ØDürli gözleg maksatlary üçin elýeterli birnäçe yzygiderli strategiýa
ØBakteriýalar 0 Gap kepillendirilen genomy doly.
Ø10,000-den gowrak doly gen ýygnan bakteriýalaryň gen ýygnamagynda ýokary tejribeli.
ØSatuwdan soňky tehniki goldaw topary has anyk gözleg zerurlyklaryny ýerine ýetirýär.
YzygiderlilikStrategiýa | Kitaphana | Hil kepillendirilýär | Takmynan öwrüm wagty |
Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 Gap | 30 gün |
PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
üÇig maglumatlaryň hiline gözegçilik
üGenom ýygnamak
üGenom komponentiniň derňewi
üGen funksiýasynyň düşündirişi
üDeňeşdirilen genom derňewi
ÜçinDNK ekstraktlary:
Mysal görnüşi | Mukdary | Konsentrasiýa | Arassalyk |
DNK ekstraktlary | > 3 μg | > 20 ng / μl | OD260 / 280 = 1.6-2.5 |
Dokuma nusgalary üçin:
Mysal görnüşi | Maslahat berilýän nusga bejergisi | Saklamak we ibermek üçin nusga |
Bakteriýalar | Mikroskop astynda bakteriýalary synlaň we ekspensial fazasynda bakteriýalary ýygnaň Bakteriýalaryň medeniýetini (takmynan 3-4.5e9 öýjükleri öz içine alýar) 1,5 ýa-da 2 ml eppendorfda geçiriň.(Buzda saklaň) Bakteriýalary ýygnamak we adatdan daşary tebigaty seresaplylyk bilen aýyrmak üçin turbany 14000 g-da 1 minut merkezleşdiriň Turbany möhürläň we bakteriýalary suwuk azotda azyndan 30 minut doňduryň.Turbany -80 ridge holodilnikde saklaň. | Nusgalary suwuk azotda 3-4 sagat doňduryň we uzak möhletli rezervasiýa üçin suwuk azotda ýa-da -80 dereje saklaň.Gury buz bilen nusga ibermek zerurdyr. |
1. Bakteriýalaryň genomynyň sirkleri
2. Gen çaklamasyny kodlamak
3. Deňeşdiriji genomika derňewi: filogenetik agaç