● Highly Experienced: Mahigit 200,000 sample ang naproseso sa BMK na sumasaklaw sa iba't ibang uri ng sample, kabilang ang cell culture, tissue, body fluid, atbp. at mahigit 7,000 mRNA-Seq projects na nagsara na sumasaklaw sa iba't ibang lugar ng pananaliksik.
● Mahigpit na sistema ng kontrol sa kalidad: Ang mga pangunahing punto ng kontrol sa kalidad sa lahat ng mga hakbang kabilang ang paghahanda ng sample, paghahanda sa library, pagkakasunud-sunod at bioinformatics ay nasa ilalim ng malapit na pagsubaybay upang makapaghatid ng mga de-kalidad na resulta.
● Maramihang database na available para sa function annotation at enrichment studies upang matupad ang magkakaibang layunin sa pananaliksik.
● Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta: Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta na may bisa sa loob ng 3 buwan pagkatapos makumpleto ang proyekto, kabilang ang pag-follow-up ng mga proyekto, pag-troubleshoot, mga resulta ng Q&A, atbp.
Aklatan | Diskarte sa pagkakasunud-sunod | Inirerekomenda ang data | Quality Control |
Poly A enriched | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nucleotides:
Conc.(ng/μl) | Halaga (μg) | Kadalisayan | Integridad |
≥ 20 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Limitado o walang protina o kontaminasyon ng DNA na ipinapakita sa gel. | Para sa mga halaman: RIN≥6.5; Para sa mga hayop: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; limitado o walang baseline elevation |
Tissue: Timbang(tuyo):≥1 g
*Para sa tissue na mas maliit sa 5 mg, inirerekomenda naming magpadala ng flash frozen(sa liquid nitrogen) sample ng tissue.
Suspensyon ng cell:Bilang ng cell = 3×106- 1×107
*Inirerekomenda naming ipadala ang frozen cell lysate.Kung sakaling mas maliit ang cell na iyon sa 5×105.
Sampol ng dugo:Dami≥1 ml
Microorganism:Mass ≥ 1 g
Lalagyan: 2 ml centrifuge tube (Hindi inirerekomenda ang tin foil)
Sample na pag-label: Pangkat+kopya hal. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Pagpapadala:
Bioinformatics
Eukaryotic daloy ng trabaho sa pagsusuri sa pagkakasunud-sunod ng mRNA
Bioinformatics
ØKontrol sa kalidad ng raw data
ØReference genome alignment
ØPagsusuri ng istruktura ng transcript
ØAng dami ng ekspresyon
ØPagsusuri ng differential expression
ØFunction annotation at enrichment
1.mRNA Data Saturation curve
2.Differential expression analysis-Plot ng bulkan
3.KEGG annotation sa mga DEG
4.Pag-uuri ng GO sa mga DEG