ЭВОЛЮЦИЯИ ГЕНОМ
табиат
АЛОКА
Пасиҳамоии геномҳо масирҳои ҷаҳонии парокандашавиро ошкор мекунанд ва мутобиқшавии генетикии конвергентиро дар эволютсияи баҳрӣ пешниҳод мекунанд
PacBio |Illumina |Hi-C |WGS |Гуногунии генетикӣ |Таърихи демографӣ |Ҷараёни ген
Пайдарпайвандии Pacbio, маҷмӯи геномҳои нав ва хидматҳои аннотатсионӣ аз ҷониби Biomarker Technologies пешниҳод карда шуданд.
Нуктаҳои муҳим
1. Геноми баҳрии сатҳи баланди хромосома (Hippocampus erectus) бо контиг N50 аз 15,5 Мб ба даст оварда шуд.
2. Ҳамагӣ 358 геном аз 21 намуди морҳои баҳрӣ дар саросари ҷаҳон аз нав тартиб дода шуданд.
3.Баҳрҳо дар охири Олигосен эволютсия шудаанд ва масирҳои мустамликадории минбаъдаи гирду атроф муайян карда шудаанд ва бо тағирёбии динамикаи ҷараёнҳои уқёнусҳо ва кушодашавии роҳи баҳрии палеотампоралӣ алоқаманданд.
4.Асоси генетикии фенотипи мутобиқшавии такроршавандаи "сутунмӯҳраҳои устухон" бо ивазкуниҳои мустақил дар як гени асосии рушд алоқаманд аст.
5.Рафтинг тавассути ҷараёнҳои уқёнус паҳншавии камбизоатро ҷуброн мекунад ва мутобиқшавии зуд ба мустамлика кардани маконҳои нав мусоидат мекунад
Муваффакиятхо
Расми 1 Гуногунии генетикӣ ва робитаҳои филогенетикии 358 намунаи аспи баҳрӣ
аҶойҳои интихоби ҷуғрофӣ барои морҳои намунавӣ бо намунаҳои гуногунии нуклеотидҳо (π) аз 21 намуди морҳои баҳрӣ дар 22 хромосома.б Дарахти ҳамсоя бо SNP-ҳои геномии 358 мори баҳрӣ сохта шудааст.Рамзҳои пинҳои ҷойгиршавӣ дар (a) ва заминаи шоха дар (b) ба ҳамдигар мувофиқат мекунанд.
Расми 2 Таърихи мустамликавӣ ва демографии аспҳои баҳрӣ
аДарахти филогенетикӣ ва вақти тафовут барои 21 намуди морҳои баҳрӣ.Ғафсии хати шоха ба тахминҳои шумораи аҳолӣ (Ne) мувофиқат мекунад ва рангҳо насабҳои гуногунро нишон медиҳанд.Аломатҳои I–III нуқтаҳои калибрченкуниро нишон медиҳанд.b–d Роҳҳои пешгӯии мустамликадории (тирҳои ранга) аспҳои баҳрӣ дар асоси вақт, тақсимот, рӯйдодҳои викариатӣ ва ҷараёнҳои уқёнус (тирҳои сафед).б Архипелаги Ҳиндустон-Австралия маркази пайдоиш (тамғаи сурх)-и ҷинси Hippocampus буд, пеш аз он ки аспҳои баҳрӣ дар тӯли 18-23 миллион сол гуногун ва пароканда шуданд.в Аспҳои баҳрӣ дар аввал тавассути роҳи кушодаи Тетиян уқёнуси Атлантикаро мустамлика карданд, ки пас аз баста шудани он (Ҳодисаи Терминалӣ дар давоми 7-13 миллион) ин насли тетияниро аз насли хоҳари уқёнуси Ҳинд ҷудо кард.Охирин, баъдан дар баҳри Араб босуръат диверсификатсия шуд (тамғаи зард) ва маркази дуюми диверсификатсияи аспҳои баҳриро таъсис дод.г Ҳодисаи дуюми мустамликасозии аспҳои баҳрӣ дар уқёнуси Атлантик аз уқёнуси Ҳинд тақрибан 5 миллион миллион миллион долларро аз нӯги Африқои Ҷанубӣ гузашта, дар ниҳоят ба уқёнуси шарқии Уқёнуси Ором тавассути роҳи баҳрии ҳанӯз кушодаи Панама тақрибан 3,6 миллион миллион доллар расид.
Расми 3 Ҷараёни генҳо ва тағирёбии андозаи самараноки аҳолӣ
аҶараёни генҳо дар байни намудҳое, ки дар уқёнуси ҷанубии Атлантик зиндагӣ мекунанд, муайян карда шуданд.Ҷараёни генҳо дар наздикии хатҳои сафед ҳамчун суръати муҳоҷират аз ҷониби G-PhoCS муайян карда мешавад.Ғафсӣ ва самти тирҳо мутаносибан ба суръат ва самти ҷараёни генҳо мувофиқат мекунанд.б Тағйирёбии андозаи самараноки аҳолӣ аз ҷониби PSMC.Меҳвари x вақтро бо солҳо пеш аз ҳозира нишон медиҳад, дар ҳоле ки меҳвари y андозаи самараноки аҳолӣ мебошад.Диаграммаҳо асосан аз рӯи тақсимоти ҷуғрофӣ барои ҳар як намуд бо минтақаҳои паҳншавии гуногун ташкил карда мешаванд.в Тағйирёбии сатҳи баҳр дар давоми 1 миллион соли охир бо метр33.Хатти зард қуллаи охирини байни пиряхҳои ҷаҳониро нишон медиҳад, дар ҳоле ки сояи кабуд давраи охирини пиряхҳоро нишон медиҳад.
Расми 4 Эволюцияи сутунмӯҳраҳо.
аДар чап, Дарахти намудҳо, ки эволютсияи мустақили сутунмӯҳраҳоро дар баҳрҳо нишон медиҳад.Дарозии филиал шумораи ивазкуниро дар як сайт нишон медиҳад.Чаҳор намуди мори чӯбдор бо ранги кабуд таъкид шудааст.Шохаҳои ғафс ба суръати баландтари ивазкуниҳои ғайрисинонимӣ ба синонимӣ (dN/dS) барои гени bmp3 мувофиқат мекунанд.Санҷиши каноникӣ ва умумӣшудаи McDonald ва Kreitman (MKT) барои гени bmp3 барои се намуди хоҳари ҷуфтӣ бо хусусиятҳои ҷудогонаи сутунмӯҳра ва ғайридавлатӣ бо рангҳои пасзамина, ки сатҳи аҳамияти онҳо мутаносибан бо арзиши p бо ҳуруфи кабуд ва сурх нишон дода шудааст, гузаронида шуд.Рост, муқоисаи ивазкуниҳои аминокислотаҳо дар сафедаи bmp3, ивазкуниҳои полиморфӣ ва собит дар баҳрҳои сутундор мутаносибан бо доираҳои сурх ва кабуд нишон дода шудаанд.б Тақсимоти арзишҳои dN/dS дар bmp3 дар баҳрҳои сутундор дар муқоиса бо намудҳои ғайрисухтор.в Эволюцияи мустақил дар дарахти филогенетикӣ барои сафедае, ки бо bmp3 рамзгузорӣ шудааст, барқарор карда шудааст.г Гибридизатсияи пурраи in situ bmp3 дар Hippocampus erectus.
Истинод
Ли Ц ва дигарон.Пасиҳамоии геномҳо масирҳои паҳншавии глобалиро ошкор мекунанд ва мутобиқшавии генетикии конвергентиро дар эволютсияи баҳрӣ пешниҳод мекунанд.Нат Коммун.2021 феврал 17;12(1):1094.
Хабарҳо ва рӯйдодҳои муҳим Ҳадафи мубодилаи ҳолатҳои муваффақи охирин бо Biomarker Technologies, ба даст овардани дастовардҳои илмии нав ва инчунин усулҳои барҷастае, ки дар рафти омӯзиш истифода мешаванд.
Вақти фиристодан: январ-06-2022