-
Mpangilio wa Metatranscriptome
Mfuatano wa metatranscriptome hubainisha usemi wa jeni wa vijiumbe (eukarioti na prokariyoti) ndani ya mazingira ya asili (yaani udongo, maji, bahari, kinyesi, na utumbo.). Hasa, huduma hizi hukuruhusu kupata maelezo mafupi ya jeni ya jumuiya za viumbe vidogo, uchanganuzi wa kitaalamu. ya spishi, uchanganuzi wa uboreshaji wa utendaji wa jeni zilizoonyeshwa tofauti, na zaidi.
Jukwaa: Jukwaa la Illumina NovaSeq
-
Jenomu ya Kuvu
Biomarker Technologies hutoa uchunguzi wa jenomu, jenomu nzuri na jenomu kamili ya fangasi kulingana na lengo mahususi la utafiti.Mfuatano wa jenomu, unganisho na ufafanuzi wa utendaji unaweza kuafikiwa kwa kuchanganya mpangilio wa kizazi kijacho + Mfuatano wa kizazi cha tatu ili kufikia mkusanyiko wa kiwango cha juu wa jenomu.Teknolojia ya Hi-C pia inaweza kutumika kuwezesha mkusanyiko wa jenomu katika kiwango cha kromosomu.
Jukwaa:Muendelezo wa PacBio II
Nanopore PromethION P48
Jukwaa la Illumina NovaSeq
-
Vifaa vya zana
BMKCloud ni jukwaa linaloongoza la habari za kibiolojia linalotoa suluhisho la wakati mmoja kwa programu za jeni, ambalo linaaminiwa sana na watafiti katika nyanja mbalimbali ikiwa ni pamoja na matibabu, kilimo, mazingira, n.k. BMKCloud imejitolea kutoa huduma jumuishi, za kuaminika na za ufanisi ikiwa ni pamoja na majukwaa ya uchambuzi wa bioinformatic na zana. , rasilimali za kompyuta, hifadhidata ya umma, kozi za mtandaoni za kibayolojia, n.k. BMKCloud ina zana mbalimbali za kibayolojia zinazotumiwa mara kwa mara za kujumuisha maelezo ya jeni, zana za mageuzi za kijeni, ncRNA, udhibiti wa ubora wa data, kuunganisha, upatanishi, uchimbaji wa data, mabadiliko, takwimu, jenereta ya takwimu, mlolongo. uchambuzi, nk.
-
Bakteria Kamili Genome
Biomarker Technologies hutoa huduma ya mfuatano juu ya kuunda jenomu kamili ya bakteria na pengo sifuri.Mtiririko mkuu wa bakteria ujenzi kamili wa jenomu unajumuisha mpangilio wa kizazi cha tatu, kuunganisha, ufafanuzi wa utendaji na uchanganuzi wa hali ya juu wa kibayolojia unaotimiza malengo mahususi ya utafiti.Uchambuzi wa kina zaidi wa jenomu ya bakteria huwezesha kufichua taratibu za kimsingi zinazotokana na michakato yao ya kibayolojia, ambayo inaweza pia kutoa marejeleo muhimu kwa ajili ya tafiti za jeni katika spishi za juu za yukariyoti.
Jukwaa:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq Platform
Muendelezo wa PacBio II
-
RNA ndogo
RNA ndogo ni aina ya RNA fupi isiyo na misimbo yenye urefu wa wastani wa 18-30 nt, ikiwa ni pamoja na miRNA, siRNA na piRNA.RNA hizi ndogo zimeripotiwa kuhusika kwa kiasi kikubwa katika michakato mbalimbali ya kibiolojia kama vile uharibifu wa mRNA, uzuiaji wa tafsiri, uundaji wa heterokromatini, n.k. Uchambuzi wa mpangilio wa SmallRNA umetumika sana katika tafiti kuhusu ukuzaji wa wanyama/mimea, magonjwa, virusi, n.k. Ndogo ya RNA. jukwaa la uchambuzi wa mpangilio lina uchanganuzi wa kawaida na uchimbaji wa data wa hali ya juu.Kwa msingi wa data ya RNA-seq, uchanganuzi wa kawaida unaweza kufikia kitambulisho na ubashiri wa miRNA, utabiri wa jeni lengwa wa miRNA, ufafanuzi na uchanganuzi wa usemi.Uchanganuzi wa hali ya juu huwezesha utaftaji na uchimbaji wa miRNA uliobinafsishwa, utengenezaji wa mchoro wa Venn, miRNA na ujenzi wa mtandao wa jeni.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS ni jukwaa zima la uchanganuzi wa kupanga upya jenomu, ambalo limetengenezwa kwa msingi wa tajiriba katika Biomarker Technologies.Jukwaa hili la urahisi wa kutumia huruhusu uwasilishaji wa haraka wa utendakazi jumuishi wa uchanganuzi kwa kuweka tu vigezo vichache vya msingi, ambavyo vinatoshea data ya upangaji wa DNA inayozalishwa kutoka kwa jukwaa la Illumina na jukwaa la mpangilio la BGI.Mfumo huu umewekwa kwenye seva ya utendakazi wa hali ya juu, ambayo huwezesha uchanganuzi wa data wenye ufanisi zaidi katika muda mfupi sana.Uchimbaji data uliobinafsishwa unapatikana kwa msingi wa uchanganuzi wa kawaida, ikijumuisha hoja ya jeni iliyobadilishwa, muundo wa msingi wa PCR, n.k.
-
mRNA(Rejea)
Transcriptome ni kiungo kati ya taarifa za kijenetiki za jeni na proteome ya utendaji kazi wa kibiolojia.Udhibiti wa kiwango cha uandishi ndio njia muhimu zaidi na iliyosomwa sana ya udhibiti wa viumbe.Mfuatano wa nukuu unaweza kupanga nakala wakati wowote kwa wakati au chini ya hali yoyote, kwa azimio sahihi kwa nukleotidi moja. Inaweza kuakisi kwa kiwango kikubwa kiwango cha unukuzi wa jeni, kutambua wakati huo huo na kuhesabu nakala adimu na za kawaida, na kutoa maelezo ya muundo wa sampuli za nakala maalum.
Kwa sasa, teknolojia ya mpangilio wa nukuu imekuwa ikitumika sana katika agronomia, dawa na nyanja zingine za utafiti, ikijumuisha udhibiti wa ukuzaji wa wanyama na mimea, urekebishaji wa mazingira, mwingiliano wa kinga, ujanibishaji wa jeni, mabadiliko ya jeni na utambuzi wa tumor na ugonjwa wa kijeni.
-
Metagenomics (NGS)
Jukwaa hili la uchanganuzi limeundwa kwa uchanganuzi wa data ya shotgun kwa msingi wa uzoefu wa miaka.Inajumuisha utendakazi uliounganishwa unaojumuisha uchanganuzi mbalimbali wa metagenomics zinazohitajika kwa kawaida ikiwa ni pamoja na usindikaji wa data, tafiti za kiwango cha spishi, tafiti za kiwango cha utendaji wa jeni, uwekaji wa data kwenye metagenome, n.k. Zaidi ya hayo, zana za uchimbaji data zilizobinafsishwa zinapatikana wakati wa uchanganuzi wa kawaida, ikijumuisha swala la jeni na spishi. , mpangilio wa kigezo, utengenezaji wa takwimu za kibinafsi, n.k.
-
LncRNA
RNA ndefu zisizo na msimbo (lncRNA) ni aina ya nakala zenye urefu wa zaidi ya nt 200, ambazo haziwezi kuweka msimbo wa protini.Ushahidi limbikizi unapendekeza kuwa nyingi ya lncRNAs zina uwezekano mkubwa wa kufanya kazi.Teknolojia za upangaji matokeo ya hali ya juu na zana za kuchanganua habari za kibayolojia hutuwezesha kufichua mfuatano wa lncRNA na kuweka maelezo kwa ufanisi zaidi na kutuongoza kugundua lncRNA zilizo na kazi muhimu za udhibiti.BMKCloud inajivunia kuwapa wateja wetu jukwaa la uchambuzi wa mpangilio wa lncRNA ili kufikia uchanganuzi wa haraka, wa kutegemewa na rahisi wa lncRNA.
-
GWAS
Utafiti wa shirika pana la genome (GWAS) unalenga kutambua vibadala vya kijenetiki (genotype) vinavyohusishwa na sifa maalum (fenotipu).Tafiti za GWA huchunguza viashirio vya kijenetiki vinavyovuka jenomu nzima ya idadi kubwa ya watu na kutabiri uhusiano wa genotype-phenotype kwa uchanganuzi wa takwimu katika kiwango cha idadi ya watu.Ufuataji wa jenomu nzima unaweza kugundua aina zote za kijeni.Ikiunganishwa na data ya phenotypic, GWAS inaweza kuchakatwa ili kutambua SNPs zinazohusiana na phenotipi, QTL na jeni tegemezi, ambayo inaunga mkono kwa nguvu ufugaji wa kisasa wa wanyama/mimea.SLAF ni mkakati uliorahisishwa wa kupanga mpangilio wa jenomu, ambao hugundua vialama vilivyosambazwa kwa upana wa genome, SNP.SNP hizi, kama viashirio vya kijenetiki vya molekuli, vinaweza kuchakatwa kwa ajili ya tafiti zinazohusiana na sifa zinazolengwa.Ni mkakati wa gharama nafuu katika kutambua sifa changamano zinazohusiana na tofauti za kijeni.
-
Nanopore Nakala za urefu kamili
Isoforms mbadala tata na zinazobadilika katika viumbe ni njia muhimu za kijeni za kudhibiti usemi wa jeni na utofauti wa protini.Utambulisho sahihi wa miundo ya nakala ndio msingi wa uchunguzi wa kina wa mifumo ya udhibiti wa usemi wa jeni.Jukwaa la ufuataji la Nanopore limefaulu kuleta utafiti wa maandishi kwenye kiwango cha isoform.Jukwaa hili la uchanganuzi limeundwa kuchanganua data ya RNA-Seq inayotolewa kwenye jukwaa la Nanopore kwa misingi ya jenomu ya marejeleo, ambayo hufanikisha uchanganuzi wa ubora na kiasi katika kiwango cha jeni na kiwango cha nakala.
-
mduara-RNA
Mviringo RNA(circRNA) ni aina ya RNA isiyoweka misimbo, ambayo hivi majuzi ilionekana kuwa na jukumu muhimu katika mitandao ya udhibiti inayohusika katika kuendeleza, upinzani wa mazingira, nk. Tofauti na molekuli za mstari za RNA, kwa mfano mRNA, lncRNA, 3′ na 5′. ncha za circRNA zimeunganishwa pamoja na kuunda muundo wa duara, ambao huwaokoa kutoka kwa usagaji wa exonuclease na ni thabiti zaidi kuliko RNA nyingi za mstari.CircRNA imepatikana kuwa na utendaji tofauti katika kudhibiti usemi wa jeni.CircRNA inaweza kufanya kama ceRNA, ambayo hufunga miRNA kwa ushindani, inayojulikana kama sponji ya miRNA.Jukwaa la uchambuzi wa mpangilio wa CircRNA huwezesha muundo wa circRNA na uchanganuzi wa usemi, utabiri wa lengo na uchambuzi wa pamoja na aina zingine za molekuli za RNA.
