உயர் மார்க்கர் கண்டுபிடிப்பு திறன்- உயர்-செயல்திறன் வரிசைமுறை தொழில்நுட்பம் முழு மரபணுவிற்குள்ளும் நூறாயிரக்கணக்கான குறிச்சொற்களைக் கண்டறிய SLAF-Seq க்கு உதவுகிறது.
மரபணுவில் குறைந்த சார்பு- இது ஒரு குறிப்பு மரபணுவுடன் அல்லது இல்லாமல் இனங்களுக்குப் பயன்படுத்தப்படலாம்.
நெகிழ்வான திட்ட வடிவமைப்பு- ஒற்றை-நொதி, இரட்டை-நொதி, பல-நொதி செரிமானம் மற்றும் பல்வேறு வகையான நொதிகள், அனைத்தும் வெவ்வேறு ஆராய்ச்சி இலக்கு அல்லது இனங்களைப் பூர்த்தி செய்ய தேர்ந்தெடுக்கப்படலாம்.சிலிகோவில் முன் மதிப்பீடு ஒரு உகந்த நொதி வடிவமைப்பை உறுதிப்படுத்த பயன்படுகிறது.
திறமையான நொதி செரிமானம்- நிபந்தனைகளை மேம்படுத்துவதற்கு முன் பரிசோதனை மேற்கொள்ளப்பட்டது, இது முறையான பரிசோதனையை நிலையானதாகவும் நம்பகமானதாகவும் ஆக்குகிறது.துண்டு சேகரிப்பு திறன் 95% க்கும் மேல் அடையலாம்.
சமமாக விநியோகிக்கப்படும் SLAF குறிச்சொற்கள்- SLAF குறிச்சொற்கள் அனைத்து குரோமோசோம்களிலும் மிகப் பெரிய அளவில் சமமாக விநியோகிக்கப்படுகின்றன, 4 kb க்கு சராசரியாக 1 SLAF ஐ அடைகிறது.
மறுநிகழ்வுகளை திறம்பட தவிர்ப்பது- SLAF-Seq தரவுகளில் மீண்டும் மீண்டும் வரும் வரிசை 5%க்கும் குறைவாகக் குறைக்கப்படுகிறது, குறிப்பாக கோதுமை, மக்காச்சோளம் போன்ற அதிக அளவிலான ரிபீட்களைக் கொண்ட இனங்களில்.
விரிவான அனுபவம்தாவரங்கள், பாலூட்டிகள், பறவைகள், பூச்சிகள், நீர்வாழ் உயிரினங்கள் போன்றவற்றை உள்ளடக்கிய நூற்றுக்கணக்கான உயிரினங்களில் 2000-க்கும் மேற்பட்ட மூடப்பட்ட SLAF-Seq திட்டங்கள்.
சுய-வளர்ச்சியடைந்த உயிர் தகவலியல் பணிப்பாய்வு- SLAF-Seq க்கான ஒருங்கிணைந்த பயோ-இன்ஃபர்மேடிக் பணிப்பாய்வு BMKGENE ஆல் இறுதி வெளியீட்டின் நம்பகத்தன்மை மற்றும் துல்லியத்தை உறுதிப்படுத்த உருவாக்கப்பட்டது.
நடைமேடை | Conc.(ng/gl) | மொத்தம் (ug) | OD260/280 |
இல்லுமினா நோவாசெக் | >35 | >1.6(தொகுதி>15μl) | 1.6-2.5 |
வரிசைமுறை ஆழம்: 10X/டேக்
மரபணு அளவு | பரிந்துரைக்கப்பட்ட SLAF குறிச்சொற்கள் |
< 500 Mb | 100K அல்லது WGS |
500 எம்பி- 1 ஜிபி | 100 கே |
1 ஜிபி -2 ஜிபி | 200 கே |
மாபெரும் அல்லது சிக்கலான மரபணுக்கள் | 300 - 400K |
விண்ணப்பங்கள்
| பரிந்துரைக்கப்படுகிறது மக்கள் தொகை அளவு
| வரிசைப்படுத்துதல் உத்தி மற்றும் ஆழம்
| |
ஆழம்
| குறி எண்
| ||
GWAS
| மாதிரி எண் ≥ 200
| 10X
|
படி மரபணு அளவு
|
மரபணு பரிணாமம்
| ஒவ்வொருவரின் தனி நபர்கள் துணைக்குழு ≥ 10; மொத்த மாதிரிகள் ≥30
| 10X
|
கொள்கலன்: 2 மில்லி மையவிலக்கு குழாய்
பெரும்பாலான மாதிரிகளுக்கு, எத்தனாலில் சேமிக்க வேண்டாம் என்று பரிந்துரைக்கிறோம்.
மாதிரி லேபிளிங்: மாதிரிகள் தெளிவாக லேபிளிடப்பட வேண்டும் மற்றும் சமர்ப்பிக்கப்பட்ட மாதிரி தகவல் படிவத்துடன் ஒத்ததாக இருக்க வேண்டும்.
ஏற்றுமதி: உலர்-பனி: மாதிரிகளை முதலில் பைகளில் அடைத்து உலர் பனியில் புதைக்க வேண்டும்.
1. வரைபட முடிவின் புள்ளிவிவரங்கள்
2. SLAF மார்க்கர் மேம்பாடு
3. மாறுபாடு சிறுகுறிப்பு
ஆண்டு | இதழ் | IF | தலைப்பு | விண்ணப்பங்கள் |
2022 | இயற்கை தொடர்பு | 17.694 | ட்ரீ பியோனியின் கிகா-குரோமோசோம்கள் மற்றும் ஜிகா-ஜீனோம் ஆகியவற்றின் மரபணு அடிப்படை பியோனியா ஆஸ்டி | SLAF-GWAS |
2015 | புதிய பைட்டாலஜிஸ்ட் | 7.433 | வேளாண்மை முக்கியத்துவம் வாய்ந்த மரபியல் பகுதிகளை வீட்டுத் தடங்கள் நங்கூரமிடுகின்றன சோயாபீன்ஸ் | SLAF-GWAS |
2022 | மேம்பட்ட ஆராய்ச்சி இதழ் | 12.822 | ஜி. ஹிர்சுட்டமுக்குள் கோசிபியம் பார்படென்ஸின் மரபணு அளவிலான செயற்கையான ஊடுருவல்கள் பருத்தி இழையின் தரம் மற்றும் விளைச்சலை ஒரே நேரத்தில் மேம்படுத்துவதற்கான உயர்ந்த இடத்தை வெளிப்படுத்துகிறது பண்புகள் | SLAF- பரிணாம மரபியல் |
2019 | மூலக்கூறு ஆலை | 10.81 | மக்கள்தொகை மரபணு பகுப்பாய்வு மற்றும் டி நோவோ அசெம்பிளி ஆகியவை வீடியின் தோற்றத்தை வெளிப்படுத்துகின்றன ஒரு பரிணாம விளையாட்டாக அரிசி | SLAF- பரிணாம மரபியல் |
2019 | இயற்கை மரபியல் | 31.616 | பொதுவான கெண்டை, சைப்ரினஸ் கார்பியோவின் மரபணு வரிசை மற்றும் மரபணு வேறுபாடு | SLAF-இணைப்பு வரைபடம் |
2014 | இயற்கை மரபியல் | 25.455 | பயிரிடப்பட்ட வேர்க்கடலையின் மரபணு பருப்பு வகை காரியோடைப், பாலிப்ளோயிட் பற்றிய நுண்ணறிவை வழங்குகிறது பரிணாமம் மற்றும் பயிர் வளர்ப்பு. | SLAF-இணைப்பு வரைபடம் |
2022 | தாவர பயோடெக்னாலஜி ஜர்னல் | 9.803 | ST1 ஐ அடையாளம் காண்பது, விதை உருவ அமைப்பைப் பற்றிய ஒரு தேர்வை வெளிப்படுத்துகிறது மற்றும் சோயாபீன் வளர்ப்பின் போது எண்ணெய் உள்ளடக்கம் | SLAF-மார்க்கர் வளர்ச்சி |
2022 | மூலக்கூறு அறிவியல் சர்வதேச இதழ் | 6.208 | கோதுமை-லேமஸ் மோலிஸ் 2Ns (2D)க்கான அடையாளம் மற்றும் DNA குறிப்பான் மேம்பாடு டிசோமிக் குரோமோசோம் மாற்று | SLAF-மார்க்கர் வளர்ச்சி |