ప్లాట్ఫారమ్: ఇల్యూమినా నోవాసెక్ ప్లాట్ఫారమ్, PE150
లైబ్రరీ రకం: 350bp cDNA లైబ్రరీని చొప్పించండి (పీక్ డిస్ట్రిబ్యూషన్పై ఆధారపడి ఉంటుంది)
సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం: జత-ముగింపు 150 bp
సిఫార్సు డేటా మొత్తం: 2 Gb ముడి డేటా/నమూనా
(1) సీక్వెన్సింగ్ డేటా నాణ్యత నియంత్రణ: న్యూక్లియోటైడ్ పంపిణీ, ప్రాథమిక నాణ్యత పంపిణీ, rRNA నిష్పత్తి అంచనా;
(2) సీక్వెన్స్ అలైన్మెంట్ విశ్లేషణ: అలైన్మెంట్ రిజల్ట్ స్టాటిస్టిక్స్, సీక్వెన్సింగ్ యొక్క సంతృప్తత, సీక్వెన్సింగ్ కవరేజ్;
(3) సూచన జన్యు ఉల్లేఖనం (NR, స్విస్-ప్రోట్, Pfam, COG, GO, KEGG);
(4) వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ: వ్యక్తీకరణ పంపిణీ (రెండు లేదా అంతకంటే ఎక్కువ నమూనాలతో), నమూనాల మధ్య వ్యక్తీకరణ యొక్క విశ్లేషణ (వెన్ విశ్లేషణ, సహసంబంధ విశ్లేషణ, PCA విశ్లేషణ);
(5) అవకలన వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ (రెండు లేదా అంతకంటే ఎక్కువ నమూనాలతో);
(6) జీన్ సెట్ విశ్లేషణ: వెన్ విశ్లేషణ, క్లస్టర్ విశ్లేషణ, ఫంక్షన్ ఉల్లేఖన విశ్లేషణ (COG, GO, KEGG), ఫంక్షన్ ఎన్రిచ్మెంట్ అనాలిసిస్ (GO, KEGG), ఫంక్షన్ ఎన్రిచ్మెంట్ కార్డల్ గ్రాఫ్, ఐపాత్ విశ్లేషణ;
(7) sRNA విశ్లేషణ: sRNA ప్రిడిక్షన్, sRNA ఉల్లేఖనం (బ్లాస్ట్, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), sRNA సెకండరీ స్ట్రక్చర్ ప్రిడిక్షన్, sRNA టార్గెట్ జీన్ ప్రిడిక్షన్;
(8) ట్రాన్స్క్రిప్ట్ నిర్మాణ విశ్లేషణ: ఒపెరాన్ విశ్లేషణ, ట్రాన్స్క్రిప్షన్ ప్రారంభ మరియు ముగింపు సైట్ల అంచనా, UTR ఉల్లేఖన మరియు విశ్లేషణ, ప్రమోటర్ సీక్వెన్స్ ప్రిడిక్షన్, SNP/InDel విశ్లేషణ (SNP/InDel ఉల్లేఖన, SNP/InDel ప్రాంతీయ పంపిణీ, SNP గణాంకాలు).