BMKCloud Log in
条形banner-03

Mga produkto

Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina

Ang pagkakasunud-sunod ng mRNA ay nagbibigay-daan sa pag-profile ng lahat ng mRNA na na-transcript mula sa mga cell sa ilalim ng mga partikular na kondisyon.Ito ay isang makapangyarihang teknolohiya para sa pagbubunyag ng profile ng expression ng gene, mga istruktura ng gene at mga mekanismo ng molekular ng ilang biological na proseso.Sa ngayon, ang pagkakasunud-sunod ng mRNA ay malawakang ginagamit sa pangunahing pananaliksik, klinikal na diagnostic, pag-unlad ng gamot, atbp.

Platform: Plataporma ng Illumina NovaSeq


Mga Detalye ng Serbisyo

Bioinformatics

Mga Resulta ng Demo

Mga kalamangan

● Highly Experienced: Mahigit 200,000 sample ang naproseso sa BMK na sumasaklaw sa iba't ibang uri ng sample, kabilang ang cell culture, tissue, body fluid, atbp. at mahigit 7,000 mRNA-Seq projects na nagsara na sumasaklaw sa iba't ibang lugar ng pananaliksik.

● Mahigpit na sistema ng kontrol sa kalidad: Ang mga pangunahing punto ng kontrol sa kalidad sa lahat ng mga hakbang kabilang ang paghahanda ng sample, paghahanda sa library, pagkakasunud-sunod at bioinformatics ay nasa ilalim ng malapit na pagsubaybay upang makapaghatid ng mga de-kalidad na resulta.

● Maramihang database na available para sa function annotation at enrichment studies upang matupad ang magkakaibang layunin sa pananaliksik.

● Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta: Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta na may bisa sa loob ng 3 buwan pagkatapos makumpleto ang proyekto, kabilang ang pag-follow-up ng mga proyekto, pag-troubleshoot, mga resulta ng Q&A, atbp.

Mga Sample na Kinakailangan at Paghahatid

Aklatan Diskarte sa pagkakasunud-sunod Inirerekomenda ang data Quality Control
Poly A enriched Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85%

Mga Sample na Kinakailangan:

Nucleotides:

Conc.(ng/μl)

Halaga (μg)

Kadalisayan

Integridad

≥ 20

≥ 0.5

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Limitado o walang protina o kontaminasyon ng DNA na ipinapakita sa gel.

Para sa mga halaman: RIN≥6.5;

Para sa mga hayop: RIN≥7.0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

limitado o walang baseline elevation

Tissue: Timbang(tuyo):≥1 g
*Para sa tissue na mas maliit sa 5 mg, inirerekomenda naming magpadala ng flash frozen(sa liquid nitrogen) sample ng tissue.

Suspensyon ng cell:Bilang ng cell = 3×106- 1×107
*Inirerekomenda naming ipadala ang frozen cell lysate.Kung sakaling mas maliit ang cell na iyon sa 5×105.

Sampol ng dugo:Dami≥1 ml

Microorganism:Mass ≥ 1 g

Inirerekomendang Paghahatid ng Sample

Lalagyan: 2 ml centrifuge tube (Hindi inirerekomenda ang tin foil)

Sample na pag-label: Pangkat+kopya hal. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Pagpapadala:

  1. Dry-ice: Ang mga sample ay kailangang ilagay sa mga bag at ibaon sa dry-ice.
  2. Mga RNAstable na tubo: Ang mga sample ng RNA ay maaaring patuyuin sa RNA stabilization tube (hal. RNAstable®) at ipadala sa temperatura ng silid.

Daloy ng Trabaho ng Serbisyo

Sample QC

Eksperimento na disenyo

paghahatid ng sample

Paghahatid ng sample

Eksperimento ng piloto

Pagkuha ng RNA

Paghahanda sa Aklatan

Paggawa ng aklatan

Pagsusunod-sunod

Pagsusunod-sunod

Pagsusuri sa datos

Pagsusuri sa datos

Mga Serbisyo pagkatapos ng pagbebenta

Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta


  • Nakaraan:
  • Susunod:

  • Bioinformatics

    wps_doc_10

    Eukaryotic daloy ng trabaho sa pagsusuri sa pagkakasunud-sunod ng mRNA

    Bioinformatics

    ØKontrol sa kalidad ng raw data

    ØReference genome alignment

    ØPagsusuri ng istruktura ng transcript

    ØAng dami ng ekspresyon

    ØPagsusuri ng differential expression

    ØFunction annotation at enrichment

    1.mRNA Data Saturation curve

    3(1)

    2.Differential expression analysis-Plot ng bulkan

    4(1)

    3.KEGG annotation sa mga DEG

    5(1)

    4.Pag-uuri ng GO sa mga DEG

    6(1)

    kumuha ka ng kota

    Isulat ang iyong mensahe dito at ipadala ito sa amin

    Ipadala ang iyong mensahe sa amin: