Ба потенсиали омӯзиши намудҳои ваҳшии намудҳои тадқиқот, ки дар мисоли як мисоли муҳими муштариёни BMKGENE оварда шудааст, омӯзед.Ба наздикӣ дар нашри имсолаи маҷаллаи биотехнологияи растанӣ нашр шудааст, мақола бо номи "Геноми сатҳи хромосомаи ваҳшӣ Hevea brasiliensis: тавонмандсозии парвариши геномӣ ва кашф кардани ҷойҳои муҳим барои ҳосили баланди резинӣ" ҳамчун як истинод арзишманд аст.
Дарахти резинии Бразилия (Hevea brasiliensis) ҳамчун манбаи асосии резини табиӣ баланд аст.Дар тӯли асри гузашта, усулҳои анъанавии зотпарварӣ боиси афзоиши назарраси истеҳсоли резинӣ шуданд.Бо вуҷуди ин, ҷинсҳои асосии генетикӣ, ки барои баланд бардоштани ҳосили резинӣ масъуланд, то ҳол номаълум боқӣ мемонад.
Ин тадқиқот ба сохтани геноми сатҳи хромосома барои дарахти резинии ваҳшӣ оғоз карда, бо истифода аз синергетикаи пайдарпайии Nanopore-и дарозмуддат, пайдарпайии Illumina NGS ва технологияи Hi-C истифода шудааст.
Дар баробари ин, як хазинаи 147 захираҳои гермплазма, ки вариантҳои ҳосили баланд, штаммҳои ваҳшӣ ва намудҳои ба он алоқамандро дар бар мегиранд, барои такрори ҳамаҷонибаи геном (WGS) бо истифода аз платформаи Illumina ҷамъ карда шуданд.Маълумоти пайдарпайии пайдарпай аз таҳлили ҷиддии генетикаи популятсия гузаронида шуд, ки имкон дод сохтори популятсия, гуногунрангӣ ва номутаносибии пайвандҳо тақсим карда шавад.Ин таҳлил ба фарқиятҳои хонагӣ дар байни аҳолӣ равшанӣ мебахшад.
Тадқиқоти минбаъда таҳлилҳоро дар бар гирифт, ки Fst, π, Tajima's D ва LD-ро дар бар мегирад, ки ҳадафи он ошкор кардани сигналҳои интихобӣ, ки аз ҳосили беҳтари латекс бармеоянд, бахусус ба клонҳои Wickham.
Дар натиҷаи таҳлили Ассотсиатсияи умуми геномӣ (GWAS), маркерҳое, ки ба хислатҳои ҳосил алоқаманданд ва баъдан генҳои марбут ба ҳосил муайян карда шуданд.Санҷиши ибтидоӣ фаъолиятҳои хоси транскриптсиониро дар байни мутантҳои гуногун барои ду гени ERF ошкор кард, ки дар бораи аҳамияти функсионалии онҳо тасаввуроти пешакӣ фароҳам меорад.Тасдиқи минбаъда дар доираи тадқиқоти оянда ба нақша гирифта шудааст.
BMKGENE аз саҳм гузоштан ба такрори геномҳои васеъи ин популятсияи бузург ва нақши муҳим дар таҳлили биоинформатика ифтихор мекунад.Таҷрибаи бузурги мо пайдарпаии NGS/TGS ва таҳлили биоинформатикаи мултиомикаро дар як қатор 1000+ намудҳо дар бар мегирад.Мо бесаброна интизори ҳамкорӣ бо шумо дар лоиҳаҳои дарпешистодаи шумо ҳастем.
Барои ин ҷо клик кунеддар бораи ин омӯзиш бештар маълумот гиред
Вақти интишор: 29-2023 август