RNA ndogo ni aina ya RNA fupi isiyo na misimbo yenye urefu wa wastani wa 18-30 nt, ikiwa ni pamoja na miRNA, siRNA na piRNA.RNA hizi ndogo zimeripotiwa kuhusika kwa kiasi kikubwa katika michakato mbalimbali ya kibiolojia kama vile uharibifu wa mRNA, uzuiaji wa tafsiri, uundaji wa heterokromatini, n.k. Uchambuzi wa mpangilio wa SmallRNA umetumika sana katika tafiti kuhusu ukuzaji wa wanyama/mimea, magonjwa, virusi, n.k. Ndogo ya RNA. jukwaa la uchambuzi wa mpangilio lina uchanganuzi wa kawaida na uchimbaji wa data wa hali ya juu.Kwa msingi wa data ya RNA-seq, uchanganuzi wa kawaida unaweza kufikia kitambulisho na ubashiri wa miRNA, utabiri wa jeni lengwa wa miRNA, ufafanuzi na uchanganuzi wa usemi.Uchanganuzi wa hali ya juu huwezesha utaftaji na uchimbaji wa miRNA uliobinafsishwa, utengenezaji wa mchoro wa Venn, miRNA na ujenzi wa mtandao wa jeni.
