Маҳсулот

пайдарпайии РНК прокариотӣ

Пайдарпайвандии РНК-и прокариотӣ Тасвири пешниҳодшуда

Пайдарпайвандии РНК прокариотӣ пайдарпайии насли оянда (NGS) -ро барои ошкор кардани мавҷудият ва миқдори РНК дар лаҳзаи додашуда тавассути таҳлили тағирёбандаи транскриптомияи ҳуҷайра истифода мебарад.Пайдарпайвандии прокариотҳои РНК-и ширкати мо, махсусан ба прокариотҳои дорои геномҳои истинодӣ нигаронида шудааст, ки ба шумо профили транскриптом, таҳлили сохтори генҳо ва ғайра пешниҳод мекунад. Он ба таври васеъ барои таҳқиқоти асосии илм, таҳқиқот ва таҳияи маводи мухаддир ва ғайра истифода шудааст.

Платформа: Платформаи Illumina NovaSeq

Бо мо тамос гиред

Тафсилоти хидмат

Мушаххасоти хадамот

Платформа: платформаи Illumina NovaSeq, PE150

Навъи китобхона: 350bp китобхонаи cDNA-ро ворид кунед (вобаста ба паҳншавии қулла)

Стратегияи пайдарпаӣ: ҷуфтшуда-Анҷоми 150 bp

Ҳаҷми маълумоти тавсияшаванда: 2 Гб маълумоти хом/намуна

Биоинформатика

(1) Назорати сифати маълумотҳои пайдарпай: Тақсимоти нуклеотидҳо, Тақсимоти сифати асосӣ, арзёбии таносуби rRNA;

(2) Тањлили њамоњангсозии пайдарпай: омори натиљаи њамоњангсозї, сершавии пайдарпай, фарогирии пайдарпай;

(3) Аннотацияи геномҳои истинод (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) Таҳлили ифода: Тақсимоти ифода (Бо ду ё зиёда намуна), Таҳлили ифода байни намунаҳо (Таҳлили Венн, Таҳлили коррелятсионӣ, таҳлили PCA);

(5) Таҳлили ифодаи дифференсиалӣ (Бо ду ё зиёда намуна);

(6) Таҳлили маҷмӯи генҳо: Таҳлили Венн, Таҳлили кластерӣ, Таҳлили аннотацияи функсия (COG, GO, KEGG), Таҳлили ғанисозии функсия (GO, KEGG), Графикаи ғанисозии функсияҳо, таҳлили Ipath;

(7) Таҳлили sRNA: пешгӯии sRNA, шарҳи sRNA (Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), пешгӯии сохтори дуюмдараҷаи sRNA, пешгӯии гени ҳадафи sRNA;

(8) Таҳлили сохтори транскрипт: Таҳлили оперон, пешгӯии сайтҳои оғоз ва анҷоми транскрипт, эзоҳ ва таҳлили UTR, пешгӯии пайдарпаии промотер, таҳлили SNP/InDel (аннотацияи SNP/InDel, тақсимоти минтақавии SNP/InDel, омори SNP).