Suriin ang potensyal ng pag-aaral ng ligaw na iba't ibang uri ng pananaliksik, na ipinakita ng isang mahalagang kaso mula sa mga kliyente ng BMKGENE.Kamakailang nai-publish sa edisyon ngayong taon ng Plant Biotechnology Journal, ang artikulong pinamagatang “Chromosome-level Wild Hevea brasiliensis Genome: Empowering Genomic-Assisted Breeding and Unearthing Vital Loci for Elevated Rubber Yield” ay isang mahalagang sanggunian.
Ang Brazilian rubber tree (Hevea brasiliensis) ay nakatayo bilang isang pivotal natural rubber source.Sa buong nakaraang siglo, ang mga tradisyunal na pamamaraan ng pag-aanak ay nag-trigger ng isang kapansin-pansin na anim na beses na pagsulong sa produksyon ng goma.Gayunpaman, ang pinagbabatayan na genetic bedrock na responsable para sa potensyal na pagpapahusay ng ani ng goma ay nananatiling misteryoso.
Ang pag-aaral na ito ay nagsimula sa pagbuo ng isang chromosome-level genome para sa ligaw na puno ng goma, na gumagamit ng isang synergy ng Nanopore long-read sequencing, Illumina NGS sequencing, at Hi-C na teknolohiya.
Kasabay nito, isang trove ng 147 na mapagkukunan ng germplasm, na sumasaklaw sa mga pagkakaiba-iba ng mataas na ani, mga ligaw na strain, at mga kaugnay na species, ay binuo para sa komprehensibong buong genome resequencing (WGS) gamit ang platform ng Illumina.Ang kasunod na data ng pagkakasunud-sunod ay sumailalim sa mahigpit na pagsusuri sa genetics ng populasyon, na nagbibigay-daan sa pag-dissection ng istruktura ng populasyon, pagkakaiba-iba, at pagkakaugnay ng disequilibrium.Ang pagsusuring ito ay nagbibigay liwanag sa mga pagkakaiba-iba ng domestication sa mga populasyon.
Ang mga karagdagang pagsisiyasat ay sumasaklaw sa pagsusuri na sumasaklaw sa Fst, π, Tajima's D, at LD, na naglalayong ipakita ang mga senyales ng pagpili na nagmumula sa pinahusay na ani ng latex, lalo na nakatuon sa mga clone ng Wickham.
Nagtatapos sa isang Genome-wide Association Analysis (GWAS), ang mga marker na naka-link sa mga katangian ng ani at kasunod na mga gene na nauugnay sa ani ay tinukoy.Inihayag ng paunang pagpapatunay ang mga natatanging aktibidad ng transkripsyon sa iba't ibang mutant para sa dalawang ERF genes, na nagbibigay ng paunang sulyap sa kanilang functional na kahalagahan.Ang karagdagang pagpapatibay ay naka-iskedyul sa loob ng paparating na pananaliksik.
Ipinagmamalaki ng BMKGENE ang pag-aambag sa malawak na buong genome resequencing ng napakalaking populasyon na ito, kasama ang isang malaking papel sa pagsusuri ng bioinformatics.Ang aming malawak na karanasan ay sumasaklaw sa NGS/TGS sequencing at multiomics bioinformatics analysis sa isang hanay ng 1000+ species.Inaasahan namin ang posibilidad na makipagsosyo sa iyo sa iyong mga paparating na proyekto.
Mag-click dito paramatuto nang higit pa tungkol sa pag-aaral na ito
Oras ng post: Ago-29-2023