แม้ว่าการจัดลำดับ mRNA ที่ใช้ NGS จะทำหน้าที่เป็นเครื่องมืออเนกประสงค์สำหรับการวัดปริมาณการแสดงออกของยีน แต่การพึ่งพาการอ่านแบบสั้นจะจำกัดประสิทธิภาพในการวิเคราะห์การถอดเสียงที่ซับซ้อนในทางกลับกัน PacBio sequencing (Iso-Seq) ใช้เทคโนโลยีการอ่านระยะยาว ซึ่งช่วยให้สามารถจัดลำดับการถอดเสียง mRNA แบบเต็มความยาวได้วิธีการนี้อำนวยความสะดวกในการสำรวจที่ครอบคลุมของการประกบทางเลือก การหลอมรวมของยีน และโพลีอะดีนิเลชัน แม้ว่าจะไม่ใช่ตัวเลือกหลักสำหรับปริมาณการแสดงออกของยีนการรวมกัน 2+3 เชื่อมช่องว่างระหว่าง Illumina และ PacBio โดยอาศัย PacBio HiFi อ่านเพื่อระบุชุดที่สมบูรณ์ของไอโซฟอร์มการถอดเสียงและการจัดลำดับ NGS สำหรับการหาปริมาณของไอโซฟอร์มเดียวกัน
แพลตฟอร์ม: PacBio Sequel II และ Illumina NovaSeq