ลิ้นชักแผนที่ความร้อนใช้สำหรับการวาดแผนที่ความร้อน ซึ่งสามารถกรอง ปรับมาตรฐาน และข้อมูลเมทริกซ์คลัสเตอร์ได้ ส่วนใหญ่จะใช้สำหรับการวิเคราะห์กลุ่มของระดับการแสดงออกของยีนระหว่างตัวอย่างต่างๆ
การแนบฟังก์ชันทางชีววิทยาเข้ากับลำดับในไฟล์ FASTA โดยการจัดลำดับกับฐานข้อมูล รวมถึง NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) เป็นอัลกอริทึมและโปรแกรมเพื่อค้นหาบริเวณที่มีลำดับทางชีววิทยาคล้ายคลึงกันโดยจะเปรียบเทียบลำดับเหล่านี้กับฐานข้อมูลลำดับและคำนวณนัยสำคัญทางสถิติBLAST ประกอบด้วยเครื่องมือสี่ประเภทตามประเภทลำดับ: blastn, Lastp, blastx และ tblastn