மெட்டாஜெனோமிக் சீக்வென்சிங்-நானோபூர்
சேவை நன்மைகள்
● உயர்தர அசெம்பிளி-இனங்கள் அடையாளம் மற்றும் செயல்பாட்டு மரபணு கணிப்பு ஆகியவற்றின் துல்லியத்தை மேம்படுத்துதல்
● மூடிய பாக்டீரியா மரபணு தனிமைப்படுத்தல்
● பல்வேறு பகுதிகளில் மிகவும் சக்திவாய்ந்த மற்றும் நம்பகமான பயன்பாடு, எ.கா. நோய்க்கிருமி நுண்ணுயிரிகள் அல்லது ஆண்டிபயாடிக் எதிர்ப்பு தொடர்பான மரபணுக்களைக் கண்டறிதல்
● ஒப்பீட்டு மெட்டஜெனோம் பகுப்பாய்வு
சேவை விவரக்குறிப்புகள்
| நடைமேடை | வரிசைப்படுத்துதல் | பரிந்துரைக்கப்பட்ட தரவு | திரும்பும் நேரம் |
| நானோபூர் | ONT | 6 ஜி/10 ஜி | 65 வேலை நாட்கள் |
உயிர் தகவலியல் பகுப்பாய்வு
● மூல தரவு தரக் கட்டுப்பாடு
● மெட்டஜெனோம் அசெம்பிளி
● தேவையற்ற மரபணு தொகுப்பு மற்றும் சிறுகுறிப்பு
● இனங்கள் பன்முகத்தன்மை பகுப்பாய்வு
● மரபணு செயல்பாடு பன்முகத்தன்மை பகுப்பாய்வு
● குழுக்களுக்கு இடையேயான பகுப்பாய்வு
● சோதனை காரணிகளுக்கு எதிரான சங்க பகுப்பாய்வு
மாதிரி தேவைகள் மற்றும் விநியோகம்
மாதிரி தேவைகள் மற்றும் விநியோகம்
மாதிரி தேவைகள்:
க்குடிஎன்ஏ சாறுகள்:
| மாதிரி வகை | தொகை | செறிவு | தூய்மை |
| டிஎன்ஏ சாறுகள் | 1-1.5 μg | ＞ 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
சுற்றுச்சூழல் மாதிரிகளுக்கு:
| மாதிரி வகை | பரிந்துரைக்கப்பட்ட மாதிரி செயல்முறை |
| மண் | மாதிரி அளவு: தோராயமாக.5 கிராம்;மீதமுள்ள வாடிய பொருள் மேற்பரப்பில் இருந்து அகற்றப்பட வேண்டும்;பெரிய துண்டுகளை அரைத்து 2 மிமீ வடிகட்டி வழியாக செல்லுங்கள்;முன்பதிவு செய்ய மலட்டு EP-குழாய் அல்லது சைரோட்யூப்பில் உள்ள அலிகோட் மாதிரிகள். |
| மலம் | மாதிரி அளவு: தோராயமாக.5 கிராம்;முன்பதிவு செய்ய மலட்டு EP-குழாய் அல்லது கிரையோட்யூப்பில் அலிகோட் மாதிரிகளை சேகரித்து. |
| குடல் உள்ளடக்கங்கள் | அசெப்டிக் நிலையில் மாதிரிகள் செயலாக்கப்பட வேண்டும்.பிபிஎஸ் மூலம் சேகரிக்கப்பட்ட திசுக்களை கழுவவும்;PBS ஐ மையவிலக்கு செய்து EP-குழாய்களில் வீழ்படிவை சேகரிக்கவும். |
| சேறு | மாதிரி அளவு: தோராயமாக.5 கிராம்;முன்பதிவு செய்ய மலட்டு EP-குழாய் அல்லது கிரையோட்யூப்பில் அலிகோட் கசடு மாதிரியை சேகரித்து |
| நீர் நிலை | குழாய் நீர், கிணற்று நீர் போன்ற குறைந்த அளவு நுண்ணுயிர் உள்ள மாதிரிக்கு, குறைந்தபட்சம் 1 லிட்டர் தண்ணீரைச் சேகரித்து 0.22 மைக்ரான் வடிகட்டி வழியாகச் சென்று சவ்வில் உள்ள நுண்ணுயிரிகளை வளப்படுத்தவும்.மென்படலத்தை மலட்டுக் குழாயில் சேமிக்கவும். |
| தோல் | மலட்டுத்தன்மையற்ற பருத்தி துணியால் அல்லது அறுவைசிகிச்சை பிளேடால் தோலின் மேற்பரப்பை கவனமாக துடைத்து, அதை மலட்டுக் குழாயில் வைக்கவும். |
பரிந்துரைக்கப்பட்ட மாதிரி விநியோகம்
மாதிரிகளை திரவ நைட்ரஜனில் 3-4 மணி நேரம் உறைய வைத்து, திரவ நைட்ரஜனில் அல்லது -80 டிகிரி வரை நீண்ட கால இட ஒதுக்கீட்டில் சேமிக்கவும்.உலர்-பனியுடன் கூடிய மாதிரி கப்பல் தேவை.
சேவை வேலை ஓட்டம்
மாதிரி விநியோகம்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
1.ஹீட்மேப்: இனங்கள் செழுமை க்ளஸ்டரிங்
2.செயல்பாட்டு மரபணுக்கள் KEGG வளர்சிதை மாற்றப் பாதைகளில் குறிப்பிடப்பட்டுள்ளன
3.இனங்கள் தொடர்பு நெட்வொர்க்
4. CARD ஆண்டிபயாடிக் எதிர்ப்பு மரபணுக்களின் சர்கோஸ்
BMK வழக்கு
நானோபோர் மெட்டஜெனோமிக்ஸ் பாக்டீரியா குறைந்த சுவாச நோய்த்தொற்றின் விரைவான மருத்துவ நோயறிதலை செயல்படுத்துகிறது
வெளியிடப்பட்டது:நேச்சர் பயோடெக்னாலஜி, 2019
தொழில்நுட்ப சிறப்பம்சங்கள்
வரிசைமுறை: நானோபூர் மினியன்
மருத்துவ மெட்டஜெனோமிக்ஸ் உயிர் தகவலியல்: ஹோஸ்ட் டிஎன்ஏ குறைப்பு, WIMP மற்றும் ARMA பகுப்பாய்வு
விரைவான கண்டறிதல்: 6 மணிநேரம்
அதிக உணர்திறன்: 96.6%
முக்கிய முடிவுகள்
2006 ஆம் ஆண்டில், குறைந்த சுவாச நோய்த்தொற்று (LR) உலகளவில் 3 மில்லியன் மனித மரணத்தை ஏற்படுத்தியது.LR1 நோய்க்கிருமியைக் கண்டறிவதற்கான பொதுவான முறையானது சாகுபடி ஆகும், இது மோசமான உணர்திறன், நீண்ட நேரம் திரும்பும் மற்றும் ஆரம்பகால ஆண்டிபயாடிக் சிகிச்சையில் வழிகாட்டுதல் இல்லாதது.விரைவான மற்றும் துல்லியமான நுண்ணுயிர் கண்டறிதல் நீண்ட காலமாக அவசரத் தேவையாக உள்ளது.கிழக்கு ஆங்கிலியா பல்கலைக்கழகத்தைச் சேர்ந்த டாக்டர். ஜஸ்டின் மற்றும் அவரது கூட்டாளிகள் நோய்க்கிருமிகளைக் கண்டறிவதற்கான நானோபோர் அடிப்படையிலான மெட்டஜெனோமிக் முறையை வெற்றிகரமாக உருவாக்கினர்.அவர்களின் பணிப்பாய்வு படி, ஹோஸ்ட் டிஎன்ஏவில் 99.99% குறைக்கப்படலாம்.நோய்க்கிருமிகள் மற்றும் ஆண்டிபயாடிக் எதிர்ப்பு மரபணுக்களில் கண்டறிதல் 6 மணி நேரத்தில் முடிக்கப்படும்.
குறிப்பு
சரலம்பஸ், டி., கே, ஜிஎல், ரிச்சர்ட்சன், எச்., அய்டின், ஏ., & ஓ'கிரேடி, ஜே.(2019)நானோபோர் மெட்டஜெனோமிக்ஸ் பாக்டீரியா குறைந்த சுவாச நோய்த்தொற்றின் விரைவான மருத்துவ நோயறிதலை செயல்படுத்துகிறது.நேச்சர் பயோடெக்னாலஜி, 37(7), 1.
