จีโนม
การประกอบระดับโครโมโซมและการวิเคราะห์จีโนม Miscanthus lutarioriparius ของพืชชีวมวล
ลำดับนาโนพอร์ |อิลลูมินา |ไฮ-ซี |ลำดับ RNA |สายวิวัฒนาการ
ในการศึกษานี้ Biomarker Technologies ให้การสนับสนุนทางเทคนิคเกี่ยวกับการหาลำดับนาโนพอร์ การประกอบจีโนมแบบเดอโนโว การประกอบแบบช่วยด้วย Hi-C เป็นต้น
เชิงนามธรรม
มิสแคนทัสซึ่งเป็นพืชยืนต้นที่มีเหง้า มีศักยภาพในการผลิตพลังงานชีวภาพได้ดีเนื่องจากมีมวลชีวภาพสูงและทนต่อความเครียดได้เรารายงานการประกอบระดับโครโมโซมของMiscanthus lutarioripariusจีโนมโดยการรวมลำดับ Oxford Nanopore และเทคโนโลยี Hi-Cชุดประกอบ 2.07-Gb ครอบคลุม 96.64% ของจีโนม โดยมี contig N50 เท่ากับ 1.71 Mbลำดับเซนโทรเมียร์และเทโลเมียร์ถูกประกอบขึ้นสำหรับโครโมโซมทั้ง 19 โครโมโซมและโครโมโซม 10 ตามลำดับต้นกำเนิด Allotetraploid ของ M. lutarioriparius ได้รับการยืนยันโดยใช้ดาวเทียมเซนโตรเมอริกซ้ำโครงสร้างจีโนมเตตราพลอยด์และการจัดเรียงโครโมโซมใหม่หลายอย่างที่สัมพันธ์กับข้าวฟ่างแสดงให้เห็นอย่างชัดเจนยีนที่ซ้ำกันของM. lutarioripariusไม่เพียงแต่ในแง่ของการตอบสนองต่อความเครียดเท่านั้น แต่ยังมีการสังเคราะห์ทางชีวภาพของผนังเซลล์อีกด้วยตระกูลยีนที่เกี่ยวข้องกับความต้านทานโรค การสังเคราะห์ผนังเซลล์ และการขนส่งไอออนของโลหะได้รับการขยายและพัฒนาอย่างมากการขยายตัวของตระกูลเหล่านี้อาจเป็นพื้นฐานทางจีโนมที่สำคัญสำหรับการปรับปรุงลักษณะเด่นของM. lutarioriparius.
สถิติสำคัญของการประกอบจีโนม
รูป.ภาพรวมของชุดประกอบจีโนม M. lutarioriparius
ข่าวสารและไฮไลท์ มุ่งหวังที่จะแบ่งปันกรณีศึกษาที่ประสบความสำเร็จล่าสุดกับ Biomarker Technologies เพื่อรวบรวมความสำเร็จทางวิทยาศาสตร์ใหม่ๆ รวมถึงเทคนิคที่โดดเด่นที่นำไปใช้ในระหว่างการศึกษา
เวลาโพสต์: Jan-05-2022