การแยกนิวเคลียสทำได้โดย 10× Genomics ChromiumTM ซึ่งประกอบด้วยระบบไมโครฟลูอิดิกแบบแปดช่องสัญญาณที่มีกากบาทคู่ในระบบนี้ เม็ดเจลที่มีบาร์โค้ดและไพรเมอร์ เอนไซม์ และนิวเคลียสเดี่ยวถูกห่อหุ้มด้วยหยดน้ำมันขนาดนาโนลิตร ทำให้เกิดเจลบีด-อิน-อิมัลชัน (GEM)เมื่อ GEM ถูกสร้างขึ้นแล้ว จะมีการสลายเซลล์และปล่อยบาร์โค้ดในแต่ละ GEMmRNA จะถูกคัดลอกแบบย้อนกลับไปเป็นโมเลกุล cDNA ด้วยบาร์โค้ด 10× และ UMI ซึ่งขึ้นอยู่กับการสร้างไลบรารีลำดับมาตรฐานเพิ่มเติม
เซลล์/เนื้อเยื่อ | เหตุผล |
เนื้อเยื่อแช่แข็งที่ไม่สด | ไม่สามารถรับองค์กรสดหรือบันทึกมานานได้ |
เซลล์กล้ามเนื้อ, เมกะคาริโอไซต์, ไขมัน... | เส้นผ่านศูนย์กลางของเซลล์ใหญ่เกินกว่าจะเข้าไปในเครื่องมือได้ |
ตับ… | เปราะบางเกินกว่าจะแตกหัก ไม่สามารถแยกเซลล์เดี่ยวได้ |
เซลล์ประสาท สมอง... | ละเอียดอ่อนกว่า เครียดง่าย จะทำให้ผลลัพธ์ของลำดับเปลี่ยนไป |
ตับอ่อน ไทรอยด์... | อุดมไปด้วยเอนไซม์ภายนอกที่ส่งผลต่อการผลิตสารแขวนลอยเซลล์เดียว |
นิวเคลียสเดี่ยว | เซลล์เดียว |
เส้นผ่านศูนย์กลางเซลล์ไม่จำกัด | เส้นผ่านศูนย์กลางของเซลล์: 10-40 ไมโครเมตร |
วัสดุสามารถเป็นเนื้อเยื่อแช่แข็งได้ | วัสดุจะต้องเป็นเนื้อเยื่อสด |
ความเครียดต่ำของเซลล์แช่แข็ง | การบำบัดด้วยเอนไซม์อาจทำให้เกิดปฏิกิริยาความเครียดของเซลล์ |
ไม่จำเป็นต้องเอาเซลล์เม็ดเลือดแดงออก | จำเป็นต้องกำจัดเซลล์เม็ดเลือดแดงออก |
นิวเคลียร์เป็นการแสดงออกถึงข้อมูลทางชีวภาพ | ทั้งเซลล์แสดงข้อมูลทางชีวภาพ |
ห้องสมุด | กลยุทธ์การจัดลำดับ | ปริมาณข้อมูล | ข้อกำหนดตัวอย่าง | เนื้อเยื่อ |
10 × ห้องสมุดนิวเคลียสเดี่ยวของจีโนมิกส์ | 10x จีโนมิกส์ - อิลลูมินา PE150 | อ่านประมาณ 100,000 ครั้ง/เซลล์100-200GB | หมายเลขเซลล์: >2× 105 เซลล์ที่มีความเข้มข้นที่ 700-1,200 เซลล์/ไมโครลิตร | ≥ 200 มก |
สำหรับรายละเอียดเพิ่มเติมเกี่ยวกับคำแนะนำในการเตรียมตัวอย่างและขั้นตอนการบริการ โปรดอย่าลังเลที่จะพูดคุยกับ กผู้เชี่ยวชาญของ BMKGENE
1. การจัดกลุ่มเฉพาะจุด
2.แผนที่ความร้อนการจัดกลุ่มคลัสเตอร์นิพจน์มาร์กเกอร์
3. การกระจายตัวของยีนเมกเกอร์ในกลุ่มต่างๆ
4.การวิเคราะห์วิถีเซลล์/เวลาเทียม