● Maramihang mga diskarte sa pagkakasunud-sunod na magagamit para sa iba't ibang mga layunin sa pananaliksik
● Lubos na may karanasan sa fungi genome assembly na may mahigit 10,000 pene-complete genome na na-assemble.
● Propesyonal na after-sale na technical support team na tumutugon sa mas tiyak na mga pangangailangan sa pananaliksik.
Serbisyo | Diskarte sa Pagsunod-sunod | Garantisadong kalidad | Tinatayang oras ng turn-around |
Fungal pinong mapa | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 araw ng trabaho |
PacBio HiFi 30X | |||
Fungal pene-kumpletong mapa | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Chromosome anchoring ratio >90% | 45 araw ng trabaho |
● Kontrol sa kalidad ng raw data
● Genome assembly
● Pagsusuri ng bahagi ng genome
● Gene function na anotasyon
● Comparative genomic analysis
Para saMga extract ng DNA:
Uri ng Sample | Halaga | Konsentrasyon | Kadalisayan |
Mga extract ng DNA | > 1.2 μg | > 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
Para sa mga sample ng tissue:
Uri ng sample | Inirerekomenda ang sample na paggamot | Sample na imbakan at pagpapadala |
Unicellular Fungus | Pagmasdan ang lebadura sa ilalim ng mikroskopyo at kolektahin ang mga ito sa kanilang exponential phase Ilipat ang kultura (naglalaman ng humigit-kumulang 3-4.5e9 na mga cell) sa isang 1.5 o 2 ml na eppendorf.(Patuloy sa yelo) I-centrifuge ang tubo ng 1 min sa 14000 g upang mangolekta ng bacteria at maingat na alisin ang supernatant I-seal ang tubo at i-freeze ang bacteria sa liquid nitrogen nang hindi bababa sa 1-3 h.Itago ang tubo sa -80 ℃ refrigerator. | I-freeze ang mga sample sa liquid nitrogen sa loob ng 3-4 na oras at iimbak sa liquid nitrogen o -80 degree hanggang sa pangmatagalang reserbasyon.Kinakailangan ang sample na pagpapadala gamit ang dry-ice. |
Macro Fungus | Inirerekomenda ang tissue sa aktibong paglaki. Banlawan ang tissue ng walang endotoxin na tubig, pagkatapos ay 70% ethonal. I-save ang sample sa cryo-tubes. |
1.Circos diagram sa fungal genomic components
2. Pagsusuri ng comparative genomics: Phylogenetic tree