தாவர/விலங்கு முழு ஜீனோம் வரிசைமுறை
1.சேவை நன்மைகள்
1000 க்கும் மேற்பட்ட உயிரினங்களுக்கான மரபணு வரிசைமுறையில் விரிவான அனுபவம்.
4000க்கும் அதிகமான தாக்கக் காரணி கொண்ட 800க்கும் மேற்பட்ட வெளியிடப்பட்ட வழக்குகள்.
மாறுபாடு அழைப்பு மற்றும் செயல்பாடு பகுப்பாய்வு பற்றிய விரிவான உயிர் தகவலியல் பகுப்பாய்வு.
2. சேவை விவரக்குறிப்புகள்
| நடைமேடை | நூலகம் | பரிந்துரைக்கப்பட்ட வரிசை ஆழம் | |
| இல்லுமினா | PE 150 | SNPக்கு, InDel அழைப்பு ≥ 10x SVக்கு, CNY அழைப்பு ≥ 30x
| |
| நானோபூர்
| 8 கி.பி | SVக்கு, CNY அழைப்பு ≥ 20x | |
| பேக்பியோ | CCS | 15 கி.பி | SNP, InDel, SV, CNY அழைப்புகளுக்கு ≥ 10x |
3. மாதிரி தேவைகள்
| நடைமேடை | Conc.(ng/μL)
| தொகை (என்ஜி)
| தூய்மை
| அகரோஸ் ஜெல்
| ||
| OD260/280 | OD260/230 | 1. மெயின் பேண்ட் இல்லாத அல்லது வரம்பிடாமல் அழிக்கவும்ஜெல் மீது காணப்படும் சிதைவு. 2. இல்லை அல்லது வரையறுக்கப்பட்ட RNA அல்லது புரத மாசுபாடு
| ||||
| இல்லுமினா | ≥1 | ≥30
| - | - | ||
| நானோபூர்
| ≥30 | தரவு விளைச்சலைப் பொறுத்தது 10μg/செல் | 1.7-2.2 | ≥1.5 | ||
| பேக்பியோ | CCS | ≥50 | 1.7-2.2 | 1.8-2.5 | ||
4. உயிர் தகவல் பகுப்பாய்வு
5. சேவை வேலை ஓட்டம்
மாதிரி விநியோகம்
டிஎன்ஏ பிரித்தெடுத்தல்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
தரவு விநியோகம்
1) ஜீனோம் மேப்பிங்கின் புள்ளிவிவரங்கள்
அட்டவணை 1 மேப்பிங் முடிவின் புள்ளிவிவரங்கள்
படம் 1 இன்செர்ட் அளவு மற்றும் கவரேஜ் படிக்கிறது.
2) மாறுபாடு கண்டறிதல்
படம் 2 மாதிரிகளில் SNP/INDEL/SV இன் புள்ளிவிவரங்கள் மற்றும் சிறுகுறிப்பு
படம் 3 ஜீனோம் அளவிலான வடிவேஷன்களின் விநியோகம்
3) மாறுபாடுகளின் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு
| 2019 | இயற்கை தொடர்பு | முழு-மரபணு ஒத்திசைவு பிராசிகா நாபஸ் தோற்றம் மற்றும் அதன் முன்னேற்றத்தில் ஈடுபட்டுள்ள மரபணு இடங்களை வெளிப்படுத்துகிறது |
| 2020 | PNAS | தங்கமீனின் பரிணாம தோற்றம் மற்றும் வளர்ப்பு வரலாறு (காரசியஸ் ஆரடஸ்) |
| 2021 | தாவர பயோடெக்னாலஜி ஜர்னல் | பயிரிடப்பட்ட இரண்டு சணல் இனங்களின் குறிப்பு மரபணுக்கள் |
| 2021 | தாவர பயோடெக்னாலஜி ஜர்னல் | காய்கறி மற்றும் எண்ணெய் வித்து அலோபாலிப்ளோயிட் பிராசிகாஜுன்சியாவின் மரபணு கையொப்பங்கள் மற்றும் குளுக்கோசினோலேட்டுகளின் திரட்சியைக் கட்டுப்படுத்தும் மரபணு இடங்கள் |
| 2019 | மூலக்கூறு ஆலை | ராப்சீட் அணுகல்களின் உலகளாவிய தொகுப்பின் முழு-மரபணு வரிசைப்படுத்தல் அவற்றின் சுற்றுச்சூழல் வகை வேறுபாட்டின் மரபணு அடிப்படையை வெளிப்படுத்துகிறது |
| 2022 | தோட்டக்கலை ஆராய்ச்சி | ஜீனோம்-வைட் அசோசியேஷன் பகுப்பாய்வு தர்பூசணி விதை அளவின் இயற்கை மாறுபாட்டின் மூலக்கூறு நுண்ணறிவுகளை வழங்குகிறது |
| 2021 | பரிசோதனை தாவரவியல் இதழ் | ஜீனோம்-வைடு அசோசியேஷன் ஆய்வு பருத்தியில் குளிர் சகிப்புத்தன்மையை வழங்கும் GhSAD1 இன் மாறுபாடுகளை அடையாளம் காட்டுகிறது |
| 2021 | பரிசோதனை தாவரவியல் இதழ் | ஜீனோம்-வைட் அசோசியேஷன் ஆய்வு மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் ஒப்பீடு நாவல் QTL மற்றும் கேண்டிடேட் ஜீன்களை வெளிப்படுத்துகிறது, அவை ராப்சீட்டில் இதழ் அளவைக் கட்டுப்படுத்துகின்றன |
