Платформа | Андозаи китобхона | Ҳосили назариявии маълумот (як ҳуҷайра) | Дурустии яккаса | Барномаҳо |
Нанопора | 8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR | 70-90Гб/ҳуҷайра | 85-92% | Даъвати SV, De novo, пайдарпайии пурраи дарозӣ, Iso-Seq, шарҳи ген, ошкор кардани метилизатсияи ДНК |
● Таҷрибаи зиёда аз 5 сол дар платформаи пайдарпайии PacBio бо ҳазорҳо лоиҳаҳои пӯшида бо намудҳои гуногун.
● BMKGENE шарики расмии Oxford Nanopore мебошад, ки дорои сертификатсияи дугонаи платформаи RNA/DNA мебошад.
● Моделҳои асосии секвенсерҳо бо таҷҳизоти мукаммал ва қобилияти кофии секвенсер мавҷуданд.
● Дар асоси платформаи Nanopore, зиёда аз 10 тадқиқоти ҳайвонот ва растании Деново дар маҷаллаҳои маъруфи байналмилалӣ нашр шудаанд.
Намунаи намуна | Маблағ | Консентратсия (Qubit®) | Ҳаҷм | Покӣ | Дигарон |
ДНК-и геномӣ | Вобаста ба Талаботи маълумот | ≥20нг/мкл | ≥15мкл | OD260/280=1,7-2,2; OD260/230≥1,5; Қуллаи равшан дар 260 нм, ифлосшавӣ нест | Консентратсия бояд бо Qubit ва Qubit/Nanopore ≤ 2 чен карда шавад |
Ҳамагӣ РНК | ≥1,2 мкг | ≥100мкг/мкл | ≥15мкл | OD260/280=1,7-2,5; OD260/230 = 0,5-2,5; ифлосшавӣ нест | Арзиши RIN ≥7,5 |
Арзёбии сифати маълумот аз намунаи ДНК
Љадвали 1. Омори маълумоти тоза.
BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | cleanN50Len | cleanN90Len | cleanMeanLen | cleanMaxLen | cleanMeanQual |
DNA_BMK01 | 1.218.239 | 26.37 | 1.121.736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
Арзёбии сифати маълумот аз намунаи RNA
Љадвали 1. Омори маълумоти тоза.
Номи парванда | ClientID | ReadNum | Рақами асосӣ | N50 | Дарозии миёна | Максимум дарозӣ | МиёнаиQScore |
RNA_BMK001 | C2 | 8.947.708 | 4.047.230.083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
Расми 1. Тақсимоти дарозии хонед
Тасвири 2. Тақсимоти холҳои сифати маълумоти тоза
Тасвири 3. Тақсимоти холҳои дарозӣ ва сифати маълумоти тоза