Ахбор

Амплификацияи унсури интиқолшаванда (TE) ҳамчун як қувваи пешбарандаи миёнаравӣ дар васеъшавӣ ва эволютсияи геном эътироф шудааст, аммо оқибатҳои ташаккули меъмории геномии 3D дар растаниҳо то ҳол номаълум боқӣ мондаанд.Дар ин ҷо, мо дар бораи маҷмӯаҳои геномҳои дараҷаи истинод барои се намуди пахта гузориш медиҳем, ки андозаи геном се баробар аст, яънеGossypium rotundifolium(К2),дарахтзори Г(A2), ваГ.раймондии(D5), бо истифода аз Oxford Nanopore Technologies.Таҳлили муқоисавии геном тафсилоти амплификацияи хоси ТЭ-ро, ки ба фарқиятҳои бузурги андозаи геном мусоидат мекунад (K2, 2.44 Гб; A2, 1.62 Гб; D5, 750.19 Мб) ҳуҷҷатгузорӣ мекунад ва мундариҷаи нисбатан ҳифзшудаи ген ва муносибатҳои синтениро дар байни геномҳо нишон медиҳад.Мо дарёфтем, ки тақрибан 17% генҳои синтеникӣ тағирёбии ҳолати хроматинро дар байни қисмҳои фаъол (“A”) ва ғайрифаъол (“B”) нишон медиҳанд ва амплификацияи TE бо афзоиши ҳиссаи A дар минтақаҳои генҳо (~ 7,000 ген) алоқаманд аст. ) дар K2 ва A2 нисбат ба D5.Дар байни се геном танҳо 42% сарҳадҳои домени аз ҷиҳати топологӣ алоқаманд (TAD) ҳифз шудаанд.Маълумоти мо тақвияти охирини TE-ро пас аз ташаккули сарҳадҳои мушаххаси TAD ба насл нишон медиҳад.Ин тадқиқот ба нақши тавсеаи геномҳои транспозонӣ дар эволютсияи сохтори хроматинии олӣ дар растаниҳо равшанӣ меандозад.