Ang Genome-wide association study (GWAS) ay naglalayong tukuyin ang mga genetic variant (genotype) na nauugnay sa mga partikular na katangian (phenotype).Iniimbestigahan ng mga pag-aaral ng GWA ang mga genetic marker na tumatawid sa buong genome ng malaking bilang ng mga indibidwal at hinuhulaan ang mga asosasyon ng genotype-phenotype sa pamamagitan ng istatistikal na pagsusuri sa antas ng populasyon.Maaaring matuklasan ng whole-genome resequencing ang lahat ng genetic variant.Kasabay ng phenotypic data, maaaring iproseso ang GWAS para matukoy ang mga SNP na nauugnay sa phenotype, QTL at mga gen ng kandidato, na malakas na nagsu-back up ng modernong pag-aanak ng hayop/halaman.Ang SLAF ay isang self-developed na pinasimple na diskarte sa pagkakasunud-sunod ng genome, na nakatuklas ng mga genome-wide distributed marker, SNP.Ang mga SNP na ito, bilang mga molecular genetic marker, ay maaaring iproseso para sa pag-aaral ng asosasyon na may mga naka-target na katangian.Ito ay isang cost-effective na diskarte sa pagtukoy ng mga kumplikadong katangian na nauugnay sa mga pagkakaiba-iba ng genetic.
