Habarlar

Geçip bolýan element (TE) güýçlendirilmegi genomyň ululygyny we ewolýusiýasyny ara alyp maslahatlaşýan hereketlendiriji güýç hökmünde ykrar edildi, ýöne 3D genom arhitekturasynyň emele gelmeginiň netijeleri ösümliklerde entek belli däl.Bu ýerde, genomyň ululygynda üç esse üýtgeýän pagtanyň üç görnüşi üçin salgylanma derejeli genom ýygnaklaryny habar berýärisGossypium rotundifolium(K2),G. arboreum(A2) weG. raimondii(D5), Oksford Nanopore Tehnologiýalaryny ulanyp.Deňeşdirilen gen analizleri, genleriň ululygynyň tapawudyna (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb) nesil aýratynlygy bolan TE güýçlendirilişiniň jikme-jikliklerini dokumentleşdirýär we genleriň arasynda saklanylýan gen mazmunyny we sintezi gatnaşyklaryny görkezýär.Sinteniki genleriň takmynan 17% -iniň işjeň (“A”) we hereketsiz (“B”) bölümleriniň arasynda hromatin ýagdaýynyň üýtgemegini görkezýändigini gördük we TE güýçlendirilmegi gen sebitlerinde bir bölümiň paýynyň artmagy bilen baglanyşyklydyr (~ 7,000 gen) ) D2 bilen deňeşdirilende K2 we A2.Üç genomyň arasynda topologiki baglanyşyk domeniniň (TAD) çäkleriniň diňe 42% -i saklanyp galypdyr.Maglumatlarymyz, nesil aýratynlygy bolan TAD araçäkleriniň emele gelmeginden soň TE-leriň soňky güýçlendirilmegini göz öňünde tutýar.Bu gözleg, transposon-töwekgelçilikli genleriň ösmeginde ösümliklerde has ýokary tertipli hromatin gurluşynyň ewolýusiýasyndaky roluny açýar.