● Naka-target na Rehiyon ng Protein Coding: sa pamamagitan ng pagkuha at pagkakasunud-sunod ng rehiyon ng coding ng protina, ginagamit ang hWES upang ipakita ang mga variant na nauugnay sa istruktura ng protina;
● Mataas na Katumpakan: na may mataas na sequencing depth, pinapadali ng hWES ang pagtuklas ng mga karaniwang variant at bihirang variant na may mga frequency na mas mababa sa 1%;
● Cost Effective: Ang hWES ay nagbubunga ng humigit-kumulang 85% ng mga mutation ng sakit ng tao mula sa 1% ng genome ng tao;
● Limang mahigpit na pamamaraan ng QC na sumasaklaw sa buong proseso na may garantisadong Q30>85%.
Platform
| Aklatan
| Diskarte sa Exon Capture
| Inirerekomenda ang Diskarte sa Pagsunod-sunod
|
Plataporma ng Illumina NovaSeq
| PE150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | 5 Gb 10 Gb |
Uri ng Sample
| Halaga(Qubit® )
| Dami
| Konsentrasyon
| Kadalisayan(NanoDrop™ ) |
Genomic DNA
| ≥ 300 ng | ≥ 15 μL | ≥ 20 ng/μL | OD260/280=1.8-2.0 walang degradasyon, walang kontaminasyon
|
Para sa mga Mendelian disorder/bihirang sakit: epektibong sequencing depth sa itaas 50×
Para sa mga sample ng tumor: epektibong sequencing depth sa itaas 100×
1.Mga istatistika ng pagkakahanay
Talahanayan 1 Mga istatistika ng resulta ng mapa
Talahanayan 2 Mga istatistika ng pagkuha ng exome
2.Variation Detection
Figure 1 Statistics ng SNV at InDel
3. Advanced na Pagsusuri
Figure 2 Circos plot ng Genome-wide na nakakapinsalang SNV at InDel
Talahanayan 3 Pagsusuri ng mga gene na nagdudulot ng sakit