Platform | Laki ng Aklatan | Theoretical Data Yield (Per Cell) | Single-base na Katumpakan | Mga aplikasyon |
Nanopore | 8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR | 70-90Gb/Cell | 85-92% | SV calling, De novo, Full-length sequencing, Iso-Seq, Gene annotation, Detection of DNA methylation |
● Higit sa 5 taong karanasan sa PacBio sequencing platform na may libu-libong saradong proyekto na may iba't ibang species.
● Ang BMKGENE ay isang opisyal na kasosyo ng Oxford Nanopore, na may dual platform na RNA/DNA certification.
● May mga pangunahing modelo ng mga sequencer na may kumpletong kagamitan at sapat na sequencing throughput.
● Batay sa Nanopore platform, mahigit 10 hayop at halaman na mga pagsasaliksik ng Denovo ang nai-publish sa mga kilalang journal sa buong mundo.
Uri ng Sample | Halaga | Concentrtion(Qubit ®) | Dami | Kadalisayan | Iba |
Genomic DNA | Depende sa Data Requirement | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5; Maaliwalas na peak sa 260 nm,walang kontaminasyon | Kailangang sukatin ang konsentrasyon ng Qubit at Qubit/Nanopore ≤ 2 |
Kabuuang RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5;walang kontaminasyon | Halaga ng RIN ≥7.5 |
Pagtatasa ng Kalidad ng Data ng Sample ng DNA
Talahanayan 1. Mga istatistika sa malinis na datos.
BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | malinisN50Len | malinisN90Len | malinisMeanLen | malinisMaxLen | malinisMeanQual |
DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
Pagtatasa ng Kalidad ng Data ng Sample ng RNA
Talahanayan 1. Mga istatistika sa malinis na datos.
FileName | ID ng kliyente | ReadNum | BaseNum | N50 | MeanLength | MaxLength | MeanQscore |
RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
Figure 1. Basahin ang distribusyon ng haba
Figure 2. Pamamahagi ng marka ng kalidad ng malinis na data
Figure 3. Haba at kalidad ng pamamahagi ng marka ng malinis na data