-
PacBio-ลำดับแอมพลิคอน 16S/18S/ITS ความยาวเต็ม
แพลตฟอร์ม Amplicon (16S/18S/ITS) ได้รับการพัฒนาด้วยประสบการณ์หลายปีในการวิเคราะห์โครงการความหลากหลายของจุลินทรีย์ ซึ่งประกอบด้วยการวิเคราะห์พื้นฐานที่ได้มาตรฐานและการวิเคราะห์เฉพาะบุคคล: การวิเคราะห์พื้นฐานครอบคลุมเนื้อหาการวิเคราะห์กระแสหลักของการวิจัยจุลินทรีย์ในปัจจุบัน เนื้อหาการวิเคราะห์มีมากมายและครอบคลุม และผลการวิเคราะห์นำเสนอในรูปแบบรายงานโครงการเนื้อหาของการวิเคราะห์ส่วนบุคคลมีความหลากหลายสามารถเลือกตัวอย่างและตั้งค่าพารามิเตอร์ได้อย่างยืดหยุ่นตามรายงานการวิเคราะห์พื้นฐานและวัตถุประสงค์การวิจัย เพื่อให้บรรลุถึงความต้องการส่วนบุคคลระบบปฏิบัติการ Windows ง่ายและรวดเร็ว
-
PacBio-Full-length Transcriptome (ไม่ใช่ข้อมูลอ้างอิง)
การนำข้อมูลลำดับไอโซฟอร์มของ Pacific Biosciences (PacBio) เป็นอินพุต ทำให้แอปนี้สามารถระบุลำดับการถอดเสียงแบบเต็มความยาวได้ (โดยไม่ต้องประกอบ)ด้วยการแมปลำดับความยาวเต็มกับจีโนมอ้างอิง การถอดเสียงสามารถปรับให้เหมาะสมโดยยีนที่รู้จัก การถอดเสียง บริเวณการเข้ารหัส ฯลฯ ในกรณีนี้ สามารถระบุโครงสร้าง mRNA ได้แม่นยำยิ่งขึ้น เช่น การต่อรอยทางเลือก ฯลฯการวิเคราะห์ร่วมกับข้อมูลลำดับการถอดเสียงของ NGS ช่วยให้คำอธิบายประกอบครอบคลุมมากขึ้นและการหาปริมาณที่แม่นยำยิ่งขึ้นในการแสดงออกที่ระดับการถอดเสียง ซึ่งเป็นประโยชน์อย่างมากต่อการแสดงออกเชิงอนุพันธ์ขั้นปลายน้ำและการวิเคราะห์เชิงฟังก์ชัน
-
ชุดเครื่องมือ
BMKCloud เป็นแพลตฟอร์มชีวสารสนเทศชั้นนำที่ให้บริการโซลูชั่นแบบครบวงจรสำหรับโปรแกรมจีโนม ซึ่งได้รับการไว้วางใจอย่างกว้างขวางจากนักวิจัยในสาขาต่างๆ รวมถึงการแพทย์ การเกษตร สิ่งแวดล้อม ฯลฯ BMKCloud มุ่งมั่นที่จะให้บริการที่บูรณาการ เชื่อถือได้ และมีประสิทธิภาพ รวมถึงแพลตฟอร์มและเครื่องมือการวิเคราะห์ชีวสารสนเทศ , ทรัพยากรคอมพิวเตอร์, ฐานข้อมูลสาธารณะ, หลักสูตรออนไลน์ด้านชีวสารสนเทศศาสตร์ ฯลฯ BMKCloud มีเครื่องมือทางชีวสารสนเทศที่ใช้บ่อยมากมายซึ่งรวมถึงคำอธิบายประกอบของยีน, เครื่องมือทางพันธุกรรมเชิงวิวัฒนาการ, ncRNA, การควบคุมคุณภาพข้อมูล, การประกอบ, การจัดตำแหน่ง, การดึงข้อมูล, การกลายพันธุ์, สถิติ, เครื่องกำเนิดรูป, ลำดับ การวิเคราะห์ ฯลฯ
-
อาร์เอ็นเอขนาดเล็ก
RNA ขนาดเล็กเป็น RNA ประเภทสั้นที่ไม่มีการเข้ารหัส ซึ่งมีความยาวเฉลี่ย 18-30 nt รวมถึง miRNA, siRNA และ piRNARNA ขนาดเล็กเหล่านี้ได้รับการรายงานอย่างหนาแน่นว่าเกี่ยวข้องกับกระบวนการทางชีวภาพต่างๆ เช่น การย่อยสลาย mRNA การยับยั้งการแปล การสร้างเฮเทอโรโครมาติน เป็นต้น การวิเคราะห์ลำดับ SmallRNA ถูกนำมาใช้กันอย่างแพร่หลายในการศึกษาเกี่ยวกับการพัฒนาของสัตว์/พืช โรค ไวรัส ฯลฯ RNA ขนาดเล็ก แพลตฟอร์มการวิเคราะห์ลำดับประกอบด้วยการวิเคราะห์มาตรฐานและการขุดข้อมูลขั้นสูงจากข้อมูล RNA-seq การวิเคราะห์มาตรฐานสามารถบรรลุการระบุและการทำนาย miRNA การทำนายยีนเป้าหมาย miRNA คำอธิบายประกอบ และการวิเคราะห์การแสดงออกการวิเคราะห์ขั้นสูงช่วยให้สามารถค้นหาและแยก miRNA แบบกำหนดเอง การสร้างไดอะแกรมเวนน์ miRNA และการสร้างเครือข่ายยีนเป้าหมาย
-
NGS-WGS (อิลูมินา/BGI)
NGS-WGS เป็นแพลตฟอร์มการวิเคราะห์ลำดับจีโนมทั้งหมด ซึ่งพัฒนาขึ้นจากประสบการณ์อันยาวนานใน Biomarker Technologiesแพลตฟอร์มที่ใช้งานง่ายนี้ช่วยให้ส่งขั้นตอนการวิเคราะห์แบบบูรณาการได้อย่างรวดเร็ว เพียงตั้งค่าพารามิเตอร์พื้นฐานเพียงไม่กี่ตัว ซึ่งเหมาะกับข้อมูลลำดับดีเอ็นเอที่สร้างจากทั้งแพลตฟอร์ม Illumina และแพลตฟอร์มการจัดลำดับ BGIแพลตฟอร์มนี้ถูกปรับใช้บนเซิร์ฟเวอร์คอมพิวเตอร์ประสิทธิภาพสูง ซึ่งช่วยให้การวิเคราะห์ข้อมูลที่มีประสิทธิภาพสูงในเวลาที่จำกัดมากการทำเหมืองข้อมูลส่วนบุคคลนั้นมีให้ใช้งานบนพื้นฐานของการวิเคราะห์มาตรฐาน ซึ่งรวมถึงการสืบค้นยีนที่กลายพันธุ์ การออกแบบไพรเมอร์ PCR เป็นต้น
-
mRNA (อ้างอิง)
Transcriptome คือการเชื่อมโยงระหว่างข้อมูลทางพันธุกรรมของจีโนมและโปรตีโอมของการทำงานทางชีววิทยาการควบคุมระดับการถอดเสียงเป็นวิธีการควบคุมสิ่งมีชีวิตที่สำคัญที่สุดและได้รับการศึกษาอย่างกว้างขวางที่สุดการจัดลำดับทรานสคริปโตมสามารถจัดลำดับทรานสคริปโตม ณ เวลาใดก็ได้หรือภายใต้เงื่อนไขใดๆ ด้วยความละเอียดที่แม่นยำถึงนิวคลีโอไทด์เดี่ยว ซึ่งสามารถสะท้อนระดับการถอดรหัสยีนแบบไดนามิก พร้อมระบุและระบุปริมาณการถอดเสียงปกติและหายาก และให้ข้อมูลโครงสร้างของ ตัวอย่างใบรับรองผลการเรียนเฉพาะ
ปัจจุบัน เทคโนโลยีการหาลำดับการถอดเสียงถูกนำมาใช้กันอย่างแพร่หลายในด้านพืชไร่ การแพทย์ และการวิจัยอื่นๆ รวมถึงการควบคุมการพัฒนาสัตว์และพืช การปรับตัวด้านสิ่งแวดล้อม ปฏิสัมพันธ์ของภูมิคุ้มกัน การแปลยีนเฉพาะที่ วิวัฒนาการทางพันธุกรรมของสายพันธุ์ และการตรวจหาเนื้องอกและโรคทางพันธุกรรม
-
เมเทโนมิกส์ (NGS)
แพลตฟอร์มการวิเคราะห์นี้ได้รับการออกแบบสำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลเมทาโนมิกส์ของปืนลูกซองตามประสบการณ์หลายปีประกอบด้วยขั้นตอนการทำงานแบบบูรณาการที่มีการวิเคราะห์เมตาจีโนมที่จำเป็นทั่วไปต่างๆ รวมถึงการประมวลผลข้อมูล การศึกษาระดับสปีชีส์ การศึกษาระดับการทำงานของยีน การรวมเมตาจีโนม ฯลฯ นอกจากนี้ เครื่องมือการทำเหมืองข้อมูลแบบกำหนดเองยังพร้อมใช้งานตามขั้นตอนการวิเคราะห์มาตรฐาน รวมถึงการสืบค้นยีนและสปีชีส์ , การตั้งค่าพารามิเตอร์, การสร้างตัวเลขส่วนบุคคล ฯลฯ
-
LncRNA
RNA แบบไม่เข้ารหัสแบบยาว (lncRNA) เป็นทรานสคริปต์ประเภทหนึ่งที่มีความยาวมากกว่า 200 nt ซึ่งไม่สามารถเข้ารหัสโปรตีนได้หลักฐานสะสมชี้ให้เห็นว่า lncRNA ส่วนใหญ่มีแนวโน้มที่จะใช้งานได้มากเทคโนโลยีการหาลำดับความเร็วสูงและเครื่องมือวิเคราะห์ชีวสารสนเทศช่วยให้เราสามารถเปิดเผยลำดับ lncRNA และข้อมูลตำแหน่งได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้น และนำเราไปสู่การค้นพบ lncRNA ที่มีหน้าที่กำกับดูแลที่สำคัญBMKCloud มีความภูมิใจที่จะมอบแพลตฟอร์มการวิเคราะห์ลำดับ lncRNA ให้กับลูกค้าของเรา เพื่อให้บรรลุการวิเคราะห์ lncRNA ที่รวดเร็ว เชื่อถือได้ และยืดหยุ่น
-
กวาส
การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนม (GWAS) มีวัตถุประสงค์เพื่อระบุความแปรปรวนทางพันธุกรรม (จีโนไทป์) ที่เกี่ยวข้องกับลักษณะเฉพาะ (ฟีโนไทป์)การศึกษาของ GWA จะตรวจสอบเครื่องหมายทางพันธุกรรมข้ามจีโนมทั้งหมดของบุคคลจำนวนมาก และคาดการณ์ความสัมพันธ์ของจีโนไทป์-ฟีโนไทป์โดยการวิเคราะห์ทางสถิติในระดับประชากรการหาลำดับจีโนมทั้งหมดสามารถค้นพบตัวแปรทางพันธุกรรมทั้งหมดได้เมื่อจับคู่กับข้อมูลฟีโนไทป์ GWAS สามารถประมวลผลเพื่อระบุ SNP, QTL และยีนที่เกี่ยวข้องกับฟีโนไทป์ได้ ซึ่งสนับสนุนการปรับปรุงพันธุ์สัตว์/พืชสมัยใหม่อย่างยิ่งSLAF เป็นกลยุทธ์การจัดลำดับจีโนมแบบง่ายที่พัฒนาขึ้นเอง ซึ่งค้นพบ SNP ซึ่งเป็นเครื่องหมายกระจายทั่วทั้งจีโนมSNP เหล่านี้ในฐานะเครื่องหมายทางพันธุกรรมระดับโมเลกุลสามารถนำไปประมวลผลสำหรับการศึกษาการเชื่อมโยงกับลักษณะเป้าหมายได้เป็นกลยุทธ์ที่คุ้มค่าในการระบุลักษณะที่ซับซ้อนที่เกี่ยวข้องกับความแปรปรวนทางพันธุกรรม
-
นาโนพอร์ ทรานสคริปโตมิกส์แบบเต็มความยาว
ไอโซฟอร์มทางเลือกที่ซับซ้อนและแปรผันในสิ่งมีชีวิตเป็นกลไกทางพันธุกรรมที่สำคัญในการควบคุมการแสดงออกของยีนและความหลากหลายของโปรตีนการระบุโครงสร้างการถอดเสียงที่แม่นยำเป็นพื้นฐานสำหรับการศึกษาเชิงลึกเกี่ยวกับรูปแบบการควบคุมการแสดงออกของยีนแพลตฟอร์มการหาลำดับนาโนพอร์ได้นำการศึกษาการถอดเสียงไปสู่ระดับไอโซฟอร์มได้สำเร็จแพลตฟอร์มการวิเคราะห์นี้ออกแบบมาเพื่อวิเคราะห์ข้อมูล RNA-Seq ที่สร้างขึ้นบนแพลตฟอร์ม Nanopore บนฐานของจีโนมอ้างอิง ซึ่งช่วยให้บรรลุการวิเคราะห์เชิงคุณภาพและเชิงปริมาณทั้งในระดับยีนและระดับการถอดเสียง
-
เซอร์-อาร์เอ็นเอ
RNA แบบวงกลม (circRNA) เป็น RNA ชนิดหนึ่งที่ไม่เข้ารหัส ซึ่งเพิ่งพบว่ามีบทบาทสำคัญในเครือข่ายการกำกับดูแลที่เกี่ยวข้องกับการพัฒนา การต้านทานต่อสิ่งแวดล้อม ฯลฯ แตกต่างจากโมเลกุล RNA เชิงเส้น เช่น mRNA, lncRNA, 3′ และ 5′ ส่วนปลายของ circRNA ถูกรวมเข้าด้วยกันเพื่อสร้างโครงสร้างทรงกลม ซึ่งช่วยไม่ให้พวกมันย่อย exonuclease และมีความเสถียรมากกว่า RNA เชิงเส้นส่วนใหญ่พบว่า CircRNA มีหน้าที่ที่หลากหลายในการควบคุมการแสดงออกของยีนCircRNA สามารถทำหน้าที่เป็น ceRNA ซึ่งจับ miRNA ในการแข่งขันหรือที่เรียกว่า miRNA Spongeแพลตฟอร์มการวิเคราะห์ลำดับ CircRNA เสริมศักยภาพให้กับโครงสร้าง circRNA และการวิเคราะห์การแสดงออก การทำนายเป้าหมาย และการวิเคราะห์ร่วมกับโมเลกุล RNA ประเภทอื่นๆ
-
บีเอสเอ
แพลตฟอร์มการวิเคราะห์แยกกลุ่มแบบเป็นกลุ่มประกอบด้วยการวิเคราะห์มาตรฐานในขั้นตอนเดียวและการวิเคราะห์ขั้นสูงพร้อมการตั้งค่าพารามิเตอร์ที่กำหนดเองBSA เป็นเทคนิคที่ใช้ในการระบุเครื่องหมายทางพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับฟีโนไทป์อย่างรวดเร็วขั้นตอนการทำงานหลักของ BSA ประกอบด้วย: 1. การเลือกกลุ่มบุคคลสองกลุ่มที่มีฟีโนไทป์ที่ขัดแย้งกันอย่างมาก;2. การรวม DNA, RNA หรือ SLAF-seq (พัฒนาโดย Biomarker) ของบุคคลทั้งหมดเพื่อสร้าง DNA สองกลุ่ม;3. การระบุลำดับที่แตกต่างกับจีโนมอ้างอิงหรือระหว่างนั้น 4. การทำนายขอบเขตที่เชื่อมโยงของผู้สมัครโดยอัลกอริธึม ED และ SNP-index;5. การวิเคราะห์เชิงหน้าที่และการเพิ่มคุณค่าของยีนในภูมิภาคผู้สมัคร ฯลฯ นอกจากนี้ยังมีการทำเหมืองข้อมูลขั้นสูงเพิ่มเติม รวมถึงการคัดกรองเครื่องหมายทางพันธุกรรมและการออกแบบไพรเมอร์
