BMKCloud Log in
条形பேனர்-03

செய்தி

ஜீனோம் பரிணாமம்

இயற்கை
தொடர்புகள்

மரபணு வரிசைகள் உலகளாவிய பரவல் வழிகளை வெளிப்படுத்துகின்றன மற்றும் கடல் குதிரை பரிணாம வளர்ச்சியில் ஒன்றிணைந்த மரபணு தழுவல்களை பரிந்துரைக்கின்றன

PacBio |இல்லுமினா |ஹை-சி |WGS |மரபணு வேறுபாடு |மக்கள்தொகை வரலாறு |மரபணு ஓட்டம்

பயோமார்க்கர் டெக்னாலஜிஸ் மூலம் பேக்பியோ வரிசைமுறை, ஜீனோம் டி நோவோ அசெம்பிளி மற்றும் சிறுகுறிப்பு சேவைகள் வழங்கப்பட்டன.

சிறப்பம்சங்கள்

1.15.5 Mb இன் கான்டிக் N50 உடன் உயர்தர குரோமோசோம்-நிலை கடல் குதிரை (ஹிப்போகாம்பஸ் எரெக்டஸ்) மரபணு பெறப்பட்டது.

2.உலகெங்கிலும் உள்ள 21 கடல் குதிரை இனங்களிலிருந்து மொத்தம் 358 மரபணுக்கள் வரிசைப்படுத்தப்பட்டன.

3.ஆலிகோசீனின் பிற்பகுதியில் கடல் குதிரைகள் உருவானது மற்றும் அடுத்தடுத்த சுற்று-உலகளாவிய காலனித்துவ வழிகள் அடையாளம் காணப்பட்டு, கடல் நீரோட்டங்கள் மற்றும் பேலியோடெம்போரல் கடல்வழி திறப்புகளில் மாறும் இயக்கவியலுடன் இணைக்கப்பட்டுள்ளன.

4.தொடர்ந்து வரும் "எலும்பு முதுகெலும்புகள்" தழுவல் பினோடைப்பின் மரபணு அடிப்படையானது ஒரு முக்கிய வளர்ச்சி மரபணுவில் உள்ள சுயாதீன மாற்றீடுகளுடன் இணைக்கப்பட்டுள்ளது.

5. கடல் நீரோட்டங்கள் வழியாக ராஃப்டிங் மோசமான பரவலை ஈடுசெய்கிறது மற்றும் விரைவான தழுவல் புதிய வாழ்விடங்களை காலனித்துவப்படுத்த உதவுகிறது

சாதனைகள்

seahouse-fig-1

படம் 1 மரபணு வேறுபாடு மற்றும் 358 கடல் குதிரை மாதிரிகளின் பைலோஜெனடிக் உறவுகள்

22 குரோமோசோம்களில் உள்ள 21 கடல் குதிரை இனங்களின் நியூக்ளியோடைடு பன்முகத்தன்மையின் (π) வடிவங்களைக் கொண்ட மாதிரி கடல் குதிரைகளுக்கான புவியியல் மாதிரி இடங்கள்.b 358 கடல் குதிரைகளின் மரபணு அளவிலான SNP களைக் கொண்டு கட்டப்பட்ட நெய்பர்ஜைனிங் மரம்.(a) இல் இருப்பிட முள் குறியீடுகளும் (b) இல் உள்ள கிளை பின்னணியும் ஒன்றுக்கொன்று ஒத்திருக்கும்.

seahouse-fig-2-1024x720

படம் 2 கடல் குதிரைகளின் குடியேற்றம் மற்றும் மக்கள்தொகை வரலாறு

21 கடல் குதிரை இனங்களுக்கான பைலோஜெனடிக் மரம் மற்றும் வேறுபாடு நேர மதிப்பீடுகள்.கிளைக் கோடு தடிமன் மக்கள்தொகை அளவு மதிப்பீடுகளுக்கு (Ne) ஒத்திருக்கிறது மற்றும் வண்ணங்கள் வெவ்வேறு பரம்பரைகளைக் குறிக்கின்றன.I-III குறியீடுகள் அளவுத்திருத்த புள்ளிகளைக் குறிக்கின்றன.b-d கடல் குதிரைகளின் காலனித்துவ வழிகள் (வண்ண அம்புகள்) வேறுபடும் நேரம், விநியோகம், துணை நிகழ்வுகள் மற்றும் கடல் நீரோட்டங்கள் (வெள்ளை அம்புகள்) ஆகியவற்றின் அடிப்படையில் கணிக்கப்பட்டது.b இந்தோ-ஆஸ்திரேலிய தீவுக்கூட்டம் ஹிப்போகாம்பஸ் இனத்தின் பிறப்பிடத்தின் மையமாக இருந்தது (சிவப்பு குறியிடுதல்) கடல் குதிரைகள் 18-23 Ma வரை உலகளவில் பரவியது.c கடல் குதிரைகள் ஆரம்பத்தில் அட்லாண்டிக் பெருங்கடலை திறக்கும் டெத்தியன் கடல்வழியின் மூலம் காலனித்துவப்படுத்தியது, அது மூடப்பட்ட பிறகு (7-13 Ma இன் டெர்மினல் நிகழ்வு), இந்த டெத்தியன் பரம்பரையை அதன் இந்தியப் பெருங்கடலின் சகோதரி பரம்பரையிலிருந்து பிரித்தது.பிந்தையது, பின்னர் அரேபிய கடலில் விரைவாக பல்வகைப்படுத்தப்பட்டது (மஞ்சள் குறி), கடல் குதிரை பல்வகைப்படுத்தலின் இரண்டாவது மையத்தை நிறுவியது.d அட்லாண்டிக் பெருங்கடலின் இரண்டாவது கடல் குதிரைக் காலனித்துவ நிகழ்வு இந்தியப் பெருங்கடலில் இருந்து தென்னாப்பிரிக்க முனையைக் கடந்து 5Ma இல் நிகழ்ந்தது, இறுதியாக கிழக்கு பசிபிக் பெருங்கடலை இன்னும் திறந்திருக்கும் பனாமா கடல்வழி சுமார் 3.6 Ma.

seahouse-fig-3-1024x563

படம் 3 மரபணு ஓட்டம் மற்றும் பயனுள்ள மக்கள் தொகையில் ஏற்ற இறக்கங்கள்

தெற்கு அட்லாண்டிக் பெருங்கடலில் வாழும் உயிரினங்களுக்கு இடையே மரபணு ஓட்டம் கண்டறியப்பட்டது.G-PhoCS ஆல் இடம்பெயர்வு வீதமாக வெள்ளைக் கோடுகளுக்கு அருகில் மரபணு ஓட்டம் காட்டப்படுகிறது.அம்புகளின் தடிமன் மற்றும் திசை முறையே மரபணு ஓட்டத்தின் விகிதங்கள் மற்றும் திசைக்கு ஒத்திருக்கிறது.b PSMC மூலம் பயனுள்ள மக்கள்தொகை அளவில் ஏற்ற இறக்கங்கள்.x அச்சு நிகழ்காலத்திற்கு முந்தைய ஆண்டுகளில் நேரத்தைக் குறிக்கிறது, அதே நேரத்தில் y அச்சு பயனுள்ள மக்கள்தொகை அளவைக் குறிக்கிறது.வெவ்வேறு விநியோகப் பகுதிகளைக் கொண்ட ஒவ்வொரு இனத்திற்கும் புவியியல் விநியோகத்தின் படி விளக்கப்படங்கள் முக்கியமாக ஒழுங்கமைக்கப்பட்டுள்ளன.c கடந்த 1 மில்லியன் ஆண்டுகளில் கடல் மட்டத்தில் மீற்றரில் மாற்றம்.மஞ்சள் கோடு கடைசி உலகளாவிய பனிப்பாறை உச்சத்தை குறிக்கிறது, சியான் நிழல் கடைசி பனிப்பாறை அதிகபட்ச காலத்தை குறிக்கிறது.

seahouse-fig-4

படம் 4 முதுகெலும்புகளின் பரிணாமம்.

இடதுபுறத்தில், கடல் குதிரைகளில் முதுகெலும்புகளின் சுயாதீன பரிணாமத்தை காட்டும் இனங்கள் மரம்.கிளை நீளம் ஒரு தளத்திற்கு மாற்றீடுகளின் எண்ணிக்கையைக் குறிக்கிறது.நான்கு ஸ்பைனி கடல் குதிரை இனங்கள் நீல நிறத்தில் சிறப்பிக்கப்பட்டுள்ளன.தடிமனான கிளைகள் பிஎம்பி 3 மரபணுவிற்கான அதிக விகிதங்களுக்கு ஒத்த பொருளற்ற-இருப்பொருள் மாற்றீடுகள் (dN/dS) ஒத்திருக்கும்.Bmp3 மரபணுவிற்கான நியமன மற்றும் பொதுமைப்படுத்தப்பட்ட McDonald மற்றும் Kreitman சோதனை (MKT) மூன்று ஜோடிவரிசை சகோதரி இனங்களுக்கு வெவ்வேறு ஸ்பைனி மற்றும் ஸ்பைனி அல்லாத அம்சங்களுடன் பின்னணி வண்ணங்களால் சிறப்பிக்கப்பட்டது, அதன் முக்கியத்துவ நிலைகள் முறையே நீலம் மற்றும் சிவப்பு எழுத்துருவுடன் p மதிப்பால் குறிக்கப்பட்டன.சரி, bmp3 புரதத்தில் உள்ள அமினோ அமில மாற்றுகளின் ஒப்பீடு, ஸ்பைனி கடல் குதிரைகளில் பாலிமார்பிக் மற்றும் நிலையான மாற்றீடுகள் முறையே சிவப்பு மற்றும் நீல வட்டங்களுடன் குறிக்கப்படுகின்றன.b ஸ்பைனி அல்லாத உயிரினங்களுடன் ஒப்பிடும்போது ஸ்பைனி கடல் குதிரைகளில் bmp3 இல் dN/dS மதிப்புகளின் விநியோகம்.c bmp3 ஆல் குறியிடப்பட்ட புரதத்திற்காக புனரமைக்கப்பட்ட பைலோஜெனடிக் மரத்தில் சுயாதீன பரிணாமம்.d ஹிப்போகாம்பஸ் எரெக்டஸில் பிஎம்பி3 இன் சிட்டு ஹைப்ரிடைசேஷனில் முழு-மவுண்ட்.

குறிப்பு

லி சி மற்றும் பலர்.மரபணு வரிசைகள் உலகளாவிய பரவல் வழிகளை வெளிப்படுத்துகின்றன மற்றும் கடல் குதிரை பரிணாம வளர்ச்சியில் ஒன்றிணைந்த மரபணு தழுவல்களை பரிந்துரைக்கின்றன.நாட் கம்யூ.2021 பிப்ரவரி 17;12(1):1094.

செய்திகள் மற்றும் சிறப்பம்சங்கள் சமீபத்திய வெற்றிகரமான நிகழ்வுகளை பயோமார்க்கர் டெக்னாலஜிஸுடன் பகிர்ந்து கொள்வதை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளது, புதிய அறிவியல் சாதனைகள் மற்றும் ஆய்வின் போது பயன்படுத்தப்பட்ட முக்கிய நுட்பங்களைக் கைப்பற்றுகிறது.


இடுகை நேரம்: ஜன-06-2022

உங்கள் செய்தியை எங்களுக்கு அனுப்பவும்: