● Maramihang mga diskarte sa pagkakasunud-sunod na magagamit para sa iba't ibang mga layunin sa pananaliksik
● Bacteria complete genome na may 0 Gap na garantisadong.
● Napakaraming karanasan sa bacteria genome assembly na may mahigit 10,000 kumpletong genome na na-assemble.
● Propesyonal na after-sale na technical support team na tumutugon sa mas tiyak na mga pangangailangan sa pananaliksik.
Pagsusunod-sunodDiskarte | Aklatan | Garantisadong kalidad | Tinatayang oras ng turn-around |
Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 Gap | 30 Araw |
PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
● Kontrol sa kalidad ng raw data
● Genome assembly
● Pagsusuri ng bahagi ng genome
● Gene function na anotasyon
● Comparative genomic analysis
Para saMga extract ng DNA:
Uri ng Sample | Halaga | Konsentrasyon | Kadalisayan |
Mga extract ng DNA | > 2 μg | > 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
Para sa mga sample ng tissue:
Uri ng sample | Inirerekomenda ang sample na paggamot | Sample na imbakan at pagpapadala |
Bakterya | Obserbahan ang bacteria sa ilalim ng mikroskopyo at kolektahin ang bacteria sa kanilang exponential phase Ilipat ang bacteria culture (naglalaman ng humigit-kumulang 3-4.5e9 cells) sa isang 1.5 o 2 ml na eppendorf.(Patuloy sa yelo) I-centrifuge ang tubo ng 1 min sa 14000 g upang mangolekta ng bacteria at maingat na alisin ang supernatant I-seal ang tubo at i-freeze ang bacteria sa liquid nitrogen nang hindi bababa sa 30 min.Itago ang tubo sa -80 ℃ refrigerator. | I-freeze ang mga sample sa liquid nitrogen sa loob ng 3-4 na oras at iimbak sa liquid nitrogen o -80 degree hanggang sa pangmatagalang reserbasyon.Kinakailangan ang sample na pagpapadala gamit ang dry-ice. |
1.Circos ng bacteria genome
2.Paghuhula ng gene ng coding
3. Pagsusuri ng comparative genomics: phylogenetic tree