แพลตฟอร์ม: แพลตฟอร์ม Illumina NovaSeq, PE150
ประเภทไลบรารี: 350bp แทรกไลบรารี cDNA (ขึ้นอยู่กับการกระจายสูงสุด)
กลยุทธ์การหาลำดับ: จับคู่-สิ้นสุด 150 bp
ปริมาณข้อมูลที่แนะนำ: ข้อมูลดิบ 2 Gb/ตัวอย่าง
(1) การควบคุมคุณภาพข้อมูลลำดับ: การกระจายนิวคลีโอไทด์, การกระจายคุณภาพพื้นฐาน, การประเมินอัตราส่วน rRNA;
(2) การวิเคราะห์การจัดลำดับ: สถิติผลลัพธ์การจัดตำแหน่ง, ความอิ่มตัวของการจัดลำดับ, ความครอบคลุมของการจัดลำดับ;
(3) คำอธิบายประกอบจีโนมอ้างอิง (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);
(4) การวิเคราะห์นิพจน์: การกระจายนิพจน์ (ด้วยตัวอย่างตั้งแต่ 2 ตัวอย่างขึ้นไป) การวิเคราะห์การแสดงออกระหว่างตัวอย่าง (การวิเคราะห์เวนน์ การวิเคราะห์สหสัมพันธ์ การวิเคราะห์ PCA)
(5) การวิเคราะห์การแสดงออกเชิงอนุพันธ์ (ด้วยตัวอย่างตั้งแต่สองตัวอย่างขึ้นไป)
(6) การวิเคราะห์ชุดยีน: การวิเคราะห์เวนน์, การวิเคราะห์คลัสเตอร์, การวิเคราะห์คำอธิบายประกอบฟังก์ชัน (COG, GO, KEGG), การวิเคราะห์การเพิ่มคุณค่าฟังก์ชัน (GO, KEGG), กราฟคอร์ดเสริมฟังก์ชัน, การวิเคราะห์ไอพาธ
(7) การวิเคราะห์ sRNA: การทำนาย sRNA, คำอธิบายประกอบ sRNA (Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), การทำนายโครงสร้างรอง sRNA, การทำนายยีนเป้าหมาย sRNA;
(8) การวิเคราะห์โครงสร้างการถอดเสียง: การวิเคราะห์โอเปอรอน, การทำนายจุดเริ่มต้นและจุดสิ้นสุดของการถอดเสียง, คำอธิบายประกอบและการวิเคราะห์ UTR, การทำนายลำดับโปรโมเตอร์, การวิเคราะห์ SNP/InDel (คำอธิบายประกอบ SNP/InDel, การกระจายภูมิภาคของ SNP/InDel, สถิติ SNP)