ఉష్ణోగ్రత పటం
మ్యాట్రిక్స్ డేటా ఫైల్ హీట్ మ్యాప్ డ్రాయింగ్ కోసం ఉపయోగించబడుతుంది, ఇది మ్యాట్రిక్స్ డేటాను ఫిల్టర్ చేయగలదు, సాధారణీకరించగలదు మరియు క్లస్టర్ చేయగలదు.వివిధ నమూనాల మధ్య జన్యు వ్యక్తీకరణ స్థాయి యొక్క క్లస్టర్ విశ్లేషణ కోసం ఇది ఎక్కువగా ఉపయోగించబడుతుంది.
జీన్ ఉల్లేఖనం
వివిధ డేటాబేస్కు వ్యతిరేకంగా ఫాస్టా ఫైల్లో సీక్వెన్స్లను మ్యాపింగ్ చేయడం ద్వారా జీన్ ఫంక్షన్ ఉల్లేఖన నిర్వహించబడుతుంది.
జీన్ ఉల్లేఖనం
ప్రాథమిక స్థానిక అమరిక శోధన సాధనం
CDS_UTR_Prediction
తెలిసిన ప్రొటీన్ డేటాబేస్ మరియు ORF ప్రిడిక్షన్కు వ్యతిరేకంగా బ్లాస్టింగ్ ఆధారంగా ఇచ్చిన ట్రాన్స్క్రిప్ట్ సీక్వెన్స్లలో కోడింగ్ రీజియన్లు (CDS) మరియు నాన్-కోడింగ్ రీజియన్లను (UTR) అంచనా వేయడానికి ఈ సాధనం రూపొందించబడింది.
మాన్హాటన్ ప్లాట్
మాన్హాటన్ ప్లాట్లు పెద్ద సంఖ్యలో డేటా పాయింట్లతో డేటా ప్రదర్శనను ప్రారంభిస్తాయి.ఇది సాధారణంగా జీనోమ్-వైడ్ అసోసియేషన్ స్టడీస్ (GWAS)లో ఉపయోగించబడుతుంది.
సర్కోస్
CIRCOS రేఖాచిత్రం జన్యువుపై SNP, InDeL, SV, CNV పంపిణీల ప్రత్యక్ష ప్రదర్శనను అనుమతిస్తుంది.
GO_Enrichment
TopGO అనేది ఫంక్షనల్ ఎన్రిచ్మెంట్ కోసం రూపొందించబడిన సాధనం.TopGO-Bioconductor ప్యాకేజీలో అవకలన వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ, GO సుసంపన్నత విశ్లేషణ మరియు ఫలితాల విజువలైజేషన్ ఉంటాయి.ఇది topGO_BP, topGO_CC మరియు topGO_MF కోసం ఫలితాలను కలిగి ఉన్న "గ్రాఫ్" పేరుతో అవుట్పుట్తో ఫోల్డర్ను రూపొందిస్తుంది.
WGCNA
WGCNA అనేది జన్యు సహ-వ్యక్తీకరణ మాడ్యూల్లను కనుగొనడానికి విస్తృతంగా ఉపయోగించే డేటా మైనింగ్ పద్ధతి.తదుపరి తరం సీక్వెన్సింగ్ నుండి ఉద్భవించిన మైక్రోఅరే డేటా మరియు జన్యు వ్యక్తీకరణ డేటాతో సహా వివిధ వ్యక్తీకరణ డేటాసెట్కు ఇది వర్తిస్తుంది.
ఇంటర్ప్రోస్కాన్
ఇంటర్ప్రో ప్రోటీన్ సీక్వెన్స్ విశ్లేషణ మరియు వర్గీకరణ
GO_KEGG_ఎన్రిచ్మెంట్
అందించిన జన్యు సమితి మరియు సంబంధిత ఉల్లేఖన ఆధారంగా GO ఎన్రిచ్మెంట్ హిస్టోగ్రామ్, KEGG ఎన్రిచ్మెంట్ హిస్టోగ్రామ్ మరియు KEGG ఎన్రిచ్మెంట్ పాత్వేని రూపొందించడానికి ఈ సాధనం రూపొందించబడింది.