สิ่งตีพิมพ์ที่โดดเด่น

เจาะลึกถึงศักยภาพของการศึกษาวิจัยหลากหลายสายพันธุ์ ตัวอย่างจากกรณีสำคัญจากลูกค้าของ BMKGENEบทความเรื่อง “Chromosome-level Wild Hevea brasiliensis Genome: Empowering Genomic-Assisted Breeding and Unearthing Vital Loci for Elevated Rubber Yield” ซึ่งตีพิมพ์เมื่อเร็วๆ นี้ในวารสารเทคโนโลยีชีวภาพพืช ฉบับปีนี้ ถือเป็นข้อมูลอ้างอิงอันทรงคุณค่า

ต้นยางบราซิล (Hevea brasiliensis) ตั้งตระหง่านในฐานะแหล่งยางธรรมชาติที่สำคัญตลอดศตวรรษที่ผ่านมา วิธีการผสมพันธุ์แบบดั้งเดิมกระตุ้นให้เกิดการผลิตยางเพิ่มขึ้นถึงหกเท่าอย่างไรก็ตาม ข้อเท็จจริงทางพันธุกรรมที่ซ่อนอยู่ซึ่งรับผิดชอบในการเพิ่มผลผลิตยางยังคงเป็นปริศนา

การศึกษานี้เริ่มต้นในการสร้างจีโนมระดับโครโมโซมสำหรับต้นยางธรรมชาติ โดยใช้การทำงานร่วมกันของลำดับการอ่านแบบยาวของ Nanopore, ลำดับของ Illumina NGS และเทคโนโลยี Hi-C

ในเวลาเดียวกัน แหล่งทรัพยากรพันธุกรรม 147 รายการ ครอบคลุมพันธุ์พืชที่ให้ผลผลิตสูง สายพันธุ์ธรรมชาติ และสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้อง ได้รับการรวบรวมเพื่อการจัดลำดับจีโนมทั้งหมด (WGS) อย่างครอบคลุมโดยใช้แพลตฟอร์มของอิลลูมินาข้อมูลลำดับที่ตามมาได้รับการวิเคราะห์ทางพันธุศาสตร์ประชากรที่เข้มงวด ซึ่งช่วยให้สามารถแยกโครงสร้างประชากร ความหลากหลาย และความไม่สมดุลของการเชื่อมโยงได้การวิเคราะห์นี้ให้ความกระจ่างเกี่ยวกับความผันแปรของการเลี้ยงในบ้านในประชากรต่างๆ

การตรวจสอบเพิ่มเติมครอบคลุมการวิเคราะห์ครอบคลุม Fst, π, D ของ Tajima และ LD โดยมีจุดมุ่งหมายเพื่อเปิดเผยสัญญาณการคัดเลือกที่เกิดจากผลผลิตน้ำยางที่ดีขึ้น โดยเฉพาะอย่างยิ่งการมุ่งเน้นไปที่โคลนของ Wickham

เมื่อถึงจุดสูงสุดในการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนม (GWAS) เครื่องหมายที่เชื่อมโยงกับลักษณะของผลผลิตและต่อมายีนที่เกี่ยวข้องกับผลผลิตก็ถูกระบุการตรวจสอบความถูกต้องเบื้องต้นเปิดเผยกิจกรรมการถอดเสียงที่โดดเด่นในการกลายพันธุ์ที่แตกต่างกันสำหรับยีน ERF สองตัว โดยให้ภาพรวมเบื้องต้นเกี่ยวกับความสำคัญเชิงหน้าที่ของพวกมันการยืนยันเพิ่มเติมมีกำหนดไว้ในการวิจัยที่กำลังจะมีขึ้น

BMKGENE มีความภาคภูมิใจในการมีส่วนร่วมในการจัดลำดับจีโนมทั้งหมดอย่างกว้างขวางของประชากรจำนวนมากนี้ พร้อมด้วยบทบาทสำคัญในการวิเคราะห์ชีวสารสนเทศศาสตร์ประสบการณ์อันกว้างขวางของเราครอบคลุมถึงการจัดลำดับ NGS/TGS และการวิเคราะห์ชีวสารสนเทศศาสตร์แบบพหุโทมิกส์ในสายพันธุ์มากกว่า 1,000 สายพันธุ์เราหวังว่าจะมีโอกาสได้เป็นพันธมิตรกับคุณในโครงการที่กำลังจะมาถึง

คลิกที่นี่เพื่อเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับการศึกษาครั้งนี้