagbibigay ng access sa mga nilinang na rye sa isang magkakaibang at mapagsamantalang wild gene pool.Para higit pang mapahusay ang agronomic potential ng rye, gumawa kami ng chromosome-scale annotated assembly ng 7.9 Mbp rye genome, at malawakang napatunayan ang kalidad nito gamit ang isang suite ng molecular genetic resources.Nagpapakita kami ng mga aplikasyon ng mapagkukunang ito na may malawak na hanay ng mga pagsisiyasat.Nagpapakita kami ng mga natuklasan sa hindi kumpletong genetic isolation ng cultivated rye mula sa mga ligaw na kamag-anak, mga mekanismo ng genome structural evolution, pathogen resistance, low temperature tolerance, fertility control system para sa hybrid breeding, at ang mga benepisyo ng ani ng rye-wheat introgressions.
10:05am
Ang isang mataas na kalidad na genome assembly ay nagha-highlight ng rye genomic na mga katangian at agronomically important genes
Ang Rye ay isang mahalagang pagkain at forage crop, isang mahalagang genetic na mapagkukunan para sa pagpapabuti ng trigo at triticale, at isang kailangang-kailangan na materyal para sa mahusay na comparative genomics na pag-aaral sa mga damo.Dito, pinagsunod-sunod namin ang genome ng Weining rye, isang elite Chinese rye variety.Ang mga pinagsama-samang contigs (7.74 Gb) ay nagkakahalaga ng 98.47% ng tinantyang laki ng genome (7.86 Gb), na may 93.67% ng mga contigs (7.25 Gb) na itinalaga sa pitong chromosome.Ang mga paulit-ulit na elemento ay bumubuo ng 90.31% ng pinagsama-samang genome.Kung ikukumpara sa mga dating sequenced na Triticeae genome, nagpakita ng malakas na pagpapalawak sa rye ang Daniela, Sumaya at Sumana retrotransposon.Ang mga karagdagang pagsusuri sa Weining assembly ay nagbigay ng bagong liwanag sa genome-wide gene duplications at ang epekto nito sa starch biosynthesis genes, mga pisikal na organisasyon ng complex prolamin loci, mga feature ng gene expression na pinagbabatayan ng maagang heading trait, at putative domestication-associated chromosomal regions at loci sa rye.Nangangako ang genome sequence na ito na pabilisin ang genomics at pag-aaral ng breeding ng rye at mga kaugnay na pananim ng cereal.
10:35am
Mga hamon, solusyon at hinaharap para sa genome de novo assembly
Genome ng mataas na kalidad ay ang batayan ng genomic na pag-aaral.Bagama't ang mabilis na pag-unlad sa pagkakasunud-sunod at algorithm ay nagbigay ng kapangyarihan sa isang mas simple at mas mahusay na pagpupulong ng genome, ang mga kinakailangan sa katumpakan at pagkakumpleto ng pagpupulong ay tumataas din sa pagpapalalim ng mga layunin sa pananaliksik.Sa pag-uusap na ito ay tatalakayin ko ang kasalukuyang mga sikat na teknolohiya sa genome assembly na may ilang matagumpay na mga kaso at tingnan ang hinaharap na pag-unlad.
Oras ng post: Ene-08-2022