สินค้า

การหาลำดับ DNA/RNA – ลำดับนาโนพอร์

การจัดลำดับ DNA/RNA – รูปภาพเด่นของลำดับนาโนพอร์

การจัดลำดับ ONT เป็นเทคโนโลยีการจัดลำดับสัญญาณไฟฟ้าแบบเรียลไทม์โมเลกุลเดี่ยวที่ใช้นาโนพอร์ หลักการเรียงลำดับของแต่ละแพลตฟอร์มจะเหมือนกันDNA/RNA แบบเกลียวคู่จะจับกับโปรตีนที่มีรูพรุนระดับนาโนที่ฝังอยู่ในแผ่นชีวะและคลี่คลายภายใต้ตะกั่วของโปรตีนมอเตอร์ ภายใต้การกระทำของแรงดันไฟฟ้าที่แตกต่างกันจากทั้งสองด้านของแผ่นชีวะ เส้น DNA/RNA จะผ่านโปรตีนช่องนาโนพอร์ในระดับหนึ่ง ประเมิน.เนื่องจากคุณสมบัติทางเคมีของเบสต่างๆ บนสาย DNA/RNA นั้นแตกต่างกัน เมื่อเบสหรือโมเลกุล DNA เดี่ยวผ่านช่องนาโนพอร์ จะทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงของสัญญาณไฟฟ้าต่างๆด้วยการตรวจจับและสอดคล้องกับสัญญาณเหล่านี้ จึงสามารถคำนวณประเภทฐานที่สอดคล้องกันได้ และการตรวจจับลำดับแบบเรียลไทม์ก็เสร็จสมบูรณ์ได้

ติดต่อเรา

รายละเอียดบริการ

ผลการสาธิต

คุณสมบัติรายละเอียดการบริการ

แพลตฟอร์ม	ขนาดห้องสมุด	ผลผลิตข้อมูลทางทฤษฎี (ต่อเซลล์)	ความแม่นยำแบบฐานเดียว	การใช้งาน
นาโนพอร์	8Kb, 10kb, 20kb, ยาวพิเศษ, cDNA-PCR	70-90Gb/เซลล์	85-92%	การโทร SV, เดอโนโว, การหาลำดับแบบเต็มความยาว, Iso-Seq, คำอธิบายประกอบของยีน, การตรวจหา DNA methylation

ข้อดีของการบริการ

● ประสบการณ์มากกว่า 5 ปีบนแพลตฟอร์มการจัดลำดับ PacBio กับโปรเจ็กต์ที่ปิดไปแล้วหลายพันโปรเจ็กต์ในสายพันธุ์ต่างๆ
● BMKGENE เป็นพันธมิตรอย่างเป็นทางการของ Oxford Nanopore พร้อมการรับรอง RNA/DNA แพลตฟอร์มคู่
● มีโมเดลทั่วไปของซีเควนเซอร์ที่มีอุปกรณ์ครบครันและมีปริมาณงานในการหาลำดับที่เพียงพอ
● จากแพลตฟอร์ม Nanopore งานวิจัยของ Denovo เกี่ยวกับสัตว์และพืชมากกว่า 10 ชิ้นได้รับการตีพิมพ์ในวารสารที่มีชื่อเสียงระดับนานาชาติ

ข้อกำหนดตัวอย่าง

ประเภทตัวอย่าง

จำนวน

ความเข้มข้น(Qubit ®)

ปริมาณ

ความบริสุทธิ์

คนอื่น

จีโนมดีเอ็นเอ

ขึ้นอยู่กับความต้องการข้อมูล

≥20ng/ไมโครลิตร

≥15ไมโครลิตร

โอดี260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

ชัดเจนสูงสุดที่ 260 นาโนเมตร ไม่มีการปนเปื้อน

ความเข้มข้นต้องวัดด้วย Qubit และ Qubit/Nanopore ≤ 2

อาร์เอ็นเอทั้งหมด

≥1.2ไมโครกรัม

≥100ไมโครกรัม/ไมโครลิตร

≥15ไมโครลิตร

โอดี260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5 ไม่มีการปนเปื้อน

ค่าริน ≥7.5

ขั้นตอนการบริการ

การจัดเตรียมตัวอย่าง

การก่อสร้างห้องสมุด

การเรียงลำดับ

การวิเคราะห์ข้อมูล

การส่งมอบโครงการ

ก่อนหน้า: การจัดลำดับ DNA/RNA – ตัวจัดลำดับอิลลูมินา

ต่อไป: ลำดับแฟรกเมนต์ขยายเฉพาะโลคัส (SLAF-Seq)

การประเมินคุณภาพข้อมูลของตัวอย่าง DNA

ตารางที่ 1. สถิติเกี่ยวกับข้อมูลที่สะอาด

บีเอ็มคิด	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	สะอาดN50เลน	ทำความสะอาด N90Len	cleanMeanLen	คลีนแม็กซ์เลน	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9

การประเมินคุณภาพข้อมูลของตัวอย่าง RNA

ตารางที่ 1. สถิติเกี่ยวกับข้อมูลที่สะอาด

ชื่อไฟล์	รหัสลูกค้า	อ่านหมายเลข	หมายเลขฐาน	N50	ความยาวเฉลี่ย	MaxLength	มีนคิวสกอร์
RNA_BMK001	C2	8,947,708	4,047,230,083	398	452	129,227	คำถามที่ 12