● Eneo la Usimbaji la Protini Inayolengwa: kwa kunasa na kupanga eneo la usimbaji wa protini, hWES inatumika kufichua vibadala vinavyohusiana na muundo wa protini;
● Usahihi wa Juu: yenye kina cha juu cha mpangilio, hWES hurahisisha ugunduzi wa vibadala vya kawaida na vibadala adimu vyenye masafa ya chini ya 1%;
● Gharama Zinazofaa: hWES hutoa takriban 85% ya mabadiliko ya magonjwa ya binadamu kutoka 1% ya jenomu ya binadamu;
● Taratibu tano kali za QC zinazoshughulikia mchakato mzima kwa uhakika wa Q30>85%.
Jukwaa
| Maktaba
| Mkakati wa Kukamata Exon
| Pendekeza Mkakati wa Kuratibu
|
Jukwaa la Illumina NovaSeq
| PE150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 Paneli ya IDT xGen Exod Hyb V2 | 5 Gb 10 Gb |
Aina ya Sampuli
| Kiasi(Qubit®)
| Kiasi
| Kuzingatia
| Usafi(NanoDrop™) |
DNA ya Genomic
| ≥ 300 ng | ≥ 15 μL | ≥ 20 ng/μL | OD260/280=1.8-2.0 hakuna uharibifu, hakuna uchafuzi
|
Kwa shida za Mendelian / magonjwa adimu: kina cha mpangilio mzuri zaidi ya 50 ×
Kwa sampuli za tumor: kina cha mpangilio bora zaidi ya 100×
1.Takwimu za ulinganifu
Jedwali 1 Takwimu za matokeo ya ramani
Jedwali 2 Takwimu za kukamata exome
2.Kugundua Tofauti
Kielelezo cha 1 Takwimu za SNV na InDel
3.Uchambuzi wa hali ya juu
Kielelezo cha 2 njama ya Circos ya SNV na InDel hatari kwa upana wa Genome
Jedwali la 3 Uchunguzi wa jeni zinazosababisha magonjwa