ข่าว

การขยายองค์ประกอบ Transposable (TE) ได้รับการยอมรับว่าเป็นแรงผลักดันที่เป็นสื่อกลางในการขยายขนาดจีโนมและวิวัฒนาการ แต่ผลที่ตามมาสำหรับการสร้างสถาปัตยกรรมจีโนม 3 มิติยังไม่เป็นที่ทราบแน่ชัดในพืชที่นี่ เรารายงานการประกอบจีโนมระดับอ้างอิงสำหรับฝ้ายสามสายพันธุ์ซึ่งมีขนาดจีโนมสามเท่า กล่าวคือGossypium rotundifolium(K2)ช. สวนรุกขชาติ(A2) และก. ไรมอนดี(D5) โดยใช้เทคโนโลยี Oxford Nanoporeการวิเคราะห์จีโนมเปรียบเทียบบันทึกรายละเอียดของการขยาย TE เฉพาะเชื้อสายซึ่งมีส่วนทำให้เกิดความแตกต่างของขนาดจีโนมขนาดใหญ่ (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb) และบ่งชี้เนื้อหายีนที่ได้รับการอนุรักษ์ค่อนข้างและความสัมพันธ์ระหว่างจีโนมเราพบว่าประมาณ 17% ของยีนสังเคราะห์แสดงการเปลี่ยนแปลงสถานะโครมาตินระหว่างช่องที่ใช้งาน (“ A”) และที่ไม่ได้ใช้งาน (“ B”) และการขยาย TE นั้นสัมพันธ์กับการเพิ่มสัดส่วนของช่อง A ในบริเวณยีน (~ 7,000 ยีน ) ใน K2 และ A2 สัมพันธ์กับ D5มีเพียง 42% ของขอบเขตโดเมนที่เชื่อมโยงทอพอโลยี (TAD) เท่านั้นที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้ในจีโนมทั้งสามข้อมูลของเราเกี่ยวข้องกับการขยาย TE ล่าสุดหลังจากการก่อตัวของขอบเขต TAD เฉพาะเชื้อสายการศึกษาครั้งนี้ให้ความกระจ่างเกี่ยวกับบทบาทของการขยายตัวของจีโนมที่ใช้สื่อกลางระหว่างทรานสโพสันในการวิวัฒนาการของโครงสร้างโครมาตินที่มีลำดับสูงกว่าในพืช