BMKGENE ให้บริการจัดลำดับการถอดเสียงแบบเต็มความยาวโดยใช้เทคโนโลยี PacBio และ ONT สำหรับการศึกษาเรื่อง "การวิเคราะห์เปรียบเทียบของวิธีจัดลำดับ PacBio และ ONT RNA สำหรับการระบุพิษของ Nemopilema Nomurai" ซึ่งได้รับการตีพิมพ์ในวารสาร Genomicsการศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อเปรียบเทียบประสิทธิผลของวิธีการหาลำดับ PacBio และ ONT RNA ในการระบุพิษของแมงกะพรุนสายพันธุ์ Nemopilema nomurai
ผลการวิจัยชี้ให้เห็นว่า โดยทั่วไปแล้ว ONT ให้คุณภาพข้อมูลดิบที่สูงขึ้นในการวิเคราะห์ทรานสคริปโตม ในขณะที่ PacBio สร้างความยาวการอ่านที่ยาวขึ้นพบว่า PacBio มีความเหนือกว่าในการระบุลำดับการเข้ารหัสและ RNA ที่ไม่มีการเข้ารหัสแบบสายโซ่ยาว ในขณะที่ ONT คุ้มค่ากว่าในการทำนายเหตุการณ์การต่อรอยทางเลือก การทำซ้ำของลำดับอย่างง่าย และปัจจัยการถอดรหัส
การศึกษานี้มีนัยสำคัญสำหรับเทคโนโลยีการหาลำดับในอนาคตในแมงกะพรุนในทะเล และเน้นย้ำถึงพลังของการวิเคราะห์ทรานสคริปโตมแบบเต็มความยาวในการค้นพบเป้าหมายการรักษาที่เป็นไปได้สำหรับโรคผิวหนังแมงกะพรุน
คลิกที่นี่เพื่อเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับบทความนี้
เวลาโพสต์: Dec-20-2023