ప్లాట్ఫారమ్: NovaSeq ప్లాట్ఫారమ్, PE150
లైబ్రరీ రకం: 200-400bp బైసల్ఫైట్ చికిత్స DNA లైబ్రరీని చొప్పించండి
సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం: జత-ముగింపు 150 bp
డేటా అవుట్పుట్ను సిఫార్సు చేయండి: 10 Gb ముడి డేటా/నమూనా
DNA పరిమాణం: ≥ 2ug
DNA గాఢత:≥ 20ng/μl.
స్వచ్ఛత: OD260/280 = 1.8 నుండి 2.0 వరకు క్షీణత లేదా RNA కాలుష్యం లేకుండా
a.సూచన జన్యు అమరిక గణాంకాలు
SC సైట్ యొక్క సీక్వెన్సింగ్ డెప్త్ మరియు కవరేజీ యొక్క గణాంకాలు
Aసంచిత కవరేజ్
Dప్రతి నమూనా యొక్క జీర్ణక్రియ సామర్థ్యం
b.మిథైలేషన్ సైట్ గుర్తింపు
C సైట్ వద్ద మిథైలేషన్ స్థాయిల జాబితా
BS మార్పిడి
c.మిథైలేషన్ మ్యాప్
Gఎనోమ్ మూలకం
d.నమూనాల మధ్య మిథైలేషన్ స్థాయిల పోలిక
PCG మిథైలేషన్ యొక్క ఎయిర్వైస్ కోరిలేషన్
d.విభిన్నంగా మిథైలేషన్ విశ్లేషణ
SDMR యొక్క గణాంకాలు