-
Пайдарҳамии иммунопреципиатсияи хроматин (ChIP-seq)
ChIP-Seq профили геномии ҳадафҳои ДНК-ро барои тағир додани гистон, омилҳои транскрипсия ва дигар сафедаҳои бо ДНК алоқаманд таъмин мекунад.Он селективии иммуно-реципитацияи хроматинро (ChIP) барои барқарор кардани комплексҳои мушаххаси сафеда-ДНК бо қудрати пайдарпайии насли оянда (NGS) барои пайдарпайии баландсуръати ДНК барқароршударо муттаҳид мекунад.Илова бар ин, азбаски маҷмӯаҳои сафеда-ДНК аз ҳуҷайраҳои зинда барқарор карда мешаванд, сайтҳои ҳатмӣ метавонанд дар намудҳо ва бофтаҳои гуногуни ҳуҷайра ё дар шароити гуногун муқоиса карда шаванд.Барномаҳо аз танзими транскриптӣ то роҳҳои рушд то механизмҳои беморӣ ва берун аз он иборатанд.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
пайдарпайии пурраи геноми бисульфит
Метилизатсияи ДНК дар ҷои панҷум дар ситозин (5-mC) ба ифодаи генҳо ва фаъолияти ҳуҷайра таъсири асосӣ дорад.Намунаҳои ғайримуқаррарии метилизатсия бо якчанд шароит ва бемориҳо, ба монанди саратон алоқаманданд.WGBS ба стандарти тиллоӣ барои омӯзиши метилизатсияи геномӣ дар як қарори ягона табдил ёфтааст.
Платформа: Illumina NovaSeq6000
-
Таҳлил барои хроматини ба транспозаза дастрас бо пайдарпаии гузариши баланд (ATAC-seq)
ATAC-seq як усули пайдарпайии баландсуръат барои таҳлили дастрасии хроматин дар геном мебошад, ки барои назорати глобалии эпигенетикии ифодаи генҳо муҳим аст.Адаптерҳои пайдарпай ба минтақаҳои кушодаи хроматин тавассути транспозазаи гиперактивии Tn5 ворид карда мешаванд.Пас аз тақвияти PCR, китобхонаи пайдарпайӣ сохта мешавад.Ҳама минтақаҳои кушодаи хроматинро дар шароити мушаххаси вақти фазо ба даст овардан мумкин аст, на танҳо бо маконҳои ҳатмии омили транскрипсия ё минтақаи муайяни тағирёфтаи гистон маҳдуд мешавад.
-
Пасиҳамоии камшудаи намояндагии бисульфит (RRBS)
Тадқиқоти метилизатсияи ДНК ҳамеша мавзӯи доғ дар таҳқиқоти беморӣ буд ва бо ифодаи генҳо ва хислатҳои фенотипӣ зич алоқаманд аст.RRBS як усули дақиқ, муассир ва иқтисодӣ барои таҳқиқоти метилизатсияи ДНК мебошад.Бо ғанисозии минтақаҳои промотор ва ҷазираи CpG тавассути тақсимоти ферментативӣ (Msp I), дар якҷоягӣ бо пайдарпайии бисульфит, муайянкунии баландсифати метилизатсияи ДНК-ро таъмин мекунад.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
