● విభిన్న పరిశోధన లక్ష్యాల కోసం బహుళ సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహాలు అందుబాటులో ఉన్నాయి
● 10,000 కంటే ఎక్కువ పెనే-పూర్తి జీనోమ్ అసెంబుల్ చేయబడిన శిలీంధ్రాల జీనోమ్ అసెంబ్లీలో అత్యంత అనుభవం ఉంది.
● మరింత నిర్దిష్ట పరిశోధన అవసరాలను తీర్చే వృత్తిపరమైన విక్రయం తర్వాత సాంకేతిక మద్దతు బృందం.
సేవ | సీక్వెన్సింగ్ స్ట్రాటజీ | నాణ్యత హామీ | అంచనా వేసిన మలుపు సమయం |
ఫంగల్ ఫైన్ మ్యాప్ | ఇల్యూమినా 50X+నానోపోర్ 100X | కాంటిగ్ N50≥2 Mb | 35 పని దినాలు |
PacBio HiFi 30X | |||
ఫంగల్ పెనే-పూర్తి మ్యాప్ | ఇల్యూమినా 50X+నానోపోర్ 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | క్రోమోజోమ్ యాంకరింగ్ రేషియో >90% | 45 పని దినాలు |
● ముడి డేటా నాణ్యత నియంత్రణ
● జీనోమ్ అసెంబ్లీ
● జీనోమ్ కాంపోనెంట్ విశ్లేషణ
● జీన్ ఫంక్షన్ ఉల్లేఖన
● తులనాత్మక జన్యు విశ్లేషణ
కోసంDNA పదార్దాలు:
నమూనా రకం | మొత్తం | ఏకాగ్రత | స్వచ్ఛత |
DNA పదార్దాలు | > 1.2 μg | > 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
కణజాల నమూనాల కోసం:
నమూనా రకం | సిఫార్సు చేయబడిన నమూనా చికిత్స | నమూనా నిల్వ మరియు రవాణా |
ఏకకణ శిలీంధ్రం | సూక్ష్మదర్శిని క్రింద ఈస్ట్ను గమనించి, వాటి ఘాతాంక దశలో వాటిని సేకరించండి కల్చర్ను (సుమారు 3-4.5e9 సెల్లను కలిగి ఉంటుంది) 1.5 లేదా 2 ml ఎపెన్డార్ఫ్లోకి బదిలీ చేయండి.(మంచు మీద ఉంచండి) బ్యాక్టీరియాను సేకరించడానికి మరియు సూపర్నాటెంట్ను జాగ్రత్తగా తొలగించడానికి 14000 గ్రా వద్ద ట్యూబ్ను 1 నిమిషం పాటు సెంట్రిఫ్యూజ్ చేయండి ట్యూబ్ను మూసివేసి, బ్యాక్టీరియాను ద్రవ నైట్రోజన్లో కనీసం 1-3 గం వరకు స్తంభింపజేయండి.ట్యూబ్ను -80 ℃ ఫ్రిజ్లో నిల్వ చేయండి. | 3-4 గంటల పాటు ద్రవ నత్రజనిలో నమూనాలను స్తంభింపజేయండి మరియు ద్రవ నత్రజనిలో లేదా -80 డిగ్రీలో నిల్వ ఉంచి దీర్ఘకాల రిజర్వేషన్లో ఉంచండి.డ్రై-ఐస్తో నమూనా షిప్పింగ్ అవసరం. |
మాక్రో ఫంగస్ | చురుకుగా పెరుగుతున్న దశలో కణజాలం సిఫార్సు చేయబడింది. ఎండోటాక్సిన్ లేని నీటితో కణజాలాన్ని కడిగి, ఆపై 70% ఎథోనల్. నమూనాను క్రయో-ట్యూబ్లలో సేవ్ చేయండి. |
1. ఫంగల్ జెనోమిక్ భాగాలపై సర్కోస్ రేఖాచిత్రం
2.కంపారిటివ్ జెనోమిక్స్ అనాలిసిస్: ఫైలోజెనెటిక్ ట్రీ