-
Пайдарпаии метагеномӣ -NGS
Метагеном ба маҷмӯаи маводи умумии генетикии ҷомеаи омехтаи организмҳо, ба монанди метагеномҳои муҳити зист, метагеномҳои инсон ва ғ. дахл дорад. Он дорои геномҳои микроорганизмҳои киштшаванда ва коркарднашаванда мебошад.Пайдарпаии метагеномӣ воситаи молекулавӣ барои таҳлили маводи омехтаи геномии аз намунаҳои муҳити зист истихроҷшуда мебошад, ки дар бораи гуногунрангӣ ва фаровонии намудҳо, сохтори популятсия, робитаи филогенетикӣ, генҳои функсионалӣ ва шабакаи коррелятсия бо омилҳои муҳити зист маълумоти муфассал медиҳад.
Платформа:Платформаи Illumina NovaSeq
-
Пайдарпаии метагеномӣ-Нанопур
Метагеномика як воситаи молекулавӣ барои таҳлили маводи омехтаи геномии аз намунаҳои муҳити зист истихроҷшуда мебошад, ки маълумоти муфассалро дар бораи гуногунрангӣ ва фаровонии намудҳо, сохтори популятсия, робитаи филогенетикӣ, генҳои функсионалӣ ва шабакаи коррелятсия бо омилҳои муҳити зист ва ғайра медиҳад. ба омӯзиши метагеномӣ.Фаъолияти барҷастаи он дар дарозии хониш ба таври назаррас таҳлили метагеномии поёнӣ, бахусус маҷмӯаи метагеномҳоро такмил дод.Бо истифода аз бартариҳои дарозии хондан, омӯзиши метагеномии нанопоре қодир аст, ки дар муқоиса бо метагеномикаи тирандозӣ пайваста бештар ҷамъоварӣ кунад.Интишор шудааст, ки метагеномика дар асоси нанопор геномҳои пурра ва пӯшидаи бактерияҳоро аз микробиомаҳо бомуваффақият тавлид кардааст (Moss, EL, et.Биотехнологияи табиат, 2020)
Платформа:Nanopore PromethION P48
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Зершӯъбаи 16S ва 18S rRNA, ки ҳам минтақаҳои хеле ҳифзшуда ва ҳам гипертағйирёбанда доранд, изи ангуштони молекулавӣ барои муайян кардани организмҳои прокариотӣ ва эукариотӣ мебошад.Бо истифода аз пайдарпайӣ, ин ампликонҳоро метавон дар асоси қисмҳои ҳифзшуда ҳадаф қарор дод ва минтақаҳои гипертағйирёбандаро пурра барои муайянкунии микробҳо тавсиф кардан мумкин аст, ки ба таҳқиқоти таҳлили гуногунии микробҳо, таксономия, филогения ва ғайра мусоидат мекунанд. ) пайдарпайии платформаи PacBio имкон медиҳад, ки хондани хеле дақиқи дароз, ки ампликонҳои пурраро (тақрибан 1,5 Кб) фаро гирифта метавонанд.Намоиши васеъи майдони генетикӣ ҳалли шарҳи намудҳоро дар ҷомеаи бактерияҳо ё занбӯруғҳо хеле беҳтар кард.
Платформа:Пайванди PacBio II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Ҳадафи пайдарпайии ампликони 16S/18S/ITS ошкор кардани филогения, таксономия ва фаровонии намудҳо дар ҷомеаи микробҳо тавассути таҳқиқи маҳсулоти PCR-и маркерҳои генетикии хонагӣ, ки ҳам қисмҳои хеле гуфтугӯ ва ҳам гипертағйирёбандаро дар бар мегиранд.Ҷорӣ кардани ин изи ангуштони комили молекулавӣ аз ҷониби Woeses et al, (1977) профили микробиомаҳои бе изолятсияро фароҳам меорад.Пайдарпаии 16S (бактерияҳо), 18S (занбуғҳо) ва spacer transcribed internal (ITS, fungi) имкон медиҳад, ки ҳам намудҳои фаровон ва ҳам намудҳои нодир ва номаълум муайян карда шаванд.Ин технология як воситаи васеъ истифодашаванда ва асосӣ дар муайян кардани таркиби дифференсиалии микробҳо дар муҳитҳои гуногун, аз қабили даҳони инсон, рӯдаҳо, наҷосат ва ғ.
Платформа:Платформаи Illumina NovaSeq
-
Таҷдиди пайдарпайии тамоми геномҳои бактериявӣ ва fungal
Таҷдиди пайдарпайии тамоми геномҳои бактериявӣ ва занбӯруғҳо як воситаи муҳим барои анҷом додани геномҳои бактерия ва занбӯруғҳои маълум, инчунин муқоисаи геномҳои сершумор ё харитаи геномҳои организмҳои нав мебошад.Барои тавлиди геномҳои дақиқи истинод, муайянкунии микробҳо ва дигар таҳқиқоти муқоисавии геномӣ пайдарпай кардани тамоми геномҳои бактерия ва занбӯруғҳо аҳамияти бузург дорад.
Платформа: Платформаи Illumina NovaSeq
-
пайдарпайии метатранскриптом
Пайдарпайвандии метатранскриптом ифодаи генҳои микробҳоро (ҳам эукариотҳо ва ҳам прокариотҳо) дар муҳити табиӣ (яъне хок, об, баҳр, наҷосат ва рӯда) муайян мекунад. Махсусан, ин хидматҳо ба шумо имкон медиҳанд, ки профили экспрессияи генҳои мураккаби ҷамоаҳои микробҳо, таҳлили таксономӣ ба даст оред. намудҳо, таҳлили ғанисозии функсионалии генҳои гуногун ифодашаванда ва ғайра.
Платформа: Платформаи Illumina NovaSeq
-
Геномҳои fungal
Технологияҳои биомаркер вобаста ба ҳадафи мушаххаси тадқиқот тадқиқоти геномӣ, геномҳои хуб ва геноми пурраи пени-пурраи занбӯруғҳоро таъмин мекунанд.Пайдарпайвандии геном, ҷамъбаст ва шарҳи функсионалӣ метавонад тавассути омезиши пайдарпайии насли оянда + пайдарпайии насли сеюм барои ба даст овардани маҷмӯи геномҳои сатҳи баланд ба даст оварда шавад.Технологияи Hi-C инчунин метавонад барои осон кардани ҷамъшавии геномҳо дар сатҳи хромосома истифода шавад.
Платформа:Пайванди PacBio II
Nanopore PromethION P48
Платформаи Illumina NovaSeq
-
Геноми пурраи бактерияҳо
Biomarker Technologies хидмати пайдарпайро оид ба сохтани геноми мукаммали бактерияҳо бо холигии сифр пешкаш мекунад.Ҷараёни асосии кори бактерияҳо, ки сохтмони геноми мукаммал дорад, пайдарпайии насли сеюм, васлкунӣ, шарҳи функсионалӣ ва таҳлили пешрафтаи биоинформатикиро дар бар мегирад, ки ҳадафҳои мушаххаси тадқиқотро иҷро мекунанд.Профили ҳамаҷонибаи геномҳои бактерияҳо имкон медиҳад, ки механизмҳои бунёдии равандҳои биологии онҳо ошкор карда шаванд, ки ин инчунин метавонад барои таҳқиқоти геномикӣ дар намудҳои олии эукариотҳо истинодҳои арзишманд диҳад.
Платформа:Nanopore PromethION P48 + Платформаи Illumina NovaSeq
Пайванди PacBio II
