-
Ösümlik / Haýwan De novo Genom yzygiderliligi
De nowoyzygiderlilik, genomyň ýoklugynda PacBio, Nanopore, NGS we ş.m. yzygiderlilik tehnologiýalaryny ulanyp, bir görnüşiň tutuş genomynyň gurluşygyny aňladýar.Üçünji nesil yzygiderlilik tehnologiýalarynyň okalýan uzynlygyndaky ep-esli gowulaşma, ýokary heterozigozitli, gaýtalanýan sebitleriň ýokary gatnaşygy, poliploidler we ş.m. ýaly çylşyrymly genomlary ýygnamakda täze mümkinçilikler döretdi, onlarça kilobaza derejesinde okalýan uzynlyk bilen bu yzygiderlilik okamaga mümkinçilik berýär. gaýtalanýan elementleri, adaty bolmadyk GC mazmuny bolan sebitleri we beýleki çylşyrymly sebitleri çözmek.
Platforma ： PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Salam-C esasly Genom Assambleýasy
“Hi-C”, ýakynlyga esaslanýan täsirleri we ýokary geçiş yzygiderliligini barlamak arkaly hromosoma konfigurasiýasyny almak üçin döredilen usul.Bu özara täsirleriň intensiwligi, hromosomlardaky fiziki aralyk bilen negatiw baglanyşykda hasaplanýar.Şol sebäpden, “Hi-C” maglumatlary ýygnalan yzygiderliligiň genomyň üstünde jemlenmegine, tertipleşdirilmegine we belli bir mukdarda hromosomlara dakylmagyna ýol görkezip biler.Bu tehnologiýa, ilata esaslanýan genetiki kartanyň ýoklugynda hromosoma derejesindäki gen ýygnamak mümkinçiligini berýär.Her bir genomda “Hi-C” gerek.
Platforma ： Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Ewolýusiýa genetikasy
Ewolýusiýa genetikasy, SNP, InDels, SVs we CNV-ler ýaly genetiki üýtgeşmelere esaslanýan berlen materiallaryň ewolýusiýa maglumatlary barada giňişleýin düşündiriş bermek üçin niýetlenen gaplanan yzygiderli hyzmatdyr.Ilatyň gurluşy, genetiki dürlüligi, filogeniýa gatnaşyklary we ş.m. ýaly ewolýusiýa üýtgeşmelerini we ilatyň genetiki aýratynlyklaryny beýan etmek üçin zerur bolan ähli düýpli derňewleri üpjün edýär.
-
Deňeşdiriji genomika
Deňeşdirme genomikasy sözüň doly manysynda dürli genleriň yzygiderliligini we gurluşlaryny deňeşdirmegi aňladýar.Bu ders, dürli görnüşleri gorap saklaýan ýa-da tapawutlandyrýan yzygiderlilik gurluşlaryny we elementlerini kesgitlemek arkaly genleriň derejesinde ewolýusiýany, gen funksiýasyny, gen kadalaşdyryş mehanizmini ýüze çykarmagy maksat edinýär.Adaty deňeşdirme genomika gözleginde gen maşgalasyndaky analizler, ewolýusiýa ösüşi, genleriň tutuşlygyna köpelmegi, saýlama basyş we ş.m.
-
Bulgur Segregant derňewi
Köpçülikleýin bölünişik derňewi (BSA) fenotip bilen baglanyşykly genetiki bellikleri çalt kesgitlemek üçin ulanylýan usul.BSA-nyň esasy iş prosesi, aşa garşydaş fenotipleri bolan iki adamy saýlamagy, iki howuzyň arasynda diferensial yzygiderliligi kesgitläp, iki adamyň DNK-syny emele getirip, DNK-ny jemleýär.Bu usul ösümlik / haýwan genomynda maksatly genler bilen berk baglanyşykly genetiki bellikleri kesgitlemekde giňden ulanyldy.
