ఉత్పత్తులు

1.హిస్టోగ్రాం: జాతుల పంపిణీ

2.KEGG జీవక్రియ మార్గాలకు ఉల్లేఖించిన ఫంక్షనల్ జన్యువులు

3.హీట్ మ్యాప్: సంబంధిత జన్యు సమృద్ధి ఆధారంగా అవకలన విధులు4.CARD యాంటీబయాటిక్ రెసిస్టెన్స్ జన్యువుల సర్కోస్

BMK కేసు

యాంటీబయాటిక్ రెసిస్టెన్స్ జన్యువులు మరియు బాక్టీరియల్ వ్యాధికారక క్రిములు మట్టి-మడ రూట్ కంటిన్యూమ్‌లో వ్యాప్తి చెందుతాయి

ప్రచురించబడింది:జర్నల్ ఆఫ్ హజార్డస్ మెటీరియల్స్, 2021

సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం:

మెటీరియల్స్:మడ రూట్ సంబంధిత నమూనాల నాలుగు శకలాలు DNA సారాలు: నాటని నేల, రైజోస్పియర్, ఎపిస్పియర్ మరియు ఎండోస్పియర్ కంపార్ట్‌మెంట్లు
ప్లాట్‌ఫారమ్: ఇల్యూమినా హైసెక్ 2500
లక్ష్యాలు: మెటాజినోమ్
16S rRNA జన్యువు V3-V4 ప్రాంతం

కీలక ఫలితాలు

మట్టి నుండి మొక్కలలోకి యాంటీబయాటిక్ రెసిస్టెన్స్ జన్యువుల (ARGs) వ్యాప్తిని అధ్యయనం చేయడానికి మడ మొక్కల యొక్క మట్టి-మూల కొనసాగింపుపై మెటాజెనోమిక్ సీక్వెన్సింగ్ మరియు మెటాబార్కోడింగ్ ప్రొఫైలింగ్ ప్రాసెస్ చేయబడ్డాయి.పైన పేర్కొన్న నాలుగు మట్టి కంపార్ట్‌మెంట్లలో 91.4% యాంటీబయాటిక్ రెసిస్టెన్స్ జన్యువులు సాధారణంగా గుర్తించబడుతున్నాయని మెటాజెనోమిక్ డేటా వెల్లడించింది, ఇది నిరంతర ఫ్యాషన్‌ను చూపుతుంది.16S rRNA యాంప్లికాన్ సీక్వెన్సింగ్ 29,285 సీక్వెన్స్‌లను రూపొందించింది, ఇది 346 జాతులను సూచిస్తుంది.యాంప్లికాన్ సీక్వెన్సింగ్ ద్వారా జాతుల ప్రొఫైలింగ్‌తో కలిపి, ఈ వ్యాప్తి రూట్-అనుబంధ మైక్రోబయోటా నుండి స్వతంత్రంగా ఉన్నట్లు కనుగొనబడింది, అయినప్పటికీ, ఇది జన్యు మూలకాల మొబైల్ ద్వారా సులభతరం చేయబడుతుంది.ఈ అధ్యయనం ఒకదానితో ఒకటి అనుసంధానించబడిన మట్టి-మూల కంటిన్యూమ్ ద్వారా మట్టి నుండి మొక్కలలోకి ARGలు మరియు వ్యాధికారక ప్రవాహాన్ని గుర్తించింది.

సూచన

వాంగ్, సి., హు, ఆర్., స్ట్రాంగ్, పిజె, జువాంగ్, డబ్ల్యూ., & షు, ఎల్.(2020)యాంటీబయాటిక్ రెసిస్టెన్స్ జన్యువులు మరియు బాక్టీరియల్ వ్యాధికారక క్రిములు మట్టి-మడ రూట్ కంటిన్యూమ్‌లో వ్యాప్తి చెందుతాయి.జర్నల్ ఆఫ్ హాజర్డస్ మెటీరియల్స్, 408, 124985.