● సాధారణంగా అవసరమైన ఎనిమిది విశ్లేషణలను కలిగి ఉన్న సమగ్ర విశ్లేషణల ప్యాకేజీ
● ఫలితాలపై వివరణాత్మక మరియు సులభంగా అర్థమయ్యే వివరణతో విశ్లేషణలో అధిక విశ్వసనీయత
● చక్కగా రూపొందించబడిన, ప్రచురించడానికి సిద్ధంగా ఉన్న బొమ్మలు
● అత్యంత నైపుణ్యం కలిగిన బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ బృందం విభిన్న వ్యక్తిగతీకరించిన విశ్లేషణ డిమాండ్లను నెరవేరుస్తుంది
● విశ్లేషణలో అధిక ఖచ్చితత్వంతో తక్కువ సమయం
● 900 కంటే ఎక్కువ సంచిత ప్రచురించబడిన ప్రభావ కారకంతో 90 విజయవంతమైన కేసులతో సమృద్ధిగా అనుభవం
అంచనా వేసిన మలుపు సమయం | జాతుల సంఖ్య | విశ్లేషిస్తుంది |
30 పని దినాలు | 6 - 12 | జీన్ ఫ్యామిలీ క్లస్టరింగ్ జన్యు కుటుంబ విస్తరణ మరియు సంకోచం ఫైలోజెనెటిక్ చెట్టు నిర్మాణం డైవర్జెన్స్ టైమ్ అంచనా (శిలాజ క్రమాంకనం అవసరం) LTR చొప్పించే సమయం (మొక్కల కోసం) మొత్తం జీనోమ్ డూప్లికేషన్ (మొక్కల కోసం) ఎంపిక ఒత్తిడి సింటెని విశ్లేషణ |
● జన్యు కుటుంబం
● ఫైలోజెనెటిక్స్
● డైవర్జెన్స్ సమయం
● ఎంపిక ఒత్తిడి
● సింటెనీ విశ్లేషణ
కణజాలం కోసం
జాతులు | కణజాలం | సర్వే | ప్యాక్బయో CCS |
జంతువు | విసెరల్ కణజాలం | 0.5 ~ 1గ్రా | ≥ 3.5 గ్రా |
కండరాల కణజాలం | |||
≥ 5.0గ్రా | |||
≥ 5.0మి.లీ | |||
క్షీరద రక్తం | |||
≥ 0.5మి.లీ | |||
పౌల్ట్రీ/చేప రక్తం | |||
మొక్క | తాజా ఆకు | 1 ~ 2 గ్రా | ≥ 5.0గ్రా |
పెటల్/కాండం | 1 ~ 2 గ్రా | ≥ 10.0గ్రా | |
రూట్/విత్తనం | 1 ~ 2 గ్రా | ≥ 20.0గ్రా | |
కణాలు | కల్చర్డ్ సెల్ | - | ≥ 1 x 108 |
జీనోమ్ సీక్వెన్స్ ఫైల్లు(.ఫాస్టా) మరియు ఉల్లేఖన ఫైల్లు (.gff3) దగ్గరి సంబంధం ఉన్న జాతులు
*ఇక్కడ చూపిన డెమో ఫలితాలు బయోమార్కర్ టెక్నాలజీస్తో ప్రచురించబడిన జీనోమ్ల నుండి వచ్చినవి
1.LTR ఇన్సర్ట్ సమయం అంచనా: ఇతర జాతులతో పోల్చితే, వీనింగ్ రై జీనోమ్లో LTR-RTల చొప్పించే సమయాలలో ఫిగర్ ప్రత్యేకమైన ద్విపద పంపిణీని చూపింది.ఇటీవలి శిఖరం సుమారు 0.5 మిలియన్ సంవత్సరాల క్రితం కనిపించింది.
లి గువాంగ్ మరియు ఇతరులు.,ప్రకృతి జన్యుశాస్త్రం, 2021
2.చయోట్ (సెచియం ఎడ్యూల్)పై ఫైలోజెని మరియు జన్యు కుటుంబ విశ్లేషణ : చాయోట్ మరియు జన్యు కుటుంబంలోని ఇతర 13 సంబంధిత జాతులను విశ్లేషించడం ద్వారా, చాయోట్ పాము పొట్లకాయ (ట్రైకోసాంథెస్ ఆంగ్వినా)తో చాలా దగ్గరి సంబంధం కలిగి ఉన్నట్లు కనుగొనబడింది.చాయోట్ 27-45 మయాలో పాము పొట్లకాయ నుండి తీసుకోబడింది మరియు మొత్తం జీనోమ్ డూప్లికేషన్ (WGD) చాయోట్లో 25±4 మైయాలో గమనించబడింది, ఇది క్యూబిటాసిలో మూడవ WGD సంఘటన.
ఫు ఎ మరియు ఇతరులు.,హార్టికల్చర్ రీసెర్చ్, 2021
3.సింటెనీ విశ్లేషణ: పండ్ల అభివృద్ధిలో ఫైటోహార్మోన్లకు సంబంధించిన కొన్ని జన్యువులు చాయోట్, పాము పొట్లకాయ మరియు స్క్వాష్లలో కనుగొనబడ్డాయి.చాయోటే మరియు స్క్వాష్ మధ్య సహసంబంధం చాయోటే మరియు పాము పొట్లకాయ మధ్య ఉన్నదాని కంటే కొంచెం ఎక్కువగా ఉంటుంది.
ఫు ఎ మరియు ఇతరులు.,హార్టికల్చర్ రీసెర్చ్, 2021
4.జన్యు కుటుంబ విశ్లేషణ: G.thurberi మరియు G.davidsonii జన్యువులలో జన్యు కుటుంబ విస్తరణ మరియు సంకోచంపై KEGG సుసంపన్నత స్టెరాయిడ్ బయోసింథసిస్ మరియు బ్రాసినోస్టెరాయిడ్ బయోసింథసిస్ సంబంధిత జన్యువులు విస్తరించినట్లు చూపబడింది.
యాంగ్ Z మరియు ఇతరులు.,BMC జీవశాస్త్రం, 2021
5.హోల్ జీనోమ్ డూప్లికేషన్ అనాలిసిస్: 4DTV మరియు Ks డిస్ట్రిబ్యూషన్ విశ్లేషణ మొత్తం జీనోమ్ డూప్లికేషన్ ఈవెంట్ను చూపుతుంది.డూప్లికేషన్ ఈవెంట్లను చూపిన ఇంట్రాస్పీసీల శిఖరాలు.స్పెసియేషన్ ఈవెంట్లను చూపిన అంతర్జాతుల శిఖరాలు.ఇతర మూడు దగ్గరి సంబంధం ఉన్న జాతులతో పోల్చి చూస్తే, O. యూరోపియా ఇటీవల పెద్ద ఎత్తున జన్యు డూప్లికేషన్ ద్వారా వెళ్ళిందని విశ్లేషణ సూచించింది.
రావు జి మరియు ఇతరులు.హార్టికల్చర్ రీసెర్చ్, 2021
BMK కేసు
ముళ్ల లేకుండా గులాబీ: తేమ అనుసరణతో అనుసంధానించబడిన జన్యుపరమైన అంతర్దృష్టులు
ప్రచురించబడింది: నేషనల్ సైన్స్ రివ్యూ, 2021
సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం:
'బస్యే'లుముల్లులేని' (ఆర్.విచురైనన్) జన్యువు:
సుమారు93 X PacBio + సుమారు.90 X నానోపోర్ + 267 X ఇల్యూమినా
కీలక ఫలితాలు
1.హై క్వాలిటీ R.wichuriana జీనోమ్ లాంగ్-రీడ్ సీక్వెన్సింగ్ టెక్నిక్లను ఉపయోగించి నిర్మించబడింది, ఇది 530.07 Mb (అంచనా వేయబడిన జీనోమ్ పరిమాణం ఫ్లో సైటోమెట్రీ ద్వారా 525.9 Mb మరియు జీనోమ్ సర్వే ద్వారా 525.5 Mb) సుమారు 1.0% హెటెరోజైగోసిటీ.BUSCO అంచనా వేసిన స్కోరు 93.9%."ఓల్డ్ బ్లష్" (haploOB)తో పోల్చి చూస్తే, ఈ జన్యువు యొక్క నాణ్యత మరియు సంపూర్ణత బేస్ సింగిల్-బేస్ ఖచ్చితత్వం మరియు LTR అసెంబ్లీ ఇండెక్స్ (LAI=20.03) ద్వారా నిర్ధారించబడింది.R.wichuriana జన్యువు 32,674 ప్రోటీన్ కోడింగ్ జన్యువులను కలిగి ఉంది.
2.మల్టీ-ఓమిక్స్ జాయింట్ అనాలిసిస్, కంపారిటివ్ జెనోమిక్స్, ట్రాన్స్క్రిప్టోమిక్స్, క్యూటిఎల్ ఎనాలిసిస్ ఆఫ్ జెనెటిక్ పాపులేషన్, ఆర్. విచురియానా మరియు రోసా చినెన్సిస్ మధ్య కీలకమైన స్పెసియేషన్ను వెల్లడించింది.అలాగే, QTLలోని సంబంధిత జన్యువుల వ్యక్తీకరణ వైవిధ్యం స్టెమ్ ప్రికిల్ నమూనాతో సంబంధం కలిగి ఉంటుంది.
సింథనీ విశ్లేషణ, జీన్ ఫ్యామిలీ క్లస్టర్, విస్తరణ మరియు సంకోచ విశ్లేషణతో సహా Basye;s Thornless మరియు Rosa chinensis మధ్య తులనాత్మక జన్యుశాస్త్ర విశ్లేషణ, గులాబీలలోని కీలకమైన లక్షణాలకు సంబంధించిన పెద్ద సంఖ్యలో వైవిధ్యాలను వెల్లడించింది.NAC మరియు FAR1/FRS జన్యు కుటుంబంలో ప్రత్యేకమైన విస్తరణ బ్లాక్ స్పాట్కు నిరోధకతతో ముడిపడి ఉంటుంది.
BT మరియు haploOB జన్యువుల మధ్య తులనాత్మక జన్యుశాస్త్ర విశ్లేషణ.
జాంగ్, M., మరియు ఇతరులు."ప్రికిల్ లేకుండా గులాబీ: తేమ అనుసరణతో అనుసంధానించబడిన జన్యుపరమైన అంతర్దృష్టులు"నేషనల్ సైన్స్ రివ్యూ, 2021;, nwab092.