UMUMY Ewolýusiýa
tebigat
ARAGATNAŞYK
Genom yzygiderliligi global ýaýramagyň ugurlaryny açýar we deňiz atlarynyň ewolýusiýasynda ýakyn genetiki uýgunlaşmalary teklip edýär
PacBio |Illumina |Salam-C |WGS |Genetiki dürlüligi |Demografik taryh |Gen akymy
“Pacbio” yzygiderliligi, genom de novo ýygnamak we düşündiriş hyzmatlary Biomarker Technologies tarapyndan üpjün edildi.
Iň esasy pursatlar
1. 15.5 Mb bolan N50 ýokary hilli hromosoma derejeli deňiz aty (Hippocampus erectus) genomy alyndy.
2. Dünýädäki 21 deňiz görnüşinden jemi 358 genom gaýtadan düzüldi.
3.Giçki Oligoseniň döwründe emele gelen deňiz kenarlary we soňraky global kolonizasiýa ýollary kesgitlenýär we okean akymlarynda üýtgeýän dinamika we paleotemporal deňiz ýollary bilen baglanyşyklydyr.
4. Gaýtalanýan “süňk oňurgalarynyň” uýgunlaşma fenotipiniň genetiki esasy esasy ösüş genindäki garaşsyz çalyşmalar bilen baglanyşyklydyr.
5. Okean akymlarynyň üsti bilen gezelenç etmek, dargadylmagynyň öwezini dolýar we çalt uýgunlaşmak täze ýaşaýyş ýerleriniň kolonizasiýasyny ýeňilleşdirýär
Üstünlikler
358 deňiz atlarynyň nusgalarynyň genetiki dürlüligi we filogenetik gatnaşygy
a22 hromosom boýunça 21 deňiz görnüşiniň nukleotid dürlüliginiň (π) nusgalary bolan deňiz kenarlary üçin geografiki nusga alma ýerleri.b 358 deňiz kenaryndaky genom giň SNP-ler bilen gurlan goňşy agaç.(A) daky ýerleşiş nyşanlary we (b) şahanyň fonunda biri-birine gabat gelýär.
2-nji surat Deňiz kenarlarynyň kolonizasiýasy we demografiki taryhy
aFilogenetik agaç we deňiz deňziniň 21 görnüşi üçin tapawutlylyk wagty.Şaha çyzygynyň galyňlygy ilatyň ölçeglerine (Ne) laýyk gelýär we reňkler dürli nesilleri görkezýär.I - III nyşanlary kalibrleme nokatlaryny görkezýär.b - d Tapawut wagtyna, paýlanyşyna, üýtgeme hadysalaryna we ummanyň akymlaryna (ak oklar) esaslanýan deňiz kenarlarynyň çak edilýän kolonizasiýa ýollary (reňkli oklar).b Hindi-Awstraliýa arhipelagy, deňiz kenarlary diwersifikasiýa edilmezden we 18–23 Ma dünýä ýaýramazdan ozal Gippokampus urugynyň gelip çykyşynyň (gyzyl bellik) merkezi bolupdyr.c Deňiz kenarlary ilki Tetýan deňziniň üsti bilen Atlantik ummanyny koloniýa etdi, ýapylandan soň (7–13 Ma aralygyndaky Terminal waka) bu Tetýan neslini Hindi ummanynyň dogan nesilinden aýyrdy.Ikinjisi, soňra Arap deňzinde çalt diwersifikasiýa edildi (sary bellik), deňiz deňziniň diwersifikasiýasynyň ikinji merkezini döretdi.d Atlantik ummanynyň ikinji deňiz kenaryndaky kolonizasiýa hadysasy, Günorta Afrikanyň ujundan geçip, Hindi ummanyndan takmynan 5Ma bolup, ahyrsoňy açyk Panamanyň deňiz kenaryndan takmynan 3,6 Ma çenli Gündogar Pacificuwaş ummanyna geldi.
3-nji surat, ilatyň täsirli mukdaryndaky gen akymy we üýtgemeleri
aGünorta Atlantik ummanynda ýaşaýan görnüşleriň arasynda gen akymy ýüze çykaryldy.Gen akymy, G-PhoCS tarapyndan göç ediliş tizligi hökmünde ak çyzyklaryň golaýynda görkezilýär.Oklaryň galyňlygy we ugry degişlilikde gen akymynyň tizligine we ugruna laýyk gelýär.b PSMC tarapyndan ilatyň täsirli ululygynyň üýtgemegi.X oky häzirki döwürden öňki ýyllary aňladýar, y oky bolsa ilatyň täsirli ululygyny görkezýär.Diagrammalar esasan dürli paýlanyş meýdançalary bolan görnüşleriň her biri üçin geografiki paýlanyşyna görä tertipleşdirilýär.c Soňky 1 million ýylda metr derejesinde deňiz derejesiniň üýtgemegi33.Sary çyzyk, dünýädäki iň soňky iň ýokary derejäni görkezýär, sian kölegesi bolsa iň soňky buzluk derejesini görkezýär.
4-nji surat Oňurgalaryň ewolýusiýasy.
aÇep, deňiz kenarlarynda oňurgalaryň garaşsyz ewolýusiýasyny görkezýän görnüşler agajy.Şahanyň uzynlygy, her sahypada çalyşýanlaryň sanyny görkezýär.Dört sany ýalpak deňiz görnüşi gök reňkde görkezilýär.Galyň şahalar, bmp3 geni üçin manysyz-sinonim çalyşmalaryň (dN / dS) has ýokary derejesine laýyk gelýär.Bmp3 geni üçin kanoniki we umumylaşdyrylan Makdonalds we Kreitman synagy (MKT) üç sany jübüt dogan görnüşi üçin dürli-dürli reňkli we fon reňkleri bilen tapawutlanýan, gök we gyzyl şrift bilen p bahasy bilen görkezilen üç jübüt dogan görnüşi üçin geçirildi.Dogry, bmp3 belogynda aminokislotanyň ornuny tutmak, polimorf we pyrryldakly deňiz kenarlarynda durnukly çalyşmalar degişlilikde gyzyl we gök tegelekler bilen görkezilýär.b DN / dS bahalarynyň pyrlanmaýan görnüşler bilen deňeşdirilende, deňiz kenarlarynda bmp3-de paýlanyşy.c Bmp3 bilen kodlanan belok üçin dikeldilen filogenetiki agaçda özbaşdak ewolýusiýa.d Gippokampus erektusynda bmp3-iň situ gibridizasiýasy.
Salgylanma
Li C we başgalar.Genom yzygiderliligi global ýaýramagyň ugurlaryny açýar we deňiz atlarynyň ewolýusiýasynda ýakyn genetiki uýgunlaşmalary teklip edýär.Nat Commun.2021-nji ýylyň 17-nji fewraly; 12 (1): 1094.
Habarlar we esasy pursatlar Biomarker Technologies bilen iň soňky üstünlikli wakalary paýlaşmagy, täze ylmy üstünlikleri we gözleg wagtynda ulanylýan görnükli usullary ele almagy maksat edinýär.
Iş wagty: -anwar-06-2022