Ang Transcriptome ay ang link sa pagitan ng genomic genetic information at ang proteome ng biological function.Ang regulasyon sa antas ng transkripsyon ay ang pinakamahalaga at pinakamalawak na pinag-aralan na mode ng regulasyon ng mga organismo.Maaaring i-sequence ng transcriptome sequencing ang transcriptome sa anumang punto ng oras o sa ilalim ng anumang kundisyon, na may tumpak na resolusyon sa isang solong nucleotide. Maaari nitong dynamic na sumasalamin sa antas ng transkripsyon ng gene, sabay na tukuyin at binibilang ang mga bihirang at normal na transcript, at ibigay ang istrukturang impormasyon ng sample ng mga partikular na transcript.
Sa kasalukuyan, malawakang ginagamit ang teknolohiya ng transcriptome sequencing sa agronomy, gamot at iba pang larangan ng pananaliksik, kabilang ang regulasyon sa pagpapaunlad ng hayop at halaman, adaptasyon sa kapaligiran, pakikipag-ugnayan sa immune, lokalisasyon ng gene, ebolusyon ng genetic ng species at pagtuklas ng tumor at genetic na sakit.