-
BSA
மொத்தமாக பிரிக்கப்பட்ட பகுப்பாய்வு தளம் தனிப்பயனாக்கப்பட்ட அளவுரு அமைப்பைக் கொண்ட ஒரு-படி நிலையான பகுப்பாய்வு மற்றும் மேம்பட்ட பகுப்பாய்வு ஆகியவற்றைக் கொண்டுள்ளது.பிஎஸ்ஏ என்பது பினோடைப் தொடர்புடைய மரபணு குறிப்பான்களை விரைவாக அடையாளம் காண பயன்படுத்தப்படும் ஒரு நுட்பமாகும்.BSA இன் முக்கிய பணிப்பாய்வு பின்வருவனவற்றைக் கொண்டுள்ளது: 1. மிகவும் எதிரெதிர் பினோடைப்களைக் கொண்ட தனிநபர்களின் இரண்டு குழுக்களைத் தேர்ந்தெடுப்பது;2. டிஎன்ஏ, ஆர்என்ஏ அல்லது எஸ்எல்ஏஎஃப்-சீக் (பயோமார்க்கரால் உருவாக்கப்பட்டது) இரண்டு மொத்த டிஎன்ஏவை உருவாக்குவது;3. குறிப்பு மரபணுவிற்கு எதிராக அல்லது இடையில் வேறுபட்ட வரிசைகளை அடையாளம் காணுதல், 4. ED மற்றும் SNP-இண்டெக்ஸ் அல்காரிதம் மூலம் வேட்பாளர் இணைக்கப்பட்ட பகுதிகளை கணித்தல்;5. வேட்பாளர் பகுதிகளில் உள்ள மரபணுக்கள் மீதான செயல்பாட்டு பகுப்பாய்வு மற்றும் செறிவூட்டல், முதலியன. மரபணு மார்க்கர் ஸ்கிரீனிங் மற்றும் ப்ரைமர் வடிவமைப்பு உள்ளிட்ட தரவுகளில் மிகவும் மேம்பட்ட சுரங்கங்களும் கிடைக்கின்றன.
-
ஆம்ப்ளிகான் (16S/18S/ITS)
ஆம்ப்ளிகான் (16S/18S/ITS) இயங்குதளமானது நுண்ணுயிர் பன்முகத்தன்மை திட்ட பகுப்பாய்வில் பல வருட அனுபவத்துடன் உருவாக்கப்பட்டது, இதில் தரப்படுத்தப்பட்ட அடிப்படை பகுப்பாய்வு மற்றும் தனிப்பயனாக்கப்பட்ட பகுப்பாய்வு உள்ளது: அடிப்படை பகுப்பாய்வு தற்போதைய நுண்ணுயிர் ஆராய்ச்சியின் முக்கிய பகுப்பாய்வு உள்ளடக்கத்தை உள்ளடக்கியது, பகுப்பாய்வு உள்ளடக்கம் பணக்கார மற்றும் விரிவானது, மற்றும் பகுப்பாய்வு முடிவுகள் திட்ட அறிக்கைகள் வடிவில் வழங்கப்படுகின்றன;தனிப்பயனாக்கப்பட்ட பகுப்பாய்வின் உள்ளடக்கம் வேறுபட்டது.தனிப்பயனாக்கப்பட்ட தேவைகளை உணர, மாதிரிகளைத் தேர்ந்தெடுக்கலாம் மற்றும் அடிப்படை பகுப்பாய்வு அறிக்கை மற்றும் ஆராய்ச்சி நோக்கத்தின்படி அளவுருக்களை நெகிழ்வாக அமைக்கலாம்.விண்டோஸ் இயங்குதளம், எளிய மற்றும் வேகமானது.
-
பரிணாம மரபியல்
பரிணாம மரபியல் என்பது SNPகள், InDels, SVகள் மற்றும் CNVகள் உள்ளிட்ட மரபணு மாறுபாடுகளின் அடிப்படையில் கொடுக்கப்பட்ட பொருட்களின் பரிணாமத் தகவல்களின் விரிவான விளக்கத்தை வழங்குவதற்காக வடிவமைக்கப்பட்ட நிரம்பிய வரிசைமுறை சேவையாகும்.மக்கள்தொகை அமைப்பு, மரபணு வேறுபாடு, பைலோஜெனி உறவுகள் போன்ற மக்கள்தொகையின் பரிணாம மாற்றங்கள் மற்றும் மரபணு அம்சங்களை விவரிக்க தேவையான அனைத்து அடிப்படை பகுப்பாய்வுகளையும் இது வழங்குகிறது. இது மரபணு ஓட்டம் பற்றிய ஆய்வுகளையும் கொண்டுள்ளது, இது பயனுள்ள மக்கள்தொகை அளவு, வேறுபட்ட நேரத்தை மதிப்பிடுவதற்கு அதிகாரம் அளிக்கிறது.
-
ஒப்பீட்டு மரபியல்
ஒப்பீட்டு மரபியல் என்பது வெவ்வேறு உயிரினங்களின் முழுமையான மரபணு வரிசைகள் மற்றும் கட்டமைப்புகளை ஒப்பிடுவதாகும்.இந்த ஒழுங்குமுறையானது பல்வேறு உயிரினங்களில் பாதுகாக்கப்பட்ட அல்லது வேறுபடுத்தப்பட்ட வரிசை கட்டமைப்புகள் மற்றும் தனிமங்களை அடையாளம் காண்பதன் மூலம் இனங்கள் பரிணாமம், மரபணு செயல்பாடு, மரபணு ஒழுங்குமுறை பொறிமுறையை மரபணு மட்டத்தில் வெளிப்படுத்துவதை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளது.வழக்கமான ஒப்பீட்டு மரபியல் ஆய்வில் மரபணு குடும்பம், பரிணாம வளர்ச்சி, முழு மரபணு நகல், தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட அழுத்தம் போன்றவற்றில் பகுப்பாய்வுகள் அடங்கும்.
-
பரிணாம மரபியல்
மக்கள்தொகை மற்றும் பரிணாம மரபணு பகுப்பாய்வு தளம் பல ஆண்டுகளாக BMK R&D குழுவில் திரட்டப்பட்ட பாரிய அனுபவத்தின் அடிப்படையில் நிறுவப்பட்டது.குறிப்பாக பயோ இன்ஃபர்மேட்டிக்ஸில் அதிகம் தேர்ச்சி பெறாத ஆராய்ச்சியாளர்களுக்கு இது ஒரு பயனர் நட்புக் கருவியாகும்.இந்த தளமானது ஃபைலோஜெனடிக் மர கட்டுமானம், இணைப்பு சமநிலையின்மை பகுப்பாய்வு, மரபணு வேறுபாடு மதிப்பீடு, தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட ஸ்வீப் பகுப்பாய்வு, உறவினர் பகுப்பாய்வு, பிசிஏ, மக்கள்தொகை கட்டமைப்பு பகுப்பாய்வு போன்ற அடிப்படை பரிணாம மரபியல் தொடர்பான அடிப்படை பகுப்பாய்வுகளை செயல்படுத்துகிறது.
-
ஹை-சி அடிப்படையிலான ஜீனோம் அசெம்பிளி
ஹை-சி என்பது குரோமோசோம் உள்ளமைவைப் பிடிக்க வடிவமைக்கப்பட்ட ஒரு முறையாகும்.இந்த இடைவினைகளின் தீவிரம் குரோமோசோம்களில் உள்ள உடல் தூரத்துடன் எதிர்மறையாக தொடர்புடையதாக நம்பப்படுகிறது.எனவே, ஹை-சி தரவு ஒரு வரைவு மரபணுவில் கூடியிருந்த வரிசைகளின் கிளஸ்டரிங், வரிசைப்படுத்துதல் மற்றும் நோக்குநிலை மற்றும் குறிப்பிட்ட எண்ணிக்கையிலான குரோமோசோம்களில் அவற்றைத் தொகுத்தல் ஆகியவற்றை வழிநடத்தும்.இந்த தொழில்நுட்பம் மக்கள்தொகை அடிப்படையிலான மரபணு வரைபடம் இல்லாத நிலையில் குரோமோசோம் அளவிலான மரபணு கூட்டத்தை மேம்படுத்துகிறது.ஒவ்வொரு மரபணுவிற்கும் ஹை-சி தேவை.
இயங்குதளம்: இல்லுமினா நோவாசெக் இயங்குதளம் / DNBSEQ
-
தாவர/விலங்கு டி நோவோ ஜீனோம் வரிசைமுறை
டி நோவோவரிசைப்படுத்துதல் என்பது ஒரு இனத்தின் முழு மரபணுவை வரிசைப்படுத்தும் தொழில்நுட்பங்களைப் பயன்படுத்தி உருவாக்குவதைக் குறிக்கிறது, எ.கா. PacBio, Nanopore, NGS, முதலியன, குறிப்பு மரபணு இல்லாத நிலையில்.மூன்றாம் தலைமுறை வரிசைமுறை தொழில்நுட்பங்களின் வாசிப்பு நீளத்தில் குறிப்பிடத்தக்க முன்னேற்றம், சிக்கலான மரபணுக்களை ஒன்று சேர்ப்பதில் புதிய வாய்ப்புகளைக் கொண்டு வந்துள்ளது, அதாவது உயர் ஹீட்டோரோசைகோசிட்டி, மீண்டும் மீண்டும் நிகழும் பகுதிகளின் அதிக விகிதம், பாலிப்ளாய்டுகள் போன்றவை. பல்லாயிரக்கணக்கான கிலோபேஸ் அளவில் படிக்கும் நீளத்துடன், இந்த வரிசைமுறை வாசிப்புகளை செயல்படுத்துகிறது. மீண்டும் மீண்டும் வரும் கூறுகள், அசாதாரண GC உள்ளடக்கங்களைக் கொண்ட பகுதிகள் மற்றும் பிற மிகவும் சிக்கலான பகுதிகளைத் தீர்ப்பது.
இயங்குதளம்: PacBio தொடர் II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq இயங்குதளம்
-
மனித முழு எக்ஸோம் வரிசைமுறை
முழு எக்ஸோம் சீக்வென்சிங் (WES) நோயை உண்டாக்கும் பிறழ்வுகளைக் கண்டறிவதற்கான செலவு குறைந்த வரிசைமுறை உத்தியாகக் கருதப்படுகிறது.எக்ஸான்கள் முழு மரபணுவில் தோராயமாக 1.7% மட்டுமே எடுத்துக் கொண்டாலும், இது மொத்த புரதச் செயல்பாடுகளின் சுயவிவரத்தை நேரடியாகக் குறிக்கிறது.மனித மரபணுவில், 85%க்கும் அதிகமான நோய் தொடர்பான பிறழ்வுகள் புரதக் குறியீட்டுப் பகுதியில் ஏற்படுவதாக தெரிவிக்கப்பட்டுள்ளது.
BMKGENE ஆனது பல்வேறு ஆராய்ச்சி இலக்குகளை அடைய பல்வேறு எக்ஸான் கேப்சரிங் உத்திகளுடன் விரிவான மற்றும் நெகிழ்வான மனித முழு எக்ஸோம் சீக்வென்சிங் சேவைகளை வழங்குகிறது.
இயங்குதளம்: இல்லுமினா நோவாசெக் இயங்குதளம்
-
குறிப்பிட்ட-உள்ளூர் பெருக்கப்பட்ட துண்டு வரிசைமுறை (SLAF-Seq)
உயர்-செயல்திறன் மரபணு வகைப்படுத்தல், குறிப்பாக பெரிய அளவிலான மக்கள்தொகையில், மரபணு தொடர்பு ஆய்வுகளில் ஒரு அடிப்படை படியாகும், இது செயல்பாட்டு மரபணு கண்டுபிடிப்பு, பரிணாம பகுப்பாய்வு போன்றவற்றுக்கு மரபணு அடிப்படையை வழங்குகிறது. ஆழமான முழு மரபணு மறு வரிசைமுறைக்கு பதிலாக, குறைக்கப்பட்ட பிரதிநிதித்துவ மரபணு வரிசைமுறை (RRGS ) ஒரு மாதிரிக்கான வரிசைமுறை செலவைக் குறைக்க அறிமுகப்படுத்தப்பட்டது, அதே நேரத்தில் மரபணு மார்க்கர் கண்டுபிடிப்பில் நியாயமான செயல்திறனைப் பராமரிக்கிறது.குறைக்கப்பட்ட பிரதிநிதித்துவ நூலகம் (RRL) எனப் பெயரிடப்பட்ட அளவு வரம்பிற்குள் கட்டுப்பாட்டுப் பகுதியைப் பிரித்தெடுப்பதன் மூலம் இது பொதுவாக அடையப்படுகிறது.ஸ்பெசிஃபிக்-லோகஸ் ஆம்ப்ளிஃபைட் ஃபிராக்மென்ட் சீக்வென்சிங் (SLAF-Seq) என்பது குறிப்பு மரபணுவுடன் அல்லது இல்லாமல் SNP மரபணு வகைப்படுத்தலுக்கான ஒரு சுய-வளர்ச்சியடைந்த உத்தி ஆகும்.
இயங்குதளம்: இல்லுமினா நோவாசெக் இயங்குதளம் -
இல்லுமினா மற்றும் பிஜிஐ
இலுமினா சீக்வென்சிங் டெக்னாலஜி, சீக்வென்சிங் பை சின்தசிஸ் (SBS) அடிப்படையிலானது, இது உலகளவில் ஏற்றுக்கொள்ளப்பட்ட NGS கண்டுபிடிப்பு ஆகும், இது உலகின் 90% க்கும் மேற்பட்ட வரிசைமுறை தரவுகளை உருவாக்குவதற்கு பொறுப்பாகும்.SBS இன் கொள்கையானது, ஒவ்வொரு டிஎன்டிபியும் சேர்க்கப்படும்போது, ஃப்ளோரசன்ட் லேபிளிடப்பட்ட ரிவர்சிபிள் டெர்மினேட்டர்களை இமேஜிங் செய்வதையும், அதன்பின் அடுத்த தளத்தை இணைக்க அனுமதிக்கும் வகையில் பிளவுபடுவதையும் உள்ளடக்கியது.ஒவ்வொரு வரிசைமுறை சுழற்சியிலும் நான்கு ரிவர்சிபிள் டெர்மினேட்டர்-பிவுண்ட் டிஎன்டிபிகள் இருப்பதால், இயற்கையான போட்டி ஒருங்கிணைப்பு சார்புகளைக் குறைக்கிறது.இந்த பல்துறை தொழில்நுட்பம் ஒற்றை-வாசிப்பு மற்றும் ஜோடி-இறுதி நூலகங்களை ஆதரிக்கிறது, இது மரபணு பயன்பாடுகளின் வரம்பிற்கு உதவுகிறது.இலுமினா சீக்வென்சிங்கின் உயர்-செயல்திறன் திறன்கள் மற்றும் துல்லியமானது மரபணு ஆராய்ச்சியில் ஒரு மூலக்கல்லாக நிலைநிறுத்துகிறது, ஒப்பிடமுடியாத விவரங்கள் மற்றும் செயல்திறனுடன் மரபணுக்களின் நுணுக்கங்களை அவிழ்க்க விஞ்ஞானிகளுக்கு அதிகாரம் அளிக்கிறது.
DNBSEQ, BGI ஆல் உருவாக்கப்பட்டது, இது மற்றொரு புதுமையான NGS தொழில்நுட்பமாகும்.டிஎன்பிஎஸ்இக்யூ நூலகங்களைத் தயாரிப்பதில் டிஎன்ஏ துண்டாடுதல், எஸ்எஸ்டிஎன்ஏ தயாரித்தல் மற்றும் டிஎன்ஏ நானோபால்களை (டிஎன்பி) பெற உருட்டல் வட்டப் பெருக்கம் ஆகியவை அடங்கும்.இவை பின்னர் ஒரு திடமான மேற்பரப்பில் ஏற்றப்பட்டு, பின்னர் கூட்டு ஆய்வு-ஆங்கர் தொகுப்பு (cPAS) மூலம் வரிசைப்படுத்தப்படுகின்றன.
எங்களின் முன் தயாரிக்கப்பட்ட நூலக வரிசைப்படுத்தல் சேவையானது வாடிக்கையாளர்களுக்கு பல்வேறு மூலங்களிலிருந்து (mRNA, முழு ஜீனோம், ஆம்ப்ளிகான், மற்றவற்றுடன்) வரிசைப்படுத்தும் நூலகங்களைத் தயாரிக்க உதவுகிறது.பின்னர், இந்த நூலகங்கள் தரக் கட்டுப்பாடு மற்றும் இல்லுமினா அல்லது BGI இயங்குதளங்களில் வரிசைப்படுத்துவதற்காக எங்கள் வரிசைமுறை மையங்களுக்கு அனுப்பப்படும்.
