Ramani ya joto
Faili ya data ya Matrix hutumiwa kwa kuchora ramani ya joto, ambayo inaweza kuchuja, kurekebisha na kuunganisha data ya matrix.Inatumika zaidi kwa uchanganuzi wa nguzo wa kiwango cha usemi wa jeni kati ya sampuli tofauti.
Ufafanuzi wa Jeni
Ufafanuzi wa utendakazi wa jeni hufanywa kwa kupanga mpangilio katika faili ya FASTA dhidi ya hifadhidata mbalimbali.
Ufafanuzi wa Jeni
Zana ya Utaftaji ya Mipangilio ya Kienyeji ya Msingi
CDS_UTR_Utabiri
Zana hii imeundwa kutabiri maeneo ya usimbaji (CDS) na maeneo yasiyo ya usimbaji (UTR) katika mfuatano wa manukuu kulingana na ulipuaji dhidi ya hifadhidata ya protini inayojulikana na utabiri wa ORF.
Kiwanja cha Manhattan
Mpango wa Manhattan huwezesha kuonyesha data na idadi kubwa ya pointi za data.Inatumika sana katika masomo ya muungano wa jenomu kote (GWAS).
Circos
Mchoro wa CIRCOS huwezesha uwasilishaji wa moja kwa moja wa usambazaji wa SNP, InDeL, SV, CNV kwenye jenomu.
GO_Utajiri
TopGO ni zana iliyoundwa kwa uboreshaji wa kazi.Kifurushi cha TopGO-Bioconductor kina uchanganuzi wa usemi tofauti, uchanganuzi wa uboreshaji wa GO na taswira ya matokeo.Itazalisha folda yenye towe inayoitwa "Grafu", ambayo ina matokeo ya topGO_BP, topGO_CC na topGO_MF.
WGCNA
WGCNA ni njia inayotumika sana ya kuchimba data kwa kugundua moduli za usemi wa jeni.Inatumika kwa seti mbalimbali za data za usemi ikijumuisha data ya safu ndogo na data ya usemi wa jeni inayotokana na mpangilio wa kizazi kijacho.
InterProScan
Uchambuzi na uainishaji wa mlolongo wa protini ya InterPro
GO_KEGG_Enrichment
Zana hii imeundwa ili kuzalisha historia ya uboreshaji wa GO, histogram ya uboreshaji wa KEGG na njia ya uboreshaji ya KEGG kulingana na seti ya jeni iliyotolewa na ufafanuzi unaolingana.