-
บีเอสเอ
แพลตฟอร์มการวิเคราะห์แยกกลุ่มแบบเป็นกลุ่มประกอบด้วยการวิเคราะห์มาตรฐานในขั้นตอนเดียวและการวิเคราะห์ขั้นสูงพร้อมการตั้งค่าพารามิเตอร์ที่กำหนดเองBSA เป็นเทคนิคที่ใช้ในการระบุเครื่องหมายทางพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับฟีโนไทป์อย่างรวดเร็วขั้นตอนการทำงานหลักของ BSA ประกอบด้วย: 1. การเลือกกลุ่มบุคคลสองกลุ่มที่มีฟีโนไทป์ที่ขัดแย้งกันอย่างมาก;2. การรวม DNA, RNA หรือ SLAF-seq (พัฒนาโดย Biomarker) ของบุคคลทั้งหมดเพื่อสร้าง DNA สองกลุ่ม;3. การระบุลำดับที่แตกต่างกับจีโนมอ้างอิงหรือระหว่างนั้น 4. การทำนายขอบเขตที่เชื่อมโยงของผู้สมัครโดยอัลกอริธึม ED และ SNP-index;5. การวิเคราะห์เชิงหน้าที่และการเพิ่มคุณค่าของยีนในภูมิภาคผู้สมัคร ฯลฯ นอกจากนี้ยังมีการทำเหมืองข้อมูลขั้นสูงเพิ่มเติม รวมถึงการคัดกรองเครื่องหมายทางพันธุกรรมและการออกแบบไพรเมอร์
-
แอมพลิคอน (16S/18S/ITS)
แพลตฟอร์ม Amplicon (16S/18S/ITS) ได้รับการพัฒนาด้วยประสบการณ์หลายปีในการวิเคราะห์โครงการความหลากหลายของจุลินทรีย์ ซึ่งประกอบด้วยการวิเคราะห์พื้นฐานที่ได้มาตรฐานและการวิเคราะห์เฉพาะบุคคล: การวิเคราะห์พื้นฐานครอบคลุมเนื้อหาการวิเคราะห์กระแสหลักของการวิจัยจุลินทรีย์ในปัจจุบัน เนื้อหาการวิเคราะห์มีมากมายและครอบคลุม และผลการวิเคราะห์นำเสนอในรูปแบบรายงานโครงการเนื้อหาของการวิเคราะห์ส่วนบุคคลมีความหลากหลายสามารถเลือกตัวอย่างและตั้งค่าพารามิเตอร์ได้อย่างยืดหยุ่นตามรายงานการวิเคราะห์พื้นฐานและวัตถุประสงค์การวิจัย เพื่อให้บรรลุถึงความต้องการส่วนบุคคลระบบปฏิบัติการ Windows ง่ายและรวดเร็ว
-
พันธุศาสตร์เชิงวิวัฒนาการ
พันธุศาสตร์เชิงวิวัฒนาการเป็นบริการจัดลำดับแบบอัดแน่นที่ได้รับการออกแบบมาเพื่อให้การตีความข้อมูลวิวัฒนาการของวัสดุที่กำหนดอย่างครอบคลุมโดยอิงตามความแปรผันทางพันธุกรรม รวมถึง SNP, InDels, SV และ CNVโดยให้การวิเคราะห์พื้นฐานทั้งหมดที่จำเป็นสำหรับการอธิบายการเปลี่ยนแปลงเชิงวิวัฒนาการและลักษณะทางพันธุกรรมของประชากร เช่น โครงสร้างประชากร ความหลากหลายทางพันธุกรรม ความสัมพันธ์ทางสายวิวัฒนาการ ฯลฯ นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเกี่ยวกับการไหลของยีน ซึ่งให้อำนาจในการประมาณขนาดประชากรที่มีประสิทธิผล เวลาของความแตกต่าง
-
จีโนมิกส์เปรียบเทียบ
จีโนมเชิงเปรียบเทียบหมายถึงการเปรียบเทียบลำดับและโครงสร้างจีโนมที่สมบูรณ์ของสายพันธุ์ต่างๆสาขาวิชานี้มีจุดมุ่งหมายเพื่อเปิดเผยวิวัฒนาการของสปีชีส์ การทำงานของยีน กลไกการควบคุมยีนในระดับจีโนม โดยการระบุโครงสร้างลำดับและองค์ประกอบที่อนุรักษ์หรือสร้างความแตกต่างระหว่างสปีชีส์ต่างๆการศึกษาจีโนมเชิงเปรียบเทียบโดยทั่วไปประกอบด้วยการวิเคราะห์ในตระกูลยีน การพัฒนาเชิงวิวัฒนาการ การทำสำเนาจีโนมทั้งหมด แรงกดดันจากการคัดเลือก ฯลฯ
-
พันธุศาสตร์เชิงวิวัฒนาการ
แพลตฟอร์มการวิเคราะห์พันธุกรรมประชากรและวิวัฒนาการก่อตั้งขึ้นจากประสบการณ์มหาศาลที่สั่งสมมาในทีมงาน R&D ของ BMK มานานหลายปีเป็นเครื่องมือที่เป็นมิตรต่อผู้ใช้โดยเฉพาะสำหรับนักวิจัยที่ไม่เชี่ยวชาญด้านชีวสารสนเทศศาสตร์แพลตฟอร์มนี้ช่วยให้การวิเคราะห์พื้นฐานที่เกี่ยวข้องกับพันธุศาสตร์วิวัฒนาการขั้นพื้นฐาน รวมถึงการสร้างต้นไม้สายวิวัฒนาการ การวิเคราะห์ความไม่สมดุลของการเชื่อมโยง การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรม การวิเคราะห์แบบกวาดแบบเลือกสรร การวิเคราะห์เครือญาติ PCA การวิเคราะห์โครงสร้างประชากร ฯลฯ
-
การประกอบจีโนมที่ใช้ Hi-C
Hi-C เป็นวิธีการที่ออกแบบมาเพื่อจับโครงร่างโครโมโซมโดยรวมการโต้ตอบที่อิงความใกล้เคียงของโพรบและการจัดลำดับที่มีปริมาณงานสูงเชื่อว่าความรุนแรงของปฏิกิริยาเหล่านี้มีความสัมพันธ์เชิงลบกับระยะห่างทางกายภาพของโครโมโซมดังนั้น ข้อมูล Hi-C จึงสามารถชี้แนะการจัดกลุ่ม การจัดลำดับ และการวางแนวของลำดับที่ประกอบกันในจีโนมแบบร่าง และยึดลำดับเหล่านั้นไว้บนโครโมโซมจำนวนหนึ่งเทคโนโลยีนี้ช่วยเพิ่มศักยภาพในการประกอบจีโนมระดับโครโมโซม โดยไม่ต้องมีแผนที่พันธุกรรมตามประชากรจีโนมทุกตัวต้องการ Hi-C
แพลตฟอร์ม：แพลตฟอร์ม Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
การหาลำดับจีโนมของพืช/สัตว์เดอโนโว
เดอโนโวการจัดลำดับหมายถึงการสร้างจีโนมทั้งหมดของสปีชีส์โดยใช้เทคโนโลยีการหาลำดับ เช่น PacBio, Nanopore, NGS เป็นต้น โดยไม่มีจีโนมอ้างอิงการปรับปรุงที่น่าทึ่งในความยาวการอ่านของเทคโนโลยีการหาลำดับรุ่นที่สามได้นำมาซึ่งโอกาสใหม่ในการประกอบจีโนมที่ซับซ้อน เช่น จีโนมที่มีความต่างกันสูง อัตราส่วนของพื้นที่ที่ซ้ำกันในระดับสูง โพลิพลอยด์ ฯลฯ ด้วยความยาวการอ่านที่ระดับหลายสิบกิโลเบส การอ่านลำดับเหล่านี้จึงช่วยให้สามารถอ่านได้ การแก้ไของค์ประกอบที่ซ้ำกัน บริเวณที่มีเนื้อหา GC ผิดปกติ และบริเวณอื่นๆ ที่มีความซับซ้อนสูง
แพลตฟอร์ม: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ แพลตฟอร์ม Illumina NovaSeq
-
การหาลำดับเอกโซมทั้งหมดของมนุษย์
การหาลำดับจากภายนอกทั้งหมด (WES) ถือเป็นกลยุทธ์การหาลำดับที่คุ้มค่าสำหรับการระบุการกลายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรคแม้ว่าเอ็กซอนจะใช้เพียงประมาณ 1.7% ของจีโนมทั้งหมด แต่ก็แสดงถึงโปรไฟล์ของฟังก์ชันโปรตีนทั้งหมดโดยตรงในจีโนมมนุษย์ มีรายงานว่ามากกว่า 85% ของการกลายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องกับโรคเกิดขึ้นในภูมิภาคการเข้ารหัสโปรตีน
BMKGENE นำเสนอบริการหาลำดับเอ็กโซมทั้งหมดของมนุษย์ที่ครอบคลุมและยืดหยุ่น พร้อมด้วยกลยุทธ์การจับเอ็กซอนที่แตกต่างกัน เพื่อให้บรรลุเป้าหมายการวิจัยที่หลากหลาย
แพลตฟอร์ม: แพลตฟอร์ม Illumina NovaSeq
-
ลำดับแฟรกเมนต์ขยายเฉพาะโลคัส (SLAF-Seq)
การสร้างจีโนไทป์ที่มีปริมาณงานสูง โดยเฉพาะอย่างยิ่งในประชากรขนาดใหญ่ เป็นขั้นตอนพื้นฐานในการศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม ซึ่งให้พื้นฐานทางพันธุกรรมสำหรับการค้นพบยีนเชิงหน้าที่ การวิเคราะห์วิวัฒนาการ ฯลฯ แทนที่จะจัดลำดับจีโนมใหม่ทั้งหมดในระดับลึก ลดการจัดลำดับจีโนมที่เป็นตัวแทน (RRGS) ) ได้รับการแนะนำเพื่อลดต้นทุนการจัดลำดับต่อตัวอย่าง ขณะเดียวกันก็รักษาประสิทธิภาพที่เหมาะสมในการค้นพบเครื่องหมายทางพันธุกรรมโดยทั่วไปจะทำได้โดยการแตกส่วนข้อจำกัดภายในช่วงขนาดที่กำหนด ซึ่งเรียกว่าไลบรารีการเป็นตัวแทนแบบลดขนาด (RRL)การจัดลำดับแฟรกเมนต์แบบขยายเฉพาะตำแหน่ง (SLAF-Seq) เป็นกลยุทธ์ที่พัฒนาตนเองสำหรับจีโนไทป์ SNP ที่มีหรือไม่มีจีโนมอ้างอิง
แพลตฟอร์ม: แพลตฟอร์ม Illumina NovaSeq -
อิลลูมินาและบีจีไอ
เทคโนโลยีการจัดลำดับของอิลลูมินาซึ่งมีพื้นฐานมาจาก Sequencing by Sclusion (SBS) เป็นนวัตกรรม NGS ที่ได้รับการยอมรับทั่วโลก โดยมีหน้าที่รับผิดชอบในการสร้างข้อมูลการจัดลำดับทั่วโลกมากกว่า 90%หลักการของ SBS เกี่ยวข้องกับการถ่ายภาพเทอร์มิเนเตอร์แบบพลิกกลับได้ที่มีป้ายกำกับเรืองแสง เมื่อมีการเพิ่ม dNTP แต่ละตัว และต่อมาถูกแยกออกเพื่อให้สามารถรวมตัวของฐานถัดไปได้ด้วย dNTP ที่ถูกผูกมัดกับเทอร์มิเนเตอร์แบบพลิกกลับได้ทั้งสี่ที่มีอยู่ในแต่ละรอบการหาลำดับ การแข่งขันตามธรรมชาติจะลดอคติในการรวมตัวกันให้เหลือน้อยที่สุดเทคโนโลยีอเนกประสงค์นี้รองรับไลบรารีทั้งแบบอ่านเดียวและแบบคู่ เพื่อรองรับการใช้งานด้านจีโนมที่หลากหลายความสามารถในการจัดลำดับอิลลูมินาที่มีปริมาณงานสูงและความแม่นยำถือเป็นรากฐานสำคัญในการวิจัยจีโนมิกส์ ซึ่งช่วยให้นักวิทยาศาสตร์ค้นพบความซับซ้อนของจีโนมด้วยรายละเอียดและประสิทธิภาพที่ไม่มีใครเทียบได้
DNBSEQ ซึ่งพัฒนาโดย BGI เป็นอีกหนึ่งเทคโนโลยี NGS เชิงนวัตกรรมที่สามารถลดต้นทุนการจัดลำดับและเพิ่มปริมาณงานได้การเตรียมห้องสมุด DNBSEQ เกี่ยวข้องกับการแยกส่วน DNA, การเตรียม ssDNA และการขยายวงกลมกลิ้งเพื่อให้ได้ DNA nanoballs (DNB)จากนั้นสิ่งเหล่านี้จะถูกโหลดลงบนพื้นผิวแข็ง และต่อมาถูกจัดลำดับโดยการสังเคราะห์โพรบ-พุกแบบผสมผสาน (cPAS)
บริการจัดลำดับห้องสมุดที่สร้างไว้ล่วงหน้าของเราอำนวยความสะดวกให้ลูกค้าในการเตรียมห้องสมุดจัดลำดับจากแหล่งที่หลากหลาย (mRNA, จีโนมทั้งหมด, แอมพลิคอน และอื่นๆ)จากนั้น ห้องสมุดเหล่านี้สามารถจัดส่งไปยังศูนย์จัดลำดับของเราเพื่อควบคุมคุณภาพและจัดลำดับในแพลตฟอร์ม Illumina หรือ BGI
